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BIO2008-02444

Financiado

METAGENOMICA Y DINAMICA DE LOS GENOMAS PROCARIOTICOS

LA EXPLORACION DE LA DIVERSIDAD MICROBIANA QUE EMPEZO A FINALES DEL PASADO SIGLO POR PCR Y SECUENCIACION DEL RNAR 16S CONTINUA EN LA ACTUALIDAD CON LA METAGENOMICA, ESTA APROXIMACION PERMITE SECUENCIAR GENES REPRESENTATIVOS DE HAB... ver más

01/01/2008

UMH

419K€

Presupuesto del proyecto: 419K€

Líder del proyecto

FUNDACIÓN UNIVERSITAS MIGUEL HERNANDEZ No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Sin perfil tecnológico

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2008-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

FUNDACIÓN UNIVERSITAS MIGUEL HERNANDEZ No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Sin perfil tecnológico

Presupuesto del proyecto 419K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto LA EXPLORACION DE LA DIVERSIDAD MICROBIANA QUE EMPEZO A FINALES DEL PASADO SIGLO POR PCR Y SECUENCIACION DEL RNAR 16S CONTINUA EN LA ACTUALIDAD CON LA METAGENOMICA, ESTA APROXIMACION PERMITE SECUENCIAR GENES REPRESENTATIVOS DE HABITATS DE INTERES, QUEREMOS CONTINUAR CON LA EXPLORACION METAGENOMICA DEL MAR MEDITERRANEO YA QUE PROPORCIONARA UN PATRIMONIO GENETICO EN FORMA DE LIBRERIAS METAGENOMICAS Y BASES DE DATOS DE VALOR INCALCULABLE, LAS CUALES PUEDEN EXPLOTARSE DURANTE MUCHOS AÑOS CON ESTUDIOS MAS ESPECIALIZADOS, ADEMAS, A LO LARGO DE ESTE PROYECTO NOS GUSTARIA INICIAR LA EXPLORACION DE AMBIENTES DE AGUA DULCE EMBLEMATICOS, CONCRETAMENTE, ZONAS AUN PRISTINAS DE LA CUENCA AMAZONICA Y EL LAGO BAIKAL EN RUSIA, PARA ELLO CONTAMOS CON LOS CONTACTOS NECESARIOS EN LOS PAISES IMPLICADOS (BRASIL Y RUSIA), PARA LA CONSECUCION DE NUESTROS OBJETIVOS, APLICAREMOS EN TODAS NUESTRAS LINEAS LA SECUENCIACION DE DNA DE ALTO RENDIMIENTO (O PIROSECUENCIACION) Y LA METAPROTEOMICA, ESTA ULTIMA A TRAVES DE COLABORACIONES INTERNACIONALES, PARA ENTENDER MEJOR EL FUNCIONAMIENTO DEL ECOSISTEMA, NOS CENTRAREMOS EN GENES CLAVE DE DIFERENTES RUTAS METABOLICAS, ADEMAS, ESTOS ESTUDIOS PUEDEN TENER VERTIENTES APLICADAS, PARA MENCIONAR ALGUNOS CASOS CONCRETOS, BASTE SEÑALAR LAS POSIBILIDADES DE ENCONTRAR NUEVOS COMPUESTOS BIOACTIVOS TALES COMO LOS DERIVADOS DE GENES CODIFICANTES DE POLIQUETIDO SINTASAS O SINTETASAS DE PEPTIDOS NO RIBOSOMICOS, TAMBIEN, LA POSIBILIDAD DE ENCONTRAR ENZIMAS DE INTERES INDUSTRIAL ES MUY ALTA, MUCHOS DE ESTOS GENES PUEDEN BUSCARSE DIRECTAMENTE POR LA SECUENCIA Y RESCATARSE DE LOS METAGENOMAS MEDIANTE BUSQUEDA REVERSA DE MARCADORES MOLECULARES, TAMBIEN ES IMPORTANTE EN LA VERTIENTE APLICADA LA BUSQUEDA DE GENES O MICROBIOS CON APLICACIONES EN ENERGIAS RENOVABLES, COMO SON LAS HIDROGENASAS, LOS GENOMAS PROCARIOTICOS SON ENTIDADES EXTRAORDINARIAMENTE PLASTICAS CON UN ENORME POTENCIAL DE CAMBIO, SE SABE DESDE HACE AÑOS QUE LOS GENOMAS DE BACTERIAS Y ARQUEAS VARIAN AMPLIAMENTE DENTRO DE LOS LIMITES DE UNA ESPECIE BIEN DEFINIDA, LO QUE HA LLEVADO AL CONCEPTO DEL "PAN-GENOMA" DE LA ESPECIE PARA REFERIRSE A EL GRAN RESERVORIO GENETICO PRESENTE EN DIFERENTES CEPAS O LINAJES, AL TENER ACCESO A CIENTOS DE GENOMAS DE AISLADOS INDIVIDUALES SE HA PODIDO OBTENER UNA INSTANTANEA DE COMO ES EL "PAN-GENOMA" ESTATICO DE UNA ESPECIE, YA HEMOS PARTICIPADO EN UN CASO MODELO DE GENOMICA COMPARADA AL ANALIZAR LOS GENOMAS DE DOS CEPAS DE ALTEROMONAS MALEODII, UN AISLADO DEL MEDITERRANEO PROFUNDO Y OTRO SUPERFICIAL, SIN EMBARGO, LA DINAMICA DE LOS PROCESOS QUE HAN ORIGINADO TAL DIVERSIDAD DE GENOMAS ES MAS DIFICIL DE ABORDAR, UNA APROXIMACION QUE ESTA ARROJANDO UNA INESPERADA LUZ SOBRE LA DINAMICA EVOLUTIVA DE LOS GENOMAS PROCARIOTICOS ES, DE NUEVO, LA METAGENOMICA, SECUENCIANDO EL DNA EXTRAIDO DIRECTAMENTE DE COMUNIDADES NATURALES (EN LUGAR DE CULTIVOS) INCLUSO CUANDO PROVIENEN DE UN SOLO PUNTO EN EL TIEMPO, SE OBTIENE EL EQUIVALENTE A UNA PELICULA EN LA QUE PUEDEN ANALIZARSE LAS ETAPAS QUE CONDUCEN DE UN LINAJE A OTRO, YA HEMOS DESARROLLADO ESTE TIPO DE ANALISIS AL COMPARAR EL GENOMA DE HALOQUADRATUM WALSBYI CON EL METAGENOMA DE SU HABITAT DE SALMUERA SATURADA, NOS PROPONEMOS DESARROLLAR MODELOS DE LA DINAMICA DE LOS GENOMAS PROCARIOTICOS MEDIANTE ESTUDIOS MAS PROFUNDOS DE GENOMICA COMPARADA Y METAGENOMICA DE UN SISTEMA MODELO DE MUY BAJA DIVERSIDAD QUE ES EL CRISTALIZADOR DE UNA SALINA SOLAR, Metagenómica\Genómica comparada\evolución\pan-genoma\oceano profundo\bacterias marinas\arquea\halófilo\fago\genómica de poblaciones

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