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BFU2014-52656-P

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REPLICACION INICIADA CON PROTEINA POR LAS DNA POLIMERASAS DE LOS BACTERIOFAGOS Ø...

REPLICACION INICIADA CON PROTEINA POR LAS DNA POLIMERASAS DE LOS BACTERIOFAGOS Ø29 Y BAM35 LOS OBJETIVOS PRINCIPALES DEL PROYECTO SON CONTINUAR CON EL ESTUDIO DE LA REPLICACION DEL DNA DEL FAGO Ø29 QUE SE INICIA CON PROTEINA, ASI COMO LAS APLICACIONES BIOTECNOLOGICAS DE LA DNA POLIMERASA DE Ø29 Y DEL SISTEMA DE REPLICAC... ver más

01/01/2014

CSIC

278K€

Presupuesto del proyecto: 278K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2014-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 278K€

Descripción del proyecto LOS OBJETIVOS PRINCIPALES DEL PROYECTO SON CONTINUAR CON EL ESTUDIO DE LA REPLICACION DEL DNA DEL FAGO Ø29 QUE SE INICIA CON PROTEINA, ASI COMO LAS APLICACIONES BIOTECNOLOGICAS DE LA DNA POLIMERASA DE Ø29 Y DEL SISTEMA DE REPLICACION DEL DNA DE Ø29, TAMBIEN ESTUDIAREMOS LA REPLICACION INICIADA CON PROTEINA DEL FAGO BAM35 EN SUS FASES LITICA Y LISOGENICA, ESTUDIAREMOS: 1, EL PAPEL DEL ASP121 DEL DOMINIO EXONUCLEASA DE LA DNA POLIMERASA DE Ø29 COMO HERRAMIENTA PARA LA SECUENCIACION DEL DNA DE NUEVA GENERACION (NGS), 2, CONSTRUIREMOS VARIANTES DE LA DNA POLIMERASA DE Ø29 EN RESIDUOS DEL SUBDOMINIO TPR2 ASI COMO MUTANTES BASADOS EN PREDICCIONES IN SILICO PARA OBTENER POLIMERASAS CON TERMORRESISTENCIA/TERMOACTIVIDAD MEJORADA, 3, CARACTERIZAREMOS DNA POLIMERASAS TERMALES QUE INICIAN CON PROTEINA OBTENIDAS DE METAGENOMAS DE CHIMENEAS HIDROTERMALES, 4, ESTUDIAREMOS LA CAPACIDAD DE SINTESIS TRANSLESION (TLS) DE LA DNA POLIMERASA DE Ø29, TANTO LA NATURAL COMO MUTANTES EN EL SUBDOMINIO TPR2, ASI COMO LA REPLICACION IN VIVO DEL DNA DE Ø29 EN CONDICIONES GENOTOXICAS, 5, SE OPTIMIZARA EL SISTEMA DE REPLICACION DE Ø29 PARA APLICACIONES BIOTECNOLOGICAS, SE REEMPLAZARA EL DOMINIO N-TERMINAL DE LA PROTEINA TERMINAL (TP) POR EL DOMINIO DE UNION DE GAL4 Y BUSCAREMOS SITIOS DE INSERCION PERMISIVOS EN LA TP PARA AÑADIR NUEVAS FUNCIONES, 6, SE ESTUDIARA EL POSIBLE PAPEL DEL DOMINIO N-TERMINAL DE LA TP EN EL ATRAPAMIENTO DEL DNA EN LAS ESPORAS UTILIZANDO TP-DNA Y DELTANTTP-DNA, 7, CONTINUAREMOS EL ESTUDIO DE LA LOCALIZACION NUCLEAR DE LAS TPS DE FAGOS EN CELULAS DE MAMIFEROS BUSCANDO POSIBLES PROTEINAS QUE INTERACCIONEN CON ELLAS, ASI COMO LA POSIBLE INTERACCION ENTRE LA TP DE Ø29 Y LAS IMPORTINAS DE MAMIFEROS, TAMBIEN MAPEAREMOS LA REGION DE LA TP DEL FAGO BAM35 REQUERIDA PARA LA LOCALIZACION NUCLEAR, 8, CONTINUAREMOS LA CARACTERIZACION DE LAS PROTEINAS DE UNION A DNA DE CADENA SIMPLE (SSBS) DE FAGOS, SE OBTENDRAN MUTANTES EN LA SSB DE Ø29 Y SE ESTUDIARA EL EFECTO DE LA SSB DE Ø29 EN LA ACTIVIDAD DE LA DNA POLIMERASA DE Ø29 A TEMPERATURA SUPERIOR A 45 °C, SE CARACTERIZARA LA PROTEINA SSB DE BAM35 Y SE ESTUDIARA SU LOCALIZACION SUBCELULAR, SE ANALIZARA UN POSIBLE PAPEL DE LAS SSB DE Ø29 Y BAM35 EN REGULACION DE LA TRANSCRIPCION, 9, SE ANALIZARA EL TRANSCRIPTOMA DE BACILLUS SUBTILIS SIN INFECTAR E INFECTADO CON Ø29 POR SECUENCIACION MASIVA DE RNA, 10, SE DETERMINARA LA PROCESIVIDAD Y CAPACIDAD DE DESPLAZAMIENTO DE CADENA DE LA DNA POLIMERASA DE BAM35, ASI COMO SU ACTIVIDAD EN AMPLIFICACION POR DESPLAZAMIENTO MULTIPLE (MDA), SE OBTENDRAN MUTANTES PUNTUALES Y DE DELECION EN LOS SUBDOMINIOS TPR2 Y THUMB PARA ESTUDIAR SU FUNCION, TAMBIEN SE ESTUDIARA LA CAPACIDAD DE LA DNA POLIMERASA DE BAM35 DE REALIZAR TLS, SE INTENTARA RESOLVER LA ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL DE LA POLIMERASA, SE ESTUDIARA EL PAPEL DE LA TP DE BAM35 EN LA REPLICACION DEL DNA IN VITRO, TAMBIEN SE DETERMINARA LA REGION DE UNION DE LA TP AL DNA POR MUTAGENESIS DE DELECION, ASI COMO SU LOCALIZACION SUBCELULAR EN BACILLUS THURINGIENSIS, ESTUDIAREMOS LA REPLICACION IN VIVO DEL DNA DE BAM35 EN CONDICIONES LITICAS Y LISOGENICAS, BACTERIÓFAGO Ø29\BACTERIÓFAGO BAM35\REPLICACIÓN INICIADA CON PROTEÍNA\DNA POLIMERASA\PROTEÍNA TERMINAL\TRANSLESIÓN

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