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CTM2010-20361

Financiado

ECOLOGIA DE LOS MICROORGANISMOS MARINOS A TRAVES DE LA GENOMICA AMBIENTAL Y FUNC...

EL OBJETIVO GENERAL DEL PRESENTE PROYECTO ES UTILIZAR EL ¿PODER DE LA GENOMICA¿ (EN EL SENTIDO DE VOLCKAERT Y COLS, 2008) PARA MEJORAR LA COMPRENSION DE LOS MICROORGANISMOS MARINOS, EN EL PRESENTE PROYECTO NOS PREPONEMOS EXPLORAR... ver más

01/01/2010

CSIC

385K€

Presupuesto del proyecto: 385K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2010-01-01

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Participantes

CSIC

Lider

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA...

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 385K€

Descripción del proyecto EL OBJETIVO GENERAL DEL PRESENTE PROYECTO ES UTILIZAR EL ¿PODER DE LA GENOMICA¿ (EN EL SENTIDO DE VOLCKAERT Y COLS, 2008) PARA MEJORAR LA COMPRENSION DE LOS MICROORGANISMOS MARINOS, EN EL PRESENTE PROYECTO NOS PREPONEMOS EXPLORAR Y EXTRAER TANTA INFORMACION COMO SEA POSIBLE DE UN CONJUNTO MUY GRANDE DE SECUENCIAS DE DNA Y RNA QUE ESTARAN A NUESTRA DISPOSICION DURANTE LOS PROXIMOS MESES, PROCEDENTES DEL OBSERVATORIO MICROBIANO DE LA BAHIA DE BLANES, DEL MAR MEDITERRANEO, Y DE OTROS OCEANOS, EL ANALISIS DE ESTAS SECUENCIAS SERA COMPLEMENTADO CON EXPERIMENTACION Y SECUENCIACION ADICIONAL, BUSCAREMOS INFORMACION RELEVANTE PARA EXPLICAR LA ECOLOGIA DE LOS MICROORGANISMOS MARINOS Y UTILIZAREMOS UNA AMPLIA GAMA DE ESTRATEGIAS PARA RECUPERAR INFORMACION GENETICA DE LA COMUNIDAD MICROBIANA MARINA:1, AISLAREMOS MICROORGANISMOS MEDIANTE SEPARACION DE CELULAS INDIVIDUALES POR CITOMETRIA Y SECUENCIAREMOS SUS GENOMAS, ESTO PROPORCIONARA ORGANISMOS MODELO PARA ESTUDIOS DE ECOFISIOLOGIA, 2, ESTUDIAREMOS LA DIVERSIDAD DEL BACTERIOPLANCTON MEDIANTE DOS APROXIMACIONES DISTINTAS: LA PIROSECUENCIACION 454 SE USARA PARA ANALIZAR LAS BACTERIAS MUY POCO ABUNDANTES Y LAS GENOTECAS DE FRAGMENTOS LARGOS DE DNA Y ARISA PARA LAS ABUNDANTES, 3, DISPONDREMOS DE UNA COLECCION MUY NUMEROSA DE SECUENCIAS DE METAGENOMICA Y METATRANSCRIPTOMICA PROCEDENTES DE BLANES Y DEL MEDITERRANEO GRACIAS A UN MUESTREO CONJUNTO CON EL INSTITUTO J,C, VENTER Y UTILIZAREMOS ESTAS SECUENCIAS PARA BUSCAR GENES FUNCIONALES ESPECIFICOS Y ANALIZAR DISTINTAS ADAPTACIONES DE LAS BACTERIAS MARINAS, 4, FINALMENTE UTILIZAREMOS UNA TECNICA DESARROLLADA EN LOS PROYECTOS ANTERIORES (ANALISIS DE LAS HUELLAS DACTILARES DEL TRANSCRIPTOMA) PARA BUSCAR PATRONES ESPACIALES Y TEMPORALES DE LA EXPRESION GENICA EN EL CAMPO, DEDICAREMOS UNA ATENCION ESPECIAL AL GRUPO DE LOS BACTEROIDETES, EL TERCERO EN ABUNDANCIA EN LOS OCEANOS (DESPUES DE LAS CYANOBACTERIA Y PROTEOBACTERIA), CONTINUANDO NUESTRO TRABAJO PREVIO CON LOS MIEMBROS DE ESTE GRUPO,

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