Innovating Works

CTM2017-87736-R

Financiado
RECONSTRUCCION DE GENOMAS MICROBIANOS MARINOS MEDIANTE METAGENOMICA, GENOMICA DE...
RECONSTRUCCION DE GENOMAS MICROBIANOS MARINOS MEDIANTE METAGENOMICA, GENOMICA DE CELULAS INDIVIDUALES Y CULTIVOS LOS PROCARIOTAS (BACTERIAS Y ARQUEAS) SON UN COMPONENTE FUNDAMENTAL DE LA RED TROFICA DEL OCEANO, SIENDO RESPONSABLES DEL 30% DE LA PRODUCCION PRIMARIA Y GRAN PARTE DE LA RESPIRACION DEL OCEANO, LAS BACTERIAS MARINAS REPRESENTAN G... LOS PROCARIOTAS (BACTERIAS Y ARQUEAS) SON UN COMPONENTE FUNDAMENTAL DE LA RED TROFICA DEL OCEANO, SIENDO RESPONSABLES DEL 30% DE LA PRODUCCION PRIMARIA Y GRAN PARTE DE LA RESPIRACION DEL OCEANO, LAS BACTERIAS MARINAS REPRESENTAN GLOBALMENTE 10E29 CELULAS POR LO QUE REPRESENTAN UNA FRACCION MUY IMPORTANTE DENTRO DEL MUNDO MICROBIANO MARINO, SIN EMBARGO HASTA LA FECHA SOLO HAY DESCRITAS UNAS POCAS MILES DE ESPECIES A PESAR QUE SE ESTIMA QUE PUEDAN EXISTIR ALREDEDOR DE 10E11 ESPECIES DE PROCARIOTAS EN NUESTRO PLANETA, PARA PODER ENTENDER CUALES SON LAS ESPECIES DE PROCARIOTAS CLAVE EN EL FUNCIONAMIENTO DE LOS DISTINTOS CICLOS BIOGEOQUIMICOS MARINOS, ES IMPRESCINDIBLE ACCEDER A TODO EL ESPECTRO DE LA DIVERSIDAD MICROBIANA, PARA TAL FIN ES NECESARIO ANALIZAR LOS GENOMAS DE LOS PROCARIOTAS: (I) MUY ABUNDANTES CUYA MAYORIA ELUDEN EL AISLAMIENTO EN CULTIVO Y (II) AQUELLOS GENOMAS PRESENTES EN MUY POCO ABUNDANCIA QUE SE INCLUYEN EN LO QUE SE DENOMINA LA BIOSFERA RARA NORMALMENTE ACCESIBLES MEDIANTE AISLAMIENTO EN CULTIVO, POR ESTE MOTIVO, ES NECESARIO INTEGRAR DISTINTAS METODOLOGIAS TALES COMO: RECONSTRUCCION DE GENOMAS A PARTIR DE METAGENOMAS A LO QUE SE LLAMA MAGS, A PARTE MEDIANTE LA AMPLIFICACION DE GENOMAS INDIVIDUALES (SAGS) EXISTE LA POSIBILIDAD DE SEPARAR LAS CELULAS PROCARIOTAS MAS ABUNDANTES A NIVEL INDIVIDUAL MEDIANTE CITOMETRIA DE FLUJO DE ALTA RESOLUCION PARA SU POSTERIOR LISIS Y AMPLIFICACION DEL GENOMA ELUDIENDO EL AISLAMIENTO EN CULTIVO, FINALMENTE LA SECUENCIACION DE GENOMAS DE PROCARIOTAS AISLADOS EN CULTIVOS ES LA ESTRATEGIA PARA INVESTIGAR LA MAYORIA DE LOS MICROORGANISMOS DE LA BIOSFERA RARA, EL OBJETIVO PRINCIPAL DE ESTE PROYECTO ES RECONSTRUIR LOS GENOMAS PROCARIOTICOS DE DOS DE LOS ECOSISTEMAS MARINOS REMOTOS E INEXPLORADOS: EL ARTICO POLAR Y EL OCEANO PROFUNDO BATIPELAGICO UTILIZANDO TRES ENFOQUES COMPLEMENTARIOS: MAGS, SAGS Y GENOMAS BACTERIANOS CULTIVADOS, DE ESTA MANERA SE PRETENDE INVESTIGAR EL ESPECTRO COMPLETO DE LA DIVERSIDAD MICROBIANA PARA UNA MEJOR COMPRENSION DE LA ECOLOGIA, FUNCION Y EVOLUCION DE LOS PROCARIOTAS MARINOS, ESTE PROYECTO SE BENEFICIA MI PAPEL DE COORDINADORA EN VARIOS PROYECTOS DENTRO DE LAS EXPEDICIONES DE TARA OCEANS, TARA OCEANS POLAR ARCTIC Y MALASPINA Y, EN CONSECUENCIA, DE LA DISPONIBILIDAD DE UNOS 350 METAGENOMAS MARINOS (CON UN TOTAL DE APROXIMADAMENTE 2TB DE SECUENCIACION), LA INNOVACION DEL PRESENTE PROYECTO SE BASA EN LA BUSQUEDA DE ASOCIACIONES ESPECIFICAS DE LOS GENOMAS RECONSTRUIDOS MEDIANTE MAGS, SAGS Y GENOMAS DE CULTIVO CON VARIABLES ESPECIFICAS OCEANOGRAFICAS, AMBIENTALES O BIOLOGICOS PARA IDENTIFICAR CUALES SON LAS ESPECIES CLAVE EN EL POLO ARTICO Y EN EL BATIPELAGICO QUE SEAN FUNDAMENTALES PARA EL FUNCIONAMIENTO DE DICHOS ECOSISTEMA, CON LA RECONSTRUCCION DE ESTOS GENOMAS MICROBIANOS NO CULTIVADOS Y CULTIVADOS, ABORDARIAMOS LAS SIGUIENTES TAREAS ESPECIFICAS:• LA ESTRUCTURA DEL GENOMA Y MECANISMOS EVOLUTIVOS DENTRO DE LA MISMA ESPECIE (PANGENOME) COMPARANDO GENOMAS DE MAGS, SAGS Y AISLADOS DE TAXONES ESPECIFICOS,• DESCUBRIR NUEVOS PHYLA EN LOS OCEANOS PROFUNDOS MEDIANTE ANALISIS DE SAGS Y MAGS SIN CULTIVAR,• VINCULAR LOS PROCESOS MICROBIANOS Y LOS GENOMAS A LAS FLORACIONES DE FITOPLANCTON EN EL ARTICO POLAR A TRAVES DE LOS ANALISIS DE LOS MAGS Y LOS SAGS,LOS RESULTADOS DE ESTA PROPUESTA ARROJARAN LUZ SOBRE EL CONCEPTO DE ESPECIE BACTERIANA, LA BIOGEOGRAFIA, EL FUNCIONAMIENTO ECOLOGICO Y LOS MECANISMOS EVOLUTIVOS QUE IMPULSAN LA DIVERSIDAD BACTERIANA EN LOS OCEANOS, METAGENOMA\GENOMAS\SAGS\MAGS\AISLADOS\MICROORGANISMOS MARINOS\TARA OCEANS\TARA OCEANS POLAR CIRCLE\MALASPINA ver más
01/01/2017
CSIC
156K€
Perfil tecnológico estimado

Línea de financiación: concedida

El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2017-01-01
Presupuesto El presupuesto total del proyecto asciende a 156K€
Líder del proyecto
AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.
Perfil tecnológico TRL 2-3 552M