Descripción del proyecto
MUCHAS PROTEINAS RELACIONADAS CON LA SALUD ESTAN EQUIPADAS CON DOMINIOS DE BAJA COMPLEJIDAD (BC) PARA INTERCONVERTIRSE ENTRE FORMAS INTRINSECAMENTE DESORDENADAS Y FORMAS ENSAMBLADAS REVERSIBLEMENTE, TALES COMO CONDENSADOS BIOMOLECULARES Y AMILOIDES FISIOLOGICOS QUE PUEDEN EVOLUCIONAR A AGREGADOS PATOLOGICOS. ESTA AGREGACION ANORMAL E IRREVERSIBLE ESTA EN EL CORAZON DE LAS ENFERMEDADES NEURODEGENERATIVAS (EN), UN GRAN DESAFIO DE ESTA ERA MODERNA QUE CUESTA MILLONES DE EUROS Y PARA LA QUE NO EXISTEN CURA NI HERRAMIENTAS DE DIAGNOSTICO PRECOZ. ¿COMO SE CODIFICA LA AGREGACION DE TIPO AMILOIDE EN SECUENCIAS DE BAJA COMPLEJIDAD? LOS PREDICTORES CONVENCIONALES DE LA FORMACION DE AMILOIDE FALLAN CON SECUENCIAS BC. LA PROTEINA DE UNION AL ADN LLAMADA TDP-43, QUE CONTIENE UN DOMINIO DESORDENADO DE BAJA COMPLEJIDAD (BC), SURGIO COMO UN JUGADOR CRUCIAL EN LAS ND. LA RAZON ES QUE LOS AGREGADOS ANORMALES DE TDP-43 SE DAN EN VARIAS PATOLOGIAS GRAVES, TALES COMO LA ESCLEROSIS LATERAL AMIOTROFICA (ELA) O LA ENCEFALOPATIA POR TDP-43 RELACIONADA CON LA EDAD CON PREDOMINIO LIMBICO (DEMENCIA "LATE"). ADEMAS DE ESTOS AGREGADOS PATOLOGICOS E IRREVERSIBLES, QUE SE COMPORTAN COMO PRIONES (ESTRUCTURAS DISTINTAS EN DIFERENTES ENFERMEDADES), TDP-43 TAMBIEN FORMA AMILOIDES FISIOLOGICOS CON FUNCIONES VITALES EN LA PLASTICIDAD SINAPTICA, EN EL TRANSPORTE DE ARN O LA REGENERACION MUSCULAR. ESTO AGREGA URGENCIA PARA CREAR HERRAMIENTAS CONFIABLES QUE PUEDAN PREDECIR EL ENSAMBLAJE AMILOIDE EN SECUENCIAS DE BAJA COMPLEJIDAD (BC) Y QUE DIFERENCIEN ENTRE FORMAS FUNCIONALES Y PATOLOGICAS PARA BRINDAR HERRAMIENTAS DE DIAGNOSTICO APROPIADAS Y DISEÑAR INHIBIDORES QUE SE DIRIJAN A LA FORMA CORRECTA DE LA PROTEINA CORRECTA EN LA ENFERMEDAD ADECUADA.LAS DIVERSAS FORMAS AGREGADAS DE TIPO AMILOIDE ANTERIORES DE TDP-43 RESALTAN LA VERSATILIDAD DE UN DOMINIO DE BAJA COMPLEJIDAD EN LA ORQUESTACION DE DISTINTOS RESULTADOS BIOLOGICOS A TRAVES DE TRANSICIONES CONFORMACIONALES ENTRE ESTADOS DESORDENADOS Y ENSAMBLADOS. ADEMAS DE ESTA DICOTOMIA AMILOIDE FUNCIONAL - AMILOIDE PATOLOGICO, LAS PROPIEDADES OLIGOMERICAS DE LAS SECUENCIAS AMILOIDES CLASICAS SE HAN EXPLOTADO CON FINES BIOTECNOLOGICOS, QUE VAN DESDE LA PURIFICACION DE ANTICUERPOS HASTA EL DESARROLLO DE BIOSENSORES. POR LO TANTO, LA PREDICCION CONFIABLE DE LA FORMACION DE AMILOIDE POR SECUENCIAS DE BAJA COMPLEJIDAD TAMBIEN AFECTARA LAS APLICACIONES BIOTECNOLOGICAS MAS ALLA DEL PARADIGMA DE AMILOIDE "SALUD-ENFERMEDAD", POR EJEMPLO A TRAVES DE DISPOSITIVOS ENSAMBLADOS DE FORMA REVERSIBLE, LO QUE PERMITE UNA NUEVA ERA DE "BIOTECNOLOGIA AMILOIDE". ¿QUE NUEVAS OPORTUNIDADES Y VENTAJAS BIOTECNOLOGICAS PODRIAN TRAER LAS SECUENCIAS DE BAJA COMPLEJIDAD CON RESPECTO A LOS AMILOIDES CLASICOS? ¿QUE FACTORES CONTROLAN LAS TRANSICIONES CONFORMACIONALES Y LOS EQUILIBRIOS ENTRE DOMINIOS DESORDENADOS DE BAJA COMPLEJIDAD Y SUS FORMAS AGREGADAS? ¿QUE IMPULSA LA FORMACION PREFERENCIAL DE UNA ESTRUCTURA AGREGADA SOBRE OTRAS? ¿QUE CARACTERISTICAS ESTRUCTURALES, TERMODINAMICAS O CINETICAS HACEN QUE LOS AGREGADOS FUNCIONALES SEAN SUSCEPTIBLES DE UN CONTROL ESTRICTO "IN VIVO", Y COMO SE PUEDEN RECLUTAR ESTAS CARACTERISTICAS "IN VITRO"? PARA DAR RESPUESTAS PRACTICAS, ESTE PROYECTO SE CENTRARA EN TDP-43, PERO SU OBJETIVO ES CREAR PUNTOS DE APOYO FIRMES PARA COMPRENDER LA FORMACION DE AMILOIDE POR SECUENCIAS BC AMPLIAMENTE, MEDIANTE EL DESARROLLO DE NUEVOS METODOS ESPECTROSCOPICOS Y COMPUTACIONALES DE RESONANCIA MAGNETICA NUCLEAR. DP-43\PROTEINAS\BIOFISICA\DINAMICA MOLECULAR\AMILOIDES\RMN\RESONANCIA MAGNETICA NUCLEAR