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CTM2015-70340-R

Financiado
REGULACION DEL (META)GENOMA PROCARIOTICO DE UN AMBIENTE COSTERO MARINO: FACTORES...
REGULACION DEL (META)GENOMA PROCARIOTICO DE UN AMBIENTE COSTERO MARINO: FACTORES BIOLOGICOS Y OCEANOGRAFICOS QUE DETERMINAN LA PRESENCIA Y FUNCION BIOGEOQUIMICA DE PROCARIOTAS REMEI ES UN PROYECTO DISEÑADO PARA COMPRENDER EL POTENCIAL FUNCIONAL DE LAS COMUNIDADES MICROBIANAS Y LOS FACTORES QUE LO REGULAN, COMBINAREMOS (A) LA SECUENCIACION DEL CONTENIDO GENOMICO DE UNA COMUNIDAD PROCARIOTA COSTERA (METAG... REMEI ES UN PROYECTO DISEÑADO PARA COMPRENDER EL POTENCIAL FUNCIONAL DE LAS COMUNIDADES MICROBIANAS Y LOS FACTORES QUE LO REGULAN, COMBINAREMOS (A) LA SECUENCIACION DEL CONTENIDO GENOMICO DE UNA COMUNIDAD PROCARIOTA COSTERA (METAGENOMA, METAG) EN COORDINACION CON UNA DESCRIPCION DETALLADA DE LOS CICLOS BIOGEOQUIMICOS EN EL AMBIENTE DE ESTUDIO, Y (B) UNA SERIE DE EXPERIMENTOS DISEÑADOS PARA ENTENDER LOS FACTORES BIOLOGICOS QUE REGULAN LA PRESENCIA DE CADA FUNCION PROCARIOTA, EN (A) SE ESPERA ENTENDER CUALES SON LOS FACTORES OCEANOGRAFICOS Y DE ESTACIONALIDAD QUE REGULAN LA PRESENCIA DE LOS DIFERENTES GENES Y EN (B), CON LA ELIMINACION EXPERIMENTAL CONTROLADA DE LA PRESION DE DEPREDACION, LOS EFECTOS DE LOS VIRUS, O LA LIMITACION POR NUTRIENTES Y POR CARBONO, ESPERAMOS ENTENDER COMO ESTOS DIFERENTES FACTORES BIOLOGICOS CONTRIBUYEN A LA REGULACION, NUESTROS DATOS PROPORCIONARAN A) UN CATALOGO COMPLETO DE LOS GENES DEL OCEANO COSTERO EN EL MEDITERRANEO NOROCCIDENTAL (A AÑADIR A LOS ANALISIS DE UNA SOLA VEZ OBTENIDOS MEDIANTE INICIATIVAS COMO EL OCEAN SAMPLING DAY O TARAOCEANS, B) LA INFORMACION OBTENIDA EXPERIMENTALMENTE AYUDARA EN LA INTERPRETACION DE LOS NUMEROSOS OTROS ESTUDIOS PUBLICADOS RECIENTEMENTE DE METAGENOMAS MARINOS, O QUE ESTAN EN CURSO, Y QUE SON TRABAJOS PRIMORDIALMENTE DESCRIPTIVOS, NUESTRO OBJETIVO ES LA GENERACION DE UNA BASE DE DATOS DE LOS GENES ASOCIADOS A UNA LISTA DE ATRIBUTOS (POR EJEMPLO, UN GEN PUFM PARTICULAR APARECE EN ESTE MOMENTO PARTICULAR DEL AÑO Y CON ESTAS CONDICIONES OCEANICAS, Y SU APARICION ES REPRIMIDA, POR EJEMPLO, POR DEPREDADORES), ANALISIS FILOGENETICOS DE LAS MUESTRAS (DE LOS FRAGMENTOS DE 16S EXTRAIDOS DE LOS METAG) PODRIA PERMITIR LA ASOCIACION DE GENES FILOGENETICAMENTE NO INFORMATIVOS A LOS PROBABLES ORGANISMOS A LOS QUE PERTENECEN Y CON LOS ANALISIS DE METAG, EN TEORIA SIN SESGO, TENDREMOS LA OPORTUNIDAD DE ESTIMAR EL CRECIMIENTO VERDADERO Y LAS TASAS DE CRECIMIENTO BRUTAS DE PROCARIOTAS A NIVEL DE OTU, Y TAMBIEN DE GENES FUNCIONALES, SIN EMBARGO, TAMBIEN VAMOS A AISLAR PROCARIOTAS CON MEDIOS DE CULTIVO INNOVADORES QUE PODRIAN SERVIR COMO BASE PARA LA COMPRENSION DE LOS VINCULOS ENTRE LA FILOGENIA Y LA FUNCION Y TAMBIEN VAMOS A ANALIZAR ALGUNOS SCG (GENOMAS DE CELULAS INDIVIDUALES) DE ORGANISMOS SEPARADOS POR CITOMETRIA DE FLUJO, LAS FORTALEZAS Y ORIGINALIDAD DEL PROYECTO REMEI PROVIENEN DEL USO COMBINADO DE LOS METAGENOMAS DE REFERENCIA CON LA DESCRIPCION ESTACIONAL DE LOS PRINCIPALES CICLOS BIOGEOQUIMICOS; Y, SOBRE TODO, II) DEL USO DE MANIPULACIONES EXPERIMENTALES PARA DETERMINAR EL PAPEL DE LOS VIRUS, LOS DEPREDADORES Y LA LIMITACION DE NUTRIENTES SOBRE CADA UNA DE LAS UNIDADES TAXONOMICAS DE PROCARIOTAS PRESENTES EN LA COMUNIDAD (A TRAVES DE LOS MARCADORES DE 16S RDNA), Y PARA CADA UNO DE LOS GENES IDENTIFICADOS EN LA CONJUNTO DE LA COMUNIDAD, PROCARIOTAS\METAGENOMAS\OCEANO COSTERO\REGULACIÓN\"BOTTOM-UP"\"TOP-DOWN"\AISLADOS PROCARIOTAS\BIOGEOQUÍMICA ver más
01/01/2015
CSIC
219K€
Perfil tecnológico estimado

Línea de financiación: concedida

El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2015-01-01
Presupuesto El presupuesto total del proyecto asciende a 219K€
Líder del proyecto
AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.
Perfil tecnológico TRL 2-3 552M