Descripción del proyecto
EN UN PROYECTO ANTERIOR, EL GRUPO DE LUIS BLANCO LLEVO A CABO EL DESCUBRIMIENTO Y CARACTERIZACION INICIAL DE LA PRIMPOL HUMANA, DEMOSTRANDO SU IMPORTANCIA DURANTE LA REPLICACION DEL DNA NUCLEAR Y MITOCONDRIAL, QUE SIRVIO PARA EL DESARROLLO UN NUEVO METODO DE AMPLIFICACION DE DNA, COMERCIALIZADO COMO TRUEPRIME, Y QUE ESTA BASADO EN PRIMPOL, PRIMPOL ALIVIA EL ESTRES REPLICATIVO APORTANDO UNA NUEVA SOLUCION PARA ESQUIVAR LESIONES EN EL DNA QUE APAREZCAN EN LA CADENA LEADER: SINTETIZAR UN NUEVO PRIMER POR DELANTE DE LAS LESIONES BLOQUEANTES, QUE PERMITA RE-ARRANCAR LA REPLICACION DEL DNA, EN ESTE SUPROYECTO UTILIZAREMOS UNA ESTRATEGIA DE ANALISIS ESTRUCTURA-FUNCION PARA EXPLORAR LA IMPORTANCIA DE: 1) EL SUBDOMINIO C-TERMINAL QUE CONTIENE UN ZN-FINGER, Y LOS RESIDUOS QUE ESTABILIZAN EL NUCLEOTIDO INICIADOR; 2) LOS RESIDUOS ESPECIFICOS IMPLICADOS EN SINTESIS A TRAVES DE LESIONES (TLS), YA SEAN AQUELLOS QUE PERMITEN LA LECTURA DE LA LESION, O EL REPOSICIONAMIENTO DEL EXTREMO DEL PRIMER TRAS LA LESION; 3) LAS INSERCIONES ESPECIFICAS PRESENTES EN EL CORE CATALITICO DE PRIMPOL, TODOS ESTOS ESTUDIOS IN VITRO SERAN COMPLEMENTADOS CON UNA ANALISIS IN VIVO DE LA FUNCION PRIMPOL, ASI COMO ESTUDIANDO SU FIDELIDAD DE SINTESIS, TAMBIEN EXPLORAREMOS EL EFECTO EN CATALISIS DE LA ADICION DE LA PROTEINA POLDIP2, EN SUS VARIANTES NUCLEAR Y MITOCONDRIAL, POLDIP2 PROPBABLEMENTE ACTUA COMO UNA PLATAFORMA DE INTERACCION QUE PERMITE LA INTERACCION CON OTRA POLIMERASAS COMO POL LAMBDA, TAMBIEN SE ABORDARA LA OBTENCION DE LA ESTRUCTURA 3D DE LA PRIMPOL EN MODO PRIMASA, UTILIZANDO PARA ELLO EL ORTOLOHGO MURINO, POR POSEER UN ACTIVIDAD PRIMASA MAS ROBUSTA Y UN DOMINIO ZN-FINGER MAS ESTABLE, ESTOS ESTUDIOS SE HARAN EN COLABORACION CON TAHIR TAHIROV (UNIVERSITY OF NEBRASKA MEDICAL CENTER, USA), QUIEN HA RESUELTO RECIENTEMENTE LA ESTRUCTURA DE LA PRIMASA HUMANA, TAMBIEN ESTUDIAREMOS EL IMPACTO DE LA INCORPORACION DE RIBONUCLEOTIDOS MEDIADA POR PRIMPOL DURANTE EL ESTRES REPLICATIVO ASOCIADO A LA REPLICACION DEL DNA MITOCONDRIAL, POR OTRA PARTE, LA DISPONIBILIDAD DE UN MODELO MURINO DE DEFICIENCIA QUE ES VIABLE NOS PERMITIRA EXPLORAR SI PRIMPOL LIMITA LA CANTIDAD DE DNA PARCIALMENTE-REPLICADO QUE ES TRANSMITIDO A LA CELULA HIJA, Y QUIZAS TAMBIEN EN EL PROCESAMIENTO Y REPARACION DE ESE DNA, OTRO OBJETIVO DEL SUBPROYECTO 1 ES LA CARACTERIZACION DE VARIANTES TUMORALES DE LA PRIMPOL HUMANA QUE PRESENTEN UNA ALTERADA ESPECIFICIDAD Y EFICIENCIA COMO PRIMASA, YA QUE PODRIAN TENER UN VALOR PRONOSTICO IN CANCER,EN COORDINACION CON JOSE F, RUIZ (SUBPROYECTO 2) LLEVAREMOS A CABO DOS OBJETIVOS ADICIONALES: (1) DEFINIREMOS Y CARACTERIZAREMOS MEDIANTE ANALISIS ENZIMATICOS Y ESTUDIOS IN VIVO, LOS PASOS INMEDIATAMENTE POSTERIORES A LA ACCION DE PRIMPOL COMO PRIMASA EN RESPUESTA AL ESTRES REPLICATIVO, EXPLORANDO SI LA POL LAMBDA ES UNA DE LAS POLIMERASAS TLS QUE OPERAN DURANTE EL RELLENO DEL GAP RESULTANTE, QUE CONTIENE LA LESION, Y SI POLDIP2 ES UN FACTOR ACCESORIO QUE FACILITA EL RECLUTAMIENTO DE POLIMERASAS ESPECIFICAS PARA ESA FUNCION, COMO POL LAMBDA ENTRE OTRAS; (2) CARACTERIZAREMOS LA REGULACION DE PRIMPOL POR SUMOILACION, DEMOSTRANDO EL IMPACTO DE ESA REGULACION TANTO IN VITRO COMO IN VIVO, EN CONCRETO, LA GENERACION DE MUTANTES DE PRIMPOL QUE NO PUEDAN SER SUMOILADOS PERMITIRA EXPLORAR ALTERACIONES EN LA RESPUESTA AL ESTRES REPLICATIVO, Y EN LA FORMACION Y POSTERIOR RESOLUCION DEL DNA PARCIALMENTE-REPLICADO, REPLICACIÓN\REPARACIÓN\POLIMERASA\PRIMASA\MUTAGÉNESIS\DAÑO\INESTABILIDAD\ESTRUCTURA-FUNCIÓN\CÁNCER