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PID2021-126114NB-C43

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CERRANDO EL CIRCULO: DE LOS CULTIVOS Y LA FUNCION A LOS GENOMAS Y METAGENOMAS Y...

CERRANDO EL CIRCULO: DE LOS CULTIVOS Y LA FUNCION A LOS GENOMAS Y METAGENOMAS Y DE VUELTA EN UN GRADIENTE DE SALINIDAD METACIRCLE ES UN PROYECTO COORDINADO MULTIDISCIPLINAR QUE PLANTEA NUEVAS CUESTIONES RELACIONADAS CON EL ORIGEN, ENSAMBLAJE, ADAPTACION Y EVOLUCION DE COMUNIDADES MICROBIANAS Y VIRALES EN ENTORNOS HIPERSALINOS. LOS CUATRO EQUIPOS D... ver más

01/01/2021

INSTITUTO NACIONAL...

231K€

Presupuesto del proyecto: 231K€

Líder del proyecto

INSTITUTO NACIONAL DE TECNICA AEROESPACIAL No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5 | 130K€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2021-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

INSTITUTO NACIONAL DE TECNICA AEROESPACIAL No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5 | 130K€

Presupuesto del proyecto 231K€

Descripción del proyecto METACIRCLE ES UN PROYECTO COORDINADO MULTIDISCIPLINAR QUE PLANTEA NUEVAS CUESTIONES RELACIONADAS CON EL ORIGEN, ENSAMBLAJE, ADAPTACION Y EVOLUCION DE COMUNIDADES MICROBIANAS Y VIRALES EN ENTORNOS HIPERSALINOS. LOS CUATRO EQUIPOS DE INVESTIGACION COMBINARAN SU AMPLIA EXPERIENCIA EN ECOLOGIA MOLECULAR, MICROBIOLOGIA MOLECULAR, VIROLOGIA Y BIOLOGIA COMPUTACIONAL PARA ABORDAR LAS PREGUNTAS PROPUESTAS. DE LAS CUATRO PRINCIPALES LINEAS DE INVESTIGACION (EJES) EN LAS QUE SE HA ARTICULADO ESTE PROYECTO, LA PRIMERA AFRONTARA ASPECTOS DE LA ECOLOGIA, ADAPTACION Y EVOLUCION MICROBIANA A TRAVES DE ENFOQUES METAGENOMICOS. EN CONCRETO, SE INVESTIGARA EL ORIGEN DE LAS COMUNIDADES MICROBIANAS Y VIRALES, SUS ADAPTACIONES A LOS CICLOS DE DIA-NOCHE, LA EVOLUCION DE COMUNIDADES ANTIGUAS, DE DONDE PROVIENE EL GENOMA ACCESORIO DE LOS MICROORGANISMOS, Y SI LOS VIRUS Y SUS HOSPEDADORES TIENEN LOS MISMOS PATRONES BIOGEOGRAFICOS. EL SEGUNDO EJE EXPLORARA LAS LIMITACIONES DE LOS METODOS METAGENOMICOS PARA CONOCER ESTAS COMUNIDADES, COMO EN QUE MEDIDA LOS MICROORGANISMOS AISLADOS REPRESENTAN A LAS POBLACIONES NATURALES, QUE VIRUS SON ECOLOGICAMENTE RELEVANTES Y COMO EVOLUCIONAN, EL USO DE NUCLEOTIDOS MODIFICADOS EN GENOMAS VIRALES COMO UNA ESTRATEGIA COMUN, Y LA PRESENCIA DE VIRUS ARN EN ESTAS COMUNIDADES. OTRAS CUESTIONES NO PUEDEN ABORDARSE A TRAVES DE LA METAGENOMICA Y CONSTITUYEN EL TERCER EJE DE ESTA PROPUESTA. POR EJEMPLO, PARA PROFUNDIZAR EN EL CONOCIMIENTO DE LAS ESTRATEGIAS MOLECULARES DE ADAPTACION A CONDICIONES EXTREMAS Y CAMBIANTES EN ESTOS SISTEMAS, COMO LA SALINIDAD, SE ESTUDIARA EL PAPEL DE LAS MODIFICACIONES DEL ARNT, LAS GLICOSILTRANSFERASAS Y LAS CAZYMES EN LA REGULACION DEL ESTRES OSMOTICO. ADEMAS, SE INVESTIGARAN LAS VESICULAS EXTRACELULARES QUE CONTIENEN ADN PRODUCIDAS POR HIPERHALOFILOS Y SU FUNCION BIOLOGICA. Y FINALMENTE, EL CUARTO EJE DE ESTE PROYECTO, EL MAS TRANSVERSAL, INCLUYE EL DESARROLLO DE HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS Y BASES DE DATOS PARA ABORDAR LA MAYORIA DE LAS PREGUNTAS PLANTEADAS ANTERIORMENTE, Y OTRAS PARA EXPLORAR CUALES SON LOS MODELOS EVOLUTIVOS QUE MEJOR ENCAJAN CON LOS DATOS REALES, COMO LAS CONDICIONES AMBIENTALES AFECTAN AL METABOLISMO, Y PARA IDENTIFICAR PARES VIRUS-HUESPED.DENTRO DEL PROYECTO COORDINADO, EL SUBPROYECTO 3 (IP: JOSE EDUARDO GONZALEZ PASTOR) SE CENTRARA EN LOS OBJETIVOS RELACIONADOS CON EL ESTUDIO DE LOS MECANISMOS MOLECULARES DE ADAPTACION Y RESISTENCIA Y DE PROCESOS DE TRANSFERENCIA GENICA HORIZONTAL EN MICROORGANISMOS HIPERHALOFILOS. ESPECIFICAMENTE, ESTAS SON LAS TAREAS QUE SE VAN A REALIZAR: ESTUDIAR LA FUNCION DE LAS MODIFICACIONES DEL ARNT EN BACTERIAS Y ARQUEAS EN RESISTENCIA A CONDICIONES EXTREMAS (PERCLORATO, RADIACION UV Y CAMBIOS EN SALINIDAD). CARACTERIZAR LAS VESICULAS EXTRACELULARES (VES) PRODUCIDAS POR LA ARQUEA HALOQUADRATUM WALSBYI Y OTROS MICROORGANISMOS HIPERHALOFILOS, Y ESTUDIAR SU FUNCION BIOLOGICA. EFECTO DE LOS CICLOS DE LUZ Y OSCURIDAD EN MICROORGANISMOS DE AMBIENTES HIPERSALINOS.PARA EL DESARROLLO DE ESTAS TAREAS SE EMPLEARAN DIFERENTES TECNICAS DE MICROBIOLOGIA, BIOLOGIA MOLECULAR, ECOLOGIA MOLECULAR (METAGENOMICA) Y BIOINFORMATICA. SE REALIZARAN EXPERIMENTOS CON CULTIVOS PUROS DE MICROORGANISMOS Y CON COMUNIDADES NATURALES DE HIPERHALOFILOS MANTENIDAS EN MICROCOSMOS. ETAGENOMICA\HALOVIRUS\HIPERSALINO\MODIFICACION DEL ARNT\BIOGEOGRAFIA\MICRODIVERSIDAD\HALOQUADRATUM\SALINIBACTER\INTERACCIONES VIRUS-HOSPEDADOR\EVOLUCION

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