Descripción del proyecto
EL FUNCIONAMIENTO CELULAR SE BASA EN LA ACTIVIDAD DE PROTEINAS Y COMPLEJOS PROTEICOS QUE ACTUAN DE FORMA COORDINADA PARA LLEVAR A CABO FUNCIONES MOLECULARES ESPECIFICAS, LA REGULACION DE ESTAS FUNCIONES ESTA PRINCIPALMENTE MEDIADA POR CAMBIOS EN LAS INTERACCIONES DE LAS PROTEINAS, EN SU ESTABILIDAD Y EN SU ACTIVIDAD, A TRAVES DE LA ACTUACION DE UNA AMPLIA GAMA DE MODIFICACIONES POST-TRADUCCIONALES (PTM), EN PROYECTOS PREVIOS NUESTRO LABORATORIO HA ABORDADO EL ESTUDIO DEL FOSFOPROTEOMA DEL LINFOCITO T PRIMARIO HUMANO, UN MODELO PARA EL ESTUDIO DE LA RESPUESTA INMUNE, Y HA DESARROLLADO UNA BASE DE DATOS PUBLICA CON MAS DE 6000 PUNTOS DE FOSFORILACION PARTE DE LOS CUALES SE HAN INCLUIDO YA EN LAS PRINCIPALES BASES DE DATOS INTERNACIONALES, EL ESTUDIO DEL FOSFOPROTEOMA HA SIDO POSIBLE GRACIAS AL DESARROLLO DE METODOS DE PURIFICACION QUE HAN PERMITIDO ENRIQUECER LAS MOLECULAS FOSFORILADAS PARA SU ANALISIS, RECIENTEMENTE, EL DESARROLLO DE ANTICUERPOS ESPECIFICOS HA PERMITIDO ABORDAR EL ANALISIS GLOBAL DE OTRAS MODIFICACIONES COMO LA ACETILACION Y LA UBIQUITINACION, A PESAR DEL NUMERO CRECIENTE DE DATOS SOBRE CADA UNA DE ESTAS MODIFICACIONES, EXISTE TODAVIA POCO CONOCIMIENTO DE COMO ESTOS PROCESOS DE MODIFICACION PROTEICA PUEDEN ACTUAR DE FORMA COMBINADA PARA AMPLIAR O MODULAR LA FUNCION PROTEICA Y CELULAR, EN ESTE PROYECTO PRETENDEMOS IMPLEMENTAR METODOLOGIAS PROTEOMICAS PARA LA CARACTERIZACION DE SECUENCIAS MODIFICADAS MEDIANTE FOSFORILACION Y UBIQUITINACION O ACETILACION QUE PUEDAN TENER RELEVANCIA EN EL DENOMINADO CROSS-TALKING EN CIS EN EL LINFOCITO PRIMARIO HUMANO, ACTUALMENTE NO EXISTEN ESTUDIOS SOBRE UBIQUITINACION O ACETILACION EN CELULAS PRIMARIAS HUMANAS, CON OBJETO DE FACILITAR EL TRABAJO PROPONEMOS LLEVAR A CABO ESTUDIOS CUALITATIVOS EN CELULAS JURKAT, MAS ASEQUIBLES, ADEMAS DE EN CELULAS T PRIMARIAS, UTILIZANDO APROXIMACIONES PROTEOMICAS SHOTGUN, EN UNA SEGUNDA ETAPA, LA DINAMICA DE MODIFICACION MULTIPLE DE LAS SECUENCIAS IDENTIFICADAS SE CUANTIFICARA DE FORMA ESPECIFICA MEDIANTE METODOS DE PSEUDO-MRM EN LINFOCITOS T PRIMARIOS EN ESTADO BASAL Y ACTIVADO, ESTE ESTUDIO PERMITIRA APORTAR DATOS UNICOS SOBRE ESTAS MODIFICACIONES EN EL LINFOCITO PRIMARIO Y SOBRE SU CONCURRENCIA EN LOS COMPONENTES DEL PROTEOMA,LA PROPUESTA PRETENDE ADEMAS CONTRIBUIR AL ESFUERZO INTERNACIONAL DE LA INICIATIVA DEL PROYECTO DEL PROTEOMA HUMANO, APORTANDO LA INFORMACION OBTENIDA A TRAVES DEL CONSORCIO ESPAÑOL PARA EL HPP, PROTEÓMICA\ ESPECTROMETRÍA DE MASAS\ PTM CROSS-TALK\ PTM\ FOSFORILACIÓN\ UBIQUITINACIÓN\ ACETILACIÓN\ PROYECTO DEL PROTEOMA HUMANO\ LINFOCITO T PRIMARIO