Descripción del proyecto
LOS PROCESOS DE FOSFORILACION-DEFOSFORILACION PROTEICA JUEGAN UN PAPEL PRIMORDIAL EN PRACTICAMENTE TODOS LOS ASPECTOS DE LA FUNCION CELULAR, INCLUYENDO LA TRANSDUCCION DE SEÑAL, CICLO CELULAR Y APOPTOSIS, LA CARACTERIZACION DE LOS COMPONENTES DEL FOSFOPROTEOMA Y DE SUS PERFILES DE FOSFORILACION EN DIFERENTES CONDICIONES ES, EN CONSECUENCIA, DE VITAL IMPORTANCIA PARA LA COMPRENSION DE LOS MECANISMOS CELULARES IMPLICADOS EN LA ENFERMEDAD Y PARA EL DESARROLLO DE NUEVOS FARMACOS DIRIGIDOS A MODULAR LA ACTIVIDAD DE QUINASAS Y FOSFATASAS, EL NUMERO DE SUBSTRATOS IN VIVO CONOCIDOS DE ESTAS ENZIMAS ES, SIN EMBARGO, TODAVIA MUY REDUCIDO Y EN LOS ULTIMOS AÑOS SE ESTA REALIZANDO UN ESFUERZO IMPORTANTE PARA SU CARACTERIZACION,EN EL PROYECTO BIO2004-01788, NUESTRO GRUPO ABORDO EL ESTUDIO DEL FOSFOPROTEOMA DEL LINFOCITO T HUMANO, COMO MODELO DE INTERES EN EL ESTUDIO DE LA TRANSDUCCION DE SEÑAL Y DE LOS DESEQUILIBRIOS DE LA RESPUESTA INMUNE, CON OBJETO DE DEFINIR LOS SUBSTRATOS DE FOSFORILACION IN VIVO EN ESTAS CELULAS, HASTA HOY, HEMOS CARACTERIZADO 398 PUNTOS DE FOSFORILACION (P-SITES) EN UN TOTAL DE 342 FOSFOPEPTIDOS UNICOS CUYAS SECUENCIAS DEFINEN 1078 PROTEINAS, ALREDEDOR DE LA MITAD DE ESTOS P-SITES NO SE ENCUENTRAN ANOTADOS EN UNIPROT NI EXPERIMENTALMENTE NI POR SIMILITUD Y APROXIMADAMENTE EL 40% DE ESTOS NO ESTABAN DESCRITOS TAMPOCO EN PHOSPHOSITE (HTTP://WWW,PHOSPHOSITE,ORG), LA COLECCION DE DATOS DE FOSFORILACION MAS COMPLETA DISPONIBLE, SOLO UNO DE LOS PEPTIDOS YA DESCRITOS EN PHOSPHOSITE DERIVABA DE ESTUDIOS EN CELULAS T PRIMARIAS, LA BASE DE DATOS GENERADA DURANTE ESE PROYECTO ES LA UNICA DISPONIBLE HASTA EL MOMENTO EN LINFOCITOS T HUMANOS (HTTP://WWW,LYMPHOS,ORG),EN ESTE PROYECTO PROPONEMOS APROVECHAR LAS METODOLOGIAS PUESTAS A PUNTO EN EL PROYECTO ANTERIOR PARA ESTUDIAR MEDIANTE TECNICAS DE PROTEOMICA CUANTITATIVA EL FOSFOPROTEOMA DE LINFOCITOS T CD4+ Y CD8+, EN ESTADO DE REPOSO O ACTIVADOS, DE FORMA FISIOLOGICA O FARMACOLOGICA (ANTI-CD3/ANTI-CD28 Y PMA/IONOMICINA), CON OBJETO DE DEFINIR LOS SUBSTRATOS DE FOSFORILACION DURANTE LA RESPUESTA CELULAR Y DETERMINAR LOS PERFILES DE EXPRESION CARACTERISTICOS DE ESTAS VIAS DE ACTIVACION, LOS PERFILES DE FOSFORILACION GLOBAL PODRAN SER UTILIZADOS PARA LA CARACTERIZACION DE MARCADORES BIOLOGICOS DEL ESTADO CELULAR QUE PUDIERAN CONSTITUIR MARCADORES DE DIAGNOSTICO O PRONOSTICO EN SITUACIONES DE HIPERSENSIBILIDAD E INMUNODEPRESION, LA CARACTERIZACION DE LOS MOTIVOS DE FOSFORILACION PERMITIRA ASIMISMO DEFINIR POSIBLES QUINASAS DE RELEVANCIA FISIOLOGICA, ASI COMO LOS MECANISMOS RELACIONADOS CON LA REGULACION DE LA ACTIVIDAD PROTEICA, ESTA INFORMACION CONSTITUYE EL PRIMER PASO PARA EL DISEÑO DE NUEVAS TERAPIAS BASADAS EN FARMACOS REGULADORES DE LA ACTIVIDAD DE QUINASAS Y FOSFATASAS O DE OTRAS PROTEINAS SITUADAS EN PUNTOS CLAVES DE LAS VIAS AFECTADAS, FOSFOPROTEOMICA\LINFOCITOS T\ACTIVACION CELULAR\ESPECTROMETRIA DE MASAS\PROTEOMICA CUANTITATIVA\RESPUESTA INMUNE