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SAF2015-68727-P

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MAPAS DE LAS INFECCIONES LATENTES DEL VIH

EL VIRUS DE LA INMUNODEFICIENCIA HUMANA (VIH) CAUSA EL SINDROME DE INMUNODEFICIENCIA ADQUIRIDA (SIDA), DURANTE LA INFECCION, EL VIH SE INTEGRA EN EL GENOMA DEL PORTADOR, QUEDANDO UNA FRACCION DE LOS VIRUS EN UN MODO DE INFECCION S... ver más

01/01/2015

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130K€

Presupuesto del proyecto: 130K€

Líder del proyecto

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TRL 4-5 | 50K€

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Líder del proyecto

FUNDACIO PRIVADA CENTRE DE REGULACIO GENOMICA Otras actividades deportivas asociacion

TRL 4-5 | 50K€

Presupuesto del proyecto 130K€

Descripción del proyecto EL VIRUS DE LA INMUNODEFICIENCIA HUMANA (VIH) CAUSA EL SINDROME DE INMUNODEFICIENCIA ADQUIRIDA (SIDA), DURANTE LA INFECCION, EL VIH SE INTEGRA EN EL GENOMA DEL PORTADOR, QUEDANDO UNA FRACCION DE LOS VIRUS EN UN MODO DE INFECCION SILENCIOSA LLAMADO LATENCIA, EN EL ESTADO DE LATENCIA, LA EXPRESION DEL VIRUS SE APAGA Y SE VUELVE INVISIBLE PARA EL SISTEMA INMUNE, SIN EMBARGO, EN CUALQUIER MOMENTO DE LA VIDA DEL PACIENTE, LOS VIRUS LATENTES PUEDEN REACTIVARSE Y COMENZAR UN NUEVO CICLO DE INFECCION, LA TERAPIA ANTIRRETROVIRAL ACTUAL ES CAPAZ DE EVITAR LA REPLICACION DEL VIH PERO NO ERRADICA LA INFECCION, SI SE INTERRUMPE EL TRATAMIENTO, EL VIH SE RECUPERA DE LOS RESERVORIOS LATENTES Y LOS SINTOMAS DEL SIDA REAPARECEN, PARA LOS PACIENTES, LA TERAPIA ES UNA CARGA PARA TODA LA VIDA, POR CONSIGUIENTE, LAS INFECCIONES LATENTES DEBEN SER ELIMINADAS PARA CURAR EL SIDA POR COMPLETO,LA ESTRATEGIA MAS PROMETEDORA PARA LOGRARLO SE LLAMA "SHOCK-AND-KILL", EL PRINCIPIO CONSISTE EN TRATAR LOS PACIENTES CON FARMACOS QUE REACTIVAN EL VIH LATENTE MIENTRAS SE MANTIENE LA TERAPIA ANTIRRETROVIRAL, DE ESTA MANERA, EL SISTEMA INMUNOLOGICO PUEDE DETECTAR LAS CELULAS INFECTADAS Y PURGAR LOS RESERVORIOS, EL EXITO DE ESTA ESTRATEGIA DEPENDE DE LOS FARMACOS UTILIZADOS PARA REACTIVAR EL VIH, SIN EMBARGO, LA BUSQUEDA DE ESTE TIPO DE MEDICAMENTOS ES UN PROCESO A CIEGAS PORQUE SE DESCONOCE COMO EL VIH SE HACE LATENTE, NOS PROPONEMOS INVESTIGAR LA RELACION ENTRE LA LATENCIA DEL VIH Y EL CONTEXTO LOCAL DE CROMATINA DE LA CELULA INFECTADA, NUESTRA HIPOTESIS SE BASA EN QUE EXISTEN CONTEXTOS GENOMICOS QUE SON FAVORABLES PARA LA INTEGRACION EN MODO LATENTE, NOS PROPONEMOS DESARROLLAR UNA TECNOLOGIA LLAMADA B-HIVE (BARCODE HIV ENSEMBLES) PARA IDENTIFICAR Y ESTUDIAR LAS INFECCIONES LATENTES DEL VIH, EL FUNDAMENTO DEL B-HIVE ES MAPEAR LAS INTEGRACIONES DEL PROVIRUS DE VIH EN UNA POBLACION DE CELULAS Y MEDIR LA EXPRESION DE CADA INTEGRACION EN UN SOLO EXPERIMENTO, LA IDEA CLAVE CONSISTE EN INSERTAR UN CODIGO DE BARRAS DE ADN, QUE ACTUA COMO UN IDENTIFICADOR UNICO DE CADA VIRUS, PARA PODER MONITORIZAR LA TRANSCRIPCION INDIVIDUAL DE TODOS LOS PROVIRUS, EN ESTE CONTEXTO, LAS INFECCIONES LATENTES CORRESPONDEN A LOS CODIGOS DE BARRAS QUE ESTAN PRESENTES EN EL ADN DE LA POBLACION Y PARA LOS CUALES NO EXISTE TRANSCRIPCION EN ARN,LA TECNOLOGIA B-HIVE NOS PERMITIRA IDENTIFICAR LOS CONTEXTOS GENOMICOS QUE PROMUEVEN LA LATENCIA, ADEMAS DE LOS MECANISMOS DE SILENCIAMIENTO CORRESPONDIENTES, TAMBIEN UTILIZAREMOS B-HIVE PARA COMPARAR LOS FARMACOS ANTI-LATENCIA, ESTUDIANDO CON PRECISION EL ESPECTRO DE INFECCIONES QUE CADA UNO ES CAPAZ DE REACTIVAR, POR ULTIMO, ESTABLECEREMOS LINEAS CELULARES INFECTADAS QUE ESPONTANEAMENTE ENTRAN Y SALEN DEL ESTADO LATENTE, ESTO NOS PERMITIRA IDENTIFICAR LAS DIFERENCIAS EN EL CONTEXTO GENETICO DEL PROVIRUS QUE EXISTEN ENTRE LOS ESTADOS DE ACTIVIDAD Y LATENCIA,ESTE TRABAJO TENDRA UN IMPACTO EN EL CAMPO DEL VIH, LA DISPONIBILIDAD DE LA TECNOLOGIA BHIVE AUMENTARA NUESTRO CONOCIMIENTO SOBRE LA LATENCIA DEL VIH Y FACILITARA LA BUSQUEDA DE FARMACOS ANTI-LATENCIA, LA DISPONIBILIDAD DE BASES DE DATOS PERMITIRA EL USO DE METODOS BIOINFORMATICOS PARA LOGRAR UNA CONTRIBUCION MAS SIGNIFICATIVA A LA INVESTIGACION SOBRE EL VIH, ESTE TRABAJO TAMBIEN SERA UN PUNTO DE REFERENCIA PARA LOS INVESTIGADORES EN EL CAMPO DE LA EPIGENETICA,YA QUE MOSTRARA UNA FORMA NOVEDOSA DE APLICAR LA INVESTIGACION SOBRE LA CROMATINA EN EL ESTUDIOD DE ENFERMEDADES VIRALES VIH\LATENCIA\CROMATINA\EFECTOS DE POSICIÓN

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