Descripción del proyecto
LOS PRINCIPALES OBJETIVOS DEL PROYECTO ESTAN ENFOCADOS EN EL ESTUDIO DEL MECANISMO DE REPARACION DEL DNA, MEDIANTE UN ESTUDIO AVANZADO, A NIVEL BIOQUIMICO, DE PROTEINAS DE REPARACION DE BACILLUS SUBTILIS ASI COMO DE UNA NUEVA DNA POLIMERASA DE REPARACION VIRAL, LOS OBJETIVOS PLANTEADOS EN ESTE PROYECTO, ASI COMO LOS RESULTADOS ESPERADOS SON: 1, DETERMINACION DEL PAPEL DE RESIDUOS ESPECIFICOS DEL DOMINIO PHP DE LA DNA POLIMERASA X DE B, SUBTILIS (POLXBS) EN LA ACTIVIDAD AP-ENDONUCLEASA INTRINSECA A ESTA PROTEINA, Y COMO SE COORDINAN LOS DOMINIO PHP Y DE POLIMERIZACION DURANTE EL PROCESAMIENTO DE SITIOS ABASICOS, 2, DETERMINACION DEL PAPEL DE RESIDUOS DE AMINOACIDO DEL CENTRO ACTIVO DE POLIMERIZACION IMPLICADOS EN LA INTERACCION CON EL NUCLEOTIDO ENTRANTE Y COMO ESTOS AFECTAN LA INSERCION DEL NUCLEOTIDO PROMUTAGENICO 8OXODGTP, 3, MEDIANTE CO-INMUNOPRECIPITACION SE INTENTARA IDENTIFICAR PROTEINAS DE B, SUBTILIS QUE INTERACCIONEN CON POLXBS, 4, LA RECIENTE SECUENCIACION DEL VIRUS PHAEOCYSTIS GLOBOSA HA PERMITIDO IDENTIFICAR POR PRIMERA VEZ LA EXISTENCIA DE UNA POLX QUE TIENE FUSIONADO EN EL EXTREMO C-TERMINAL UN DOMINIO HOMOLOGO A LAS DNA LIGASAS DEPENDIENTES DE NAD, ESTUDIAREMOS BIOQUIMICAMENTE DICHA PROTEINA Y COMO LAS POTENCIALES ACTIVIDADES DE POLIMERIZACION Y LIGASA SE COORDINAN FUNCIONALMENTE DURANTE LA REPARACION DE DNAS CON GAPS MEDIANTE LA RUTA DE REPARACION POR ESCISION DE BASES (BER), 5, CONTINUAREMOS CON EL ESTUDIO DEL SISTEMA DE REPARACION BACTERIANO DE LAS DOBLES ROTURAS DEL DNA UTILIZANDO COMO SISTEMA MODELO LAS PROTEINAS KU (BSUKU) Y LIGD (BSULIGD) DE B, SUBTILIS, ASI, ESTUDIAREMOS LA POTENCIAL ACTIVIDAD EN BSULIGD DE INCISION SOBRE SITIOS ABASICOS Y COMO LLEVA A CABO EL PROCESAMIENTO DE ESTOS TANTO DURANTE LA RUTA BER COMO EN NHEJ, 6, ESTUDIAREMOS LOS REQUERIMIENTOS A NIVEL DE SUSTRATOS DE LA ACTIVIDAD DNA LIGASA DE BSULIGD 7, ANALIZAREMOS LA POTENCIALIDAD DEL COMPLEJO BSUKU/BSULIGD PARA LLEVAR A CABO REACCIONES DE NHEJ IN VITRO EN AUSENCIA DE COMPLEMENTARIEDAD DE EXTREMOS, 8, INTENTAREMOS IDENTIFICAR PROTEINAS DE B, SUBTILIS QUE INTERACCIONEN CON BSUKU, DNA POLIMERASA\REPARACIÓN DEL DNA\BACILLUS SUBTILIS\POLX\KU\LIGD