Descripción del proyecto
ESTE PROYECTO SE CENTRARA EN LA LINEA PRINCIPAL DE TRABAJO DEL LABORATORIO, LOS MECANISMOS DE REPLICACION DEL DNA VIRAL, DESDE UNA PERSPECTIVA TRANSVERSAL Y MULTIDISCIPLINAR, DE ESTE MODO, SEGUIREMOS CON LA CARACTERIZACION DEL SISTEMA DE REPLICACION DEL DNA DEL BACTERIOFAGO Ø29, UTILIZANDO APROXIMACIONES GENETICAS Y DE BIOLOGIA CELULAR PARA PROPORCIONAR NUEVOS DATOS PARA ENTENDER LA LOCALIZACION ESPACIOTEMPORAL DEL CICLO DE REPLICACION VIRAL EN EL CONTEXTO DE LAS CELULAS INFECTADAS DE BACILLUS SUBTILIS, ADEMAS, CONTINUAREMOS LOS ESTUDIOS ESTRUCTURA-FUNCION DE LA DNA POLIMERASA DE Ø29, HACIENDO HINCAPIE EN LA COORDINACION DE LA TRANSFERENCIA DEL EXTREMO DEL DNA ENTRE LOS SITIOS ACTIVOS DE POLIMERIZACION Y EXONUCLEOLISIS, TAMBIEN SE CARACTERIZARA UNA PUTATIVA NUEVA PROTEINA VIRAL DE UNION A DNA O RNA, POR OTRO LADO, EN LINEA CON NUESTROS RECIENTES ESFUERZOS, VAMOS A REFORZAR EL ESTUDIO DEL VIRUS TEMPERADO BAM35 COMO UN NUEVO MODELO DE TRABAJO PARA LA REPLICACION VIRAL, BAM35 ES EL VIRUS MODELO DE LOS TECTIVIRUS QUE INFECTAN BACTERIAS DEL GRUPO BACILLUS CEREUS SENSU LATTO, VAMOS A CARACTERIZAR EN MAS DETALLE EL MECANISMO DE REPLICACION DEL GENOMA INICIADO POR PROTEINA TERMINAL, CON ENFASIS EN LA CARACTERIZACION DE LAS PROTEINAS VIRALES DE UNION A DNA Y SU FUNCION EN LAS ETAPAS INICIALES DE LA REPLICACION DEL GENOMA VIRAL, ADEMAS, PARA PROFUNDIZAR EN LA EVOLUCION DE LOS MECANISMOS VIRALES DE REPLICACION DEL DNA, INICIAREMOS LA CARACTERIZACION DE UN NUEVO BETATECTIVIRUS, IGNIS, RELACIONADO CON BAM35, ASI COMO ESTUDIAR LA TERMOESTABILIDAD DE LA DNA POLIMERASA, ADICIONALMENTE, SIGUIENDO ESTOS Y ESTUDIOS PREVIOS SOBRE LAS DNA POLIMERASAS DE Ø29 Y BAM35, SE GENERARAN NUEVOS METODOS PARA MEJORAR EL RENDIMIENTO DE LA AMPLIFICACION DEL DNA PARA APLICACIONES BIOTECNOLOGICAS, EN PRIMER LUGAR, OBTENDREMOS NUEVAS VARIANTES DE FUSION DE LA DNA POLIMERASA DE Ø29, A PARTIR DE NUESTRAS RECIENTES PROTEINAS MODIFICADAS CON TERMOESTABILIDAD MEJORADA PARA AUMENTAR LA CAPACIDAD DE AMPLIFICACION DEL DNA A ALTAS TEMPERATURAS, ADICIONALMENTE, TAMBIEN DISEÑAREMOS VARIANTES DE LA DNA POLIMERASA DE BAM35 PARA MEJORAR EL RENDIMIENTO EN AMPLIFICACION DEL DNA, LO QUE PUEDE SER DE UTILIDAD CON MUESTRAS DE DNA DAÑADO, POR ULTIMO, LA AMPLIFICACION DEL DNA POR LAS DNA POLIMERASAS DE Ø29 Y BAM35 SILVESTRES Y PROTEINAS OBTENIDAS POR INGENIERIA GENETICA SERA EVALUADA, EN TERMINOS DE HOMOGENEIDAD DE AMPLIFICACION, MEDIANTE METODOS DE SECUENCIACION MASIVA DEL PRODUCTO DE AMPLIFICACION, DNA POLIMERASA\POLB\VIRUS\Ø29\TECTIVIRUS\AMPLIFICACIÓN DNA\TRANSLESIÓN