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PGC2018-096956-B-C42

Financiado
DESARROLLO DE ESTRATEGIAS -OMICAS PARA DESVELAR PANGENOMAS, COEVOLUCION VIRICA Y...
DESARROLLO DE ESTRATEGIAS -OMICAS PARA DESVELAR PANGENOMAS, COEVOLUCION VIRICA Y ADAPTACION A LOS EXTREMOS DE CONCENTRACION SALINA-SP3 EL PRESENTE PROYECTO COORDINADO INCLUYE UN CONSORCIO FORMADO POR CUATRO GRUPOS DE INVESTIGACION, CON SUS RESPECTIVOS SUBPROYECTOS, QUE SE CENTRARA EN EL ESTUDIO DEL PANGENOMA DE LAS ESPECIES PROCARIOTAS, LA COEVOLUCION CON SUS VIR... EL PRESENTE PROYECTO COORDINADO INCLUYE UN CONSORCIO FORMADO POR CUATRO GRUPOS DE INVESTIGACION, CON SUS RESPECTIVOS SUBPROYECTOS, QUE SE CENTRARA EN EL ESTUDIO DEL PANGENOMA DE LAS ESPECIES PROCARIOTAS, LA COEVOLUCION CON SUS VIRUS Y LOS MECANISMOS DE ADAPTACION DE ESTAS A AMBIENTES QUE SE SITUAN EN LOS EXTREMOS DEL RANGO DE SALINIDAD (HIPERSALINOS Y OLIGOSALINOS) EMPLEANDO NUEVAS ESTRATEGIAS“-OMICAS”, LOS SISTEMAS A ANALIZAR SERAN AMBIENTES HIPERSALINOS CERCANOS A LA SATURACION DE SAL Y LAGOS SALADOS, Y AGUAS OLIGOTROFICAS DE CUEVAS, EL CONSORCIO ESTA CONSTITUIDO POR MICROBIOLOGOS, ECOLOGOS MICROBIANOS MOLECULARES, MATEMATICOS Y BIOINFORMATICOS, QUE DESARROLLARAN Y APLICARAN NUEVAS HERRAMIENTAS PARA CONTESTAR CUESTIONES COMO:- ¿COMO SON LAS ESPECIES PROCARIOTICAS DESDE EL PUNTO DE VISTA DE SU CIRCUNSCRIPCION GENOMICA Y CUAL ES EL ALCANCE E IMPORTANCIA DE SU GENOMA ACCESORIO EN LOS PROCESOS DE ESPECIACION?- ¿COMO EVOLUCIONAN LOS VIRUS EN LAS COMUNIDADES MICROBIANAS?- ¿CUALES SON LOS LIMITES DE LA METAGENOMICA A LA HORA DE DETECTAR EVENTOS EVOLUTIVOS?- ¿COMO EL CULTIVO SELECCIONA EL AISLAMIENTO DE DETERMINADOS MICROORGANISMOS Y SUS VIRUS?- ¿COMO SE SELECCIONAN LAS COMUNIDADES MICROBIANAS POR EL EFECTO DE FACTORES BIOTICOS Y/O ABIOTICOS Y COMO RESPONDEN A LOS MISMOS?- ¿CUAL ES EL IMPACTO DE LOS VIRUS EN EL PROCESO? ¿EXISTE ALGUN TIPO DE COMUNICACION EXTRACELULAR ENTRE VIRUS Y ENTRE VIRUS Y HOSPEDADORES?LAS TECNICAS A EMPLEAR EN EL PROYECTO ESTARAN DIRIGIDAS AL ANALISIS Y COMPARACION DE COMUNIDADES MICROBIANAS A NIVEL FILOGENETICO, Y TAMBIEN SE DESARROLLARAN HERRAMIENTAS QUE IMPLEMENTARAN LOS ESTUDIOS METAGENOMICOS, METATRANSCRIPTOMICOS, METAPROTEOMICOS, METABOLOMICOS Y DE CLASIFICACION IN SILICO DE VIRUS,DENTRO DEL PROYECTO COORDINADO, EL SUBPROYECTO 3, DIRIGIDO POR JOSE EDUARDO GONZALEZ PASTOR, RESPONSABLE DEL LABORATORIO DE ADAPTACION MOLECULAR DEL CENTRO DE ASTROBIOLOGIA DE MADRID (“UNIDAD DE EXCELENCIA MARIA DE MAEZTU”), SE CENTRARA EN LOS OBJETIVOS RELACIONADOS CON EL ESTUDIO DE LOS MECANISMOS MOLECULARES DE ADAPTACION Y RESISTENCIA DE MICROORGANISMOS HIPERHALOLFILOS, ESPECIFICAMENTE, LAS TAREAS QUE SE REALIZARAN EN EL SUBPROYECTO 3 SERAN:- EXPLORAR LOS FENOMENOS DE TRANSFERENCIA GENICA HORIZONTAL Y SUS MECANISMOS EN COMUNIDADES DE HIPERHALOFILOS- COMPRENDER LOS MECANISMOS MOLECULARES DE ADAPTACION (RESISTENCIA) A PERCLORATO Y A RADIACION UV EN HIPERHALOFILOS,- ESTUDIAR EL EFECTO DE LOS CICLOS DE LUZ Y OSCURIDAD EN LA CAPACIDAD ADAPTATIVA (FITNESS) INDIVIDUAL Y COMPETITIVO DE LA BACTERIA HIPERHALOFILA SALINIBACTER RUBER,PARA EL DESARROLLO DE ESTAS TAREAS SE EMPLEARAN DIFERENTES TECNICAS: METAGENOMICA (SECUENCIA DE METAGENOMAS, METAGENOMICA FUNCIONAL Y RASTREO DE BIBLIOTECAS METAGENOMICAS EMPLEANDO MICROFLUIDICA) METATRANSCRIPTOMICA Y MICROBIOLOGIA MOLECULAR, SE REALIZARAN EXPERIMENTOS CON CULTIVOS PUROS DE MICROORGANISMOS Y EN MICROCOSMOS CON COMUNIDADES NATURALES DE HIPERHALOFILOS, RESISTENCIA A PERCLORATO\RESISTENCIA A RADIACIÓN UV\TRANSFERENCIA GÉNICA HORIZONTAL\CICLOS DE LUZ Y OSCURIDAD\HIPERHALÓFILOS\PANGENOME\METAGENÓMICA\METATRANSCRIPTÓMICA\METAVIROMAS\BIOINFORMÁTICA ver más
01/01/2018
CSIC
156K€
Perfil tecnológico estimado

Línea de financiación: concedida

El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2018-01-01
Presupuesto El presupuesto total del proyecto asciende a 156K€
Líder del proyecto
AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.
Perfil tecnológico TRL 2-3 552M