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PGC2018-096956-B-C44

Financiado
DESARROLLO DE ESTRATEGIAS -OMICAS PARA DESVELAR PANGENOMAS, COEVOLUCION VIRICA Y...
DESARROLLO DE ESTRATEGIAS -OMICAS PARA DESVELAR PANGENOMAS, COEVOLUCION VIRICA Y ADAPTACION A LOS EXTREMOS DE CONCENTRACION SALINA SP2 EL PRESENTE PROYECTO COORDINADO INCLUYE UN CONSORCIO FORMADO POR CUATRO GRUPOS DE INVESTIGACION, CON SUS RESPECTIVOS SUBPROYECTOS, QUE SE CENTRARA EN EL ESTUDIO DEL PANGENOMA DE LAS ESPECIES PROCARIOTAS, LA COEVOLUCION CON SUS VIR... EL PRESENTE PROYECTO COORDINADO INCLUYE UN CONSORCIO FORMADO POR CUATRO GRUPOS DE INVESTIGACION, CON SUS RESPECTIVOS SUBPROYECTOS, QUE SE CENTRARA EN EL ESTUDIO DEL PANGENOMA DE LAS ESPECIES PROCARIOTAS, LA COEVOLUCION CON SUS VIRUS Y LOS MECANISMOS DE ADAPTACION DE ESTAS A AMBIENTES QUE SE SITUAN EN LOS EXTREMOS DEL RANGO DE SALINIDAD (HIPERSALINOS Y OLIGOSALINOS) EMPLEANDO NUEVAS ESTRATEGIAS –OMICAS, LOS SISTEMAS A ANALIZAR SERAN AMBIENTES HIPERSALINOS CERCANOS A LA SATURACION DE SAL Y LAGOS SALADOS, Y AGUAS OLIGOTROFICAS DE CUEVAS, EL CONSORCIO ESTA CONSTITUIDO POR MICROBIOLOGOS, ECOLOGOS MICROBIANOS MOLECULARES, MATEMATICOS Y BIOINFORMATICOS, QUE DESARROLLARAN Y APLICARAN NUEVAS HERRAMIENTAS PARA CONTESTAR CUESTIONES COMO:­ ¿COMO SON LAS ESPECIES PROCARIOTICAS DESDE EL PUNTO DE VISTA DE SU CIRCUNSCRIPCION GENOMICA Y CUAL ES EL ALCANCE E IMPORTANCIA DE SU GENOMA ACCESORIO EN LOS PROCESOS DE ESPECIACION?­ ¿COMO EVOLUCIONAN LOS VIRUS EN LAS COMUNIDADES MICROBIANAS?­ ¿CUALES SON LOS LIMITES DE LA METAGENOMICA A LA HORA DE DETECTAR EVENTOS EVOLUTIVOS?­ ¿COMO EL CULTIVO SELECCIONA EL AISLAMIENTO DE DETERMINADOS MICROORGANISMOS Y SUS VIRUS?­ ¿COMO SE SELECCIONAN LAS COMUNIDADES MICROBIANAS POR EL EFECTO DE FACTORES BIOTICOS Y/O ABIOTICOS Y COMO RESPONDEN A LOS MISMOS? ¿CUAL ES EL IMPACTO DE LOS VIRUS EN EL PROCESO? ¿EXISTE ALGUN TIPO DE COMUNICACION EXTRACELULAR ENTRE VIRUS Y ENTRE VIRUS Y HOSPEDADORES?LAS TECNICAS A EMPLEAR EN EL PROYECTO ESTARAN DIRIGIDAS AL ANALISIS Y COMPARACION DE COMUNIDADES MICROBIANAS A NIVEL FILOGENETICO, Y TAMBIEN SE DESARROLLARAN HERRAMIENTAS QUE IMPLEMENTARAN LOS ESTUDIOS METAGENOMICOS, METAPROTEOMICOS, METABOLOMICOS Y DE CLASIFICACION IN SILICO DE VIRUS,DENTRO DEL PROYECTO COORDINADO, EL SUBPROYECTO 2, DIRIGIDO POR JOSEFA ANTON Y FERNANDO SANTOS, DEL GRUPO DE ECOLOGIA MICROBIANA MOLECULAR (EMM) DE LA UNIVERSIDAD DE ALICANTE, SE CENTRARA PRINCIPALMENTE, PERO NO DE MANERA EXCLUSIVA, EN AQUELLOS ASPECTOS RELACIONADOS CON LOS VIRUS,ESPECIFICAMENTE, LAS TAREAS QUE SERAN LLEVADAS A CABO EN EL SUBPROYECTO 2 SERAN:­ EL ANALISIS DE LAS COMUNIDADES VIRICAS PRESENTES EN LAS MUESTRAS NATURALES EMPLEADAS EN EL PROYECTO­ LOS EXPERIMENTOS ENCAMINADOS A ESTUDIAR LA EVOLUCION DE COMUNIDADES DE HALOVIRUS Y HALOVIRUS AISLADOS­ DETERMINAR CUALES SON LOS LIMITES DE LA METAGENOMICA A LA HORA DE DETECTAR CAMBIOS EVOLUTIVOS­ EXPLORAR EL EFECTO DE COMPUESTOS EXTRACELULARES EN LA COMUNICACION ENTRE VIRUS Y ENTRE ESTOS Y SUS HOSPEDADORES­ LA CONSTRUCCION DE METAGENOMAS DE POBLACIONES MICROBIANAS SELECCIONADAS MEDIANTE MICROFLUIDICA­ EL ESTUDIO DEL EFECTO DEL CULTIVO SOBRE EL CONTENIDO EN GC DE LOS AISLADOS OBTENIDOSPARA LA CONSECUCION DE ESTAS TAREAS SE EMPLEARAN APROXIMACIONES METAGENOMICAS, EXPERIMENTOS EN MESOCOSMOS, EXPERIMENTOS DE MICROFLUIDICA Y TECNICAS GENERALES DE ECOLOGIA MICROBIANA MOLECULAR, ASI COMO AQUELLAS HERRAMIENTAS DESARROLLADAS EN EL MARCO DEL PRESENTE PROYECTO PARA TAL FIN, METAGENÓMICA\TRANSFERENCIA GENÉTICA HORIZONTAL\INTERACCIONES VIRUS-HOSPEDADOR\EVOLUCIÓN\SALINIBACTER\PANGENOMA\MICRODIVERSIDAD\HIPERSALINO\DMS ver más
01/01/2018
UA
189K€
Perfil tecnológico estimado

Línea de financiación: concedida

El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2018-01-01
Presupuesto El presupuesto total del proyecto asciende a 189K€
Líder del proyecto
UNIVERSIDAD DE ALICANTE No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.
Total investigadores 1046