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PID2021-126114NB-C41

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CERRANDO EL CIRCULO: DE LOS CULTIVO Y LA FUNCION A LOS GENOMAS Y METAGENOMAS Y D...

CERRANDO EL CIRCULO: DE LOS CULTIVO Y LA FUNCION A LOS GENOMAS Y METAGENOMAS Y DE VUELTA EN EL GRADIENTE DE SALINIDAD METACIRCLE ES UN PROYECTO COORDINADO MULTIDISCIPLINAR QUE PLANTEA NUEVAS CUESTIONES RELACIONADAS CON EL ORIGEN, ENSAMBLAJE, ADAPTACION Y EVOLUCION DE COMUNIDADES MICROBIANAS Y VIRALES EN ENTORNOS HIPERSALINOS. LOS CUATRO EQUIPOS D... ver más

01/01/2021

229K€

Presupuesto del proyecto: 229K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE ALICANTE No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 1051

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2021-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE ALICANTE No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 1051

Presupuesto del proyecto 229K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto METACIRCLE ES UN PROYECTO COORDINADO MULTIDISCIPLINAR QUE PLANTEA NUEVAS CUESTIONES RELACIONADAS CON EL ORIGEN, ENSAMBLAJE, ADAPTACION Y EVOLUCION DE COMUNIDADES MICROBIANAS Y VIRALES EN ENTORNOS HIPERSALINOS. LOS CUATRO EQUIPOS DE INVESTIGACION COMBINARAN SU AMPLIA EXPERIENCIA EN ECOLOGIA MOLECULAR, MICROBIOLOGIA MOLECULAR, VIROLOGIA Y BIOLOGIA COMPUTACIONAL PARA ABORDAR LAS PREGUNTAS PROPUESTAS. DE LAS CUATRO PRINCIPALES LINEAS DE INVESTIGACION (EJES) EN LAS QUE SE HA ARTICULADO ESTE PROYECTO, LA PRIMERA AFRONTARA ASPECTOS DE LA ECOLOGIA, ADAPTACION Y EVOLUCION MICROBIANA A TRAVES DE ENFOQUES METAGENOMICOS. EN CONCRETO, SE INVESTIGARA EL ORIGEN DE LAS COMUNIDADES MICROBIANAS Y VIRALES, SUS ADAPTACIONES A LOS CICLOS DE DIA-NOCHE, LA EVOLUCION DE COMUNIDADES ANTIGUAS, DE DONDE PROVIENE EL GENOMA ACCESORIO DE LOS MICROORGANISMOS, Y SI LOS VIRUS Y SUS HOSPEDADORES TIENEN LOS MISMOS PATRONES BIOGEOGRAFICOS. EL SEGUNDO EJE EXPLORARA LAS LIMITACIONES DE LOS METODOS METAGENOMICOS PARA CONOCER ESTAS COMUNIDADES, COMO EN QUE MEDIDA LOS MICROORGANISMOS AISLADOS REPRESENTAN A LAS POBLACIONES NATURALES, QUE VIRUS SON ECOLOGICAMENTE RELEVANTES Y COMO EVOLUCIONAN, EL USO DE NUCLEOTIDOS MODIFICADOS EN GENOMAS VIRALES COMO UNA ESTRATEGIA COMUN, Y LA PRESENCIA DE VIRUS ARN EN ESTAS COMUNIDADES. OTRAS CUESTIONES NO PUEDEN ABORDARSE A TRAVES DE LA METAGENOMICA Y CONSTITUYEN EL TERCER EJE DE ESTA PROPUESTA. POR EJEMPLO, PARA PROFUNDIZAR EN EL CONOCIMIENTO DE LAS ESTRATEGIAS MOLECULARES DE ADAPTACION A CONDICIONES EXTREMAS Y CAMBIANTES EN ESTOS SISTEMAS, COMO LA SALINIDAD, SE ESTUDIARA EL PAPEL DE LAS MODIFICACIONES DEL ARNT, LAS GLICOSILTRANSFERASAS Y LAS CAZYMES EN LA REGULACION DEL ESTRES OSMOTICO. ADEMAS, SE INVESTIGARAN LAS VESICULAS EXTRACELULARES QUE CONTIENEN ADN PRODUCIDAS POR HIPERHALOFILOS Y SU FUNCION BIOLOGICA. Y FINALMENTE, EL CUARTO EJE DE ESTE PROYECTO, EL MAS TRANSVERSAL, INCLUYE EL DESARROLLO DE HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS Y BASES DE DATOS PARA ABORDAR LA MAYORIA DE LAS PREGUNTAS PLANTEADAS ANTERIORMENTE, Y OTRAS PARA EXPLORAR CUALES SON LOS MODELOS EVOLUTIVOS QUE MEJOR ENCAJAN CON LOS DATOS REALES, COMO LAS CONDICIONES AMBIENTALES AFECTAN AL METABOLISMO, Y PARA IDENTIFICAR PARES VIRUS-HUESPED.EN EL MARCO DE METACIRCLE, EL SP1 ESTARA A CARGO DE LAS SIGUIENTES PREGUNTAS Y SUS TAREAS (T) CORRESPONDIENTES:- ¿VIRUS Y HOSPEDADORES TIENEN LOS MISMOS PATRONES BIOGEOGRAFICOS? TS: COMPARACION DE METAGENOMAS VIRICOS Y CELULARES. REDES DE INTERACCION VIRUS-HOSPEDADOR USANDO AISLADOS.- ¿COMO EVOLUCIONAN Y SE DIVERSIFICAN LAS COMUNIDADES DE LOS MANANTIALES SUBTERRANEOS? T: ESTUDIO DE VIRUS Y MICROBIOS DE ACUIFEROS ALICANTINOS.- ¿NOS FALTAN HALOFILOS? T: ESTUDIO DE HALOFILOS EN EL MICROBIOMA HUMANO.- ¿HASTA QUE PUNTO LOS AISLADOS REPRESENTAN POBLACIONES NATURALES DE BACTERIAS? TS: ESTUDIO DE LA DIVERSIDAD INTRAESPECIFICA DE VIBRIO SPP.- ¿QUE SIGNIFICA LA DIVERSIDAD VIRICA EXTRACELULAR? T: ¿QUE COMPONENTES DE LOS VIROMAS SON ACTIVOS Y COMO EVOLUCIONAN?- ¿QUE SE PIERDE EN LOS ESTUDIOS DE METAGENOMAS DE DNA VIRICOS)? TS: ESTUDIO DE VIROMAS DE RNA Y DE LA MODIFICACION DE NUCLEOTIDOS EN VIROMAS.- ¿CUAL ES EL PAPEL DE LAS CAZYMAS EN AMBIENTES HIPERSALINOS? TS: CARCATERIZACION DE CAZYMAS EN AMBIENTES HIPERSALINOS. ETAGENOMICA\HALOVIRUS\HIPERSALINO\MODIFICACIONES DE TRNAS\BIOGEOGRAFIA\MICRODIVERSIDAD\HALOQUADRATUM\SALINIBACTER\INTERACCIONES VIRUS-HOSPEDADOR\EVOLUCION

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