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SAF2009-10403

Financiado
ESTUDIO DINAMICO DE QUASISPECIES DE VHC POR PIROSECUENCIACION EN FASE AGUDA Y CR...
ESTUDIO DINAMICO DE QUASISPECIES DE VHC POR PIROSECUENCIACION EN FASE AGUDA Y CRONICA DURANTE TRATAMIENTO ANTIVIRAL EL VIRUS DE LA HEPATITIS C (VHC) PRESENTA UNA ESTRUCTURA EN QUASISPECIES, NUMEROSAS INVESTIGACIONES HAN TRATADO DE CORRELACIONAR EL GRADO DE HETEROGENEIDAD DE LA POBLACION VIRAL CIRCULANTE Y/O INTRAHEPATICA CON DIFERENTES SITUACIO... EL VIRUS DE LA HEPATITIS C (VHC) PRESENTA UNA ESTRUCTURA EN QUASISPECIES, NUMEROSAS INVESTIGACIONES HAN TRATADO DE CORRELACIONAR EL GRADO DE HETEROGENEIDAD DE LA POBLACION VIRAL CIRCULANTE Y/O INTRAHEPATICA CON DIFERENTES SITUACIONES CLINICAS TALES COMO EVOLUCION DE LA INFECCION AGUDA HACIA, O BIEN CURACION O BIEN INFECCION CRONICA, CIRROSIS Y/O HEPATOCARCINOMA; LA RELACION ENTRE COMPLEJIDAD DEL INOCULO VIRAL DURANTE TRANSMISION DE PEQUEÑA CANTIDAD DE VIRUS O CUELLO DE BOTELLA GENETICO COMPARADO CON TRANSMISION MASIVA Y LA RESPUESTA AL TRATAMIENTO ANTIVIRAL, EL COMPORTAMIENTO DE LOS COMPONENTES MINORITARIOS DE LA QUASIESPECIES VIRAL EN EL INDIVIDUO INFECTADO PUEDE DIFERIR DEL/DE LOS COMPONENTES MAYORITARIOS, PUDIENDO AFECTAR FUNCIONES IMPORTANTES TANTO EN LA BIOLOGIA VIRAL COMO EN LA RELACION DEL VIRUS CON EL HUESPED, INCLUYENDO CAPACIDAD REPLICATIVA, EVASION DE LA RESPUESTA INMUNE, SEVERIDAD DE LA INFECCION, FALLO DEL TRATAMIENTO ANTIVIRAL,EL ESTUDIO DE UN NUMERO LIMITADO DE GENOMAS QUE HASTA LA FECHA HAN PODIDO SECUENCIARSE (TOTAL O PARCIALMENTE) A PARTIR DE MUESTRAS DE PACIENTES CON LAS TECNICAS CLASICAS DE CLONACION-SECUENCIACION CONSTITUYE UNA SEVERA LIMITACION PARA: (I) CARACTERIZAR LA NATURALEZA Y NUMERO DE VARIANTES PRESENTES EN UNA MUESTRA VIRAL, DE FORMA PRECISA; (II) PLANIFICAR UN TRATAMIENTO COMBINADO, DE ACUERDO CON LA COMPLEJIDAD DE LA QUASIESPECIES Y LA PRESENCIA DE MUTANTES DE RESISTENCIA A FARMACOS, TANTO EN PACIENTES PREVIAMENTE NO TRATADOS (NAIVE), COMO EN PACIENTES NO RESPONDEDORES A TRATAMIENTOS PREVIOS, INCLUYENDO AQUELLOS CON NULA RESPUESTA AL PEG-IFN (Y, POR TANTO, CON MAYOR RIESGO DE SELECCIONAR MUTANTES RESISTENTES); (III) DESVELAR FACTORES DESCONOCIDOS QUE PUDIERAN INTERFERIR LA RESPUESTA A LOS NUEVOS FARMACOS, Y QUE PODRIAN OCULTARSE EN MUTANTES MINORITARIOS (<1% DEL TOTAL) DENTRO DE UNA POBLACION VIRAL MUY COMPLEJA; (IV) IDENTIFICAR POSICIONES ALTAMENTE CONSERVADAS QUE PUEDAN TENER UNA FUNCION ESENCIAL PARA EL VIRUS Y PUEDAN SER USADAS COMO DIANA TERAPEUTICA, EL SISTEMA DE SECUENCIACION DE ALTO RENDIMIENTO MEDIANTE PIROSECUENCIACION (GS-FLX) SE HA PROPUESTO COMO UN METODO EFICAZ PARA ESTUDIAR LA COMPLEJIDAD DE LA CUASISPECIES VIRAL EN PROFUNDIDAD PUESTO QUE PERMITE EL ANALISIS RAPIDO Y MASIVO EN PARALELO DE CENTENARES DE MILES DE SECUENCIAS, NUESTRO CENTRO DISPONE DE LA PLATAFORMA GS-FLX Y SOPORTE TECNICO Y BIOINFORMATICO ESPECIALIZADO PARA EL EXITO DEL PRESENTE TRABAJO,OBJETIVOS:1,- ESTUDIAR LA EVOLUCION DE LA QUASISPECIES DE PACIENTES EN MUESTRAS SECUENCIALES DESDE FASE AGUDA A CRONICIDAD, CIRROSIS Y/O HEPATOCARCINOMA COMPARADO CON PACIENTES CURADOS,2,- COMPARAR COMPLEJIDAD Y COMPOSICION DE LA QUASISPECIES DE PACIENTES INFECTADOS MEDIANTE TRANSMISION MASIVA DE VIRUS (TRASPLANTE, TRANSFUSION), CON TRANSMISION DE PEQUEÑA CANTIDAD DE VIRUS (VIA SEXUAL, ALGUNOS CASOS DE TRANSMISION NOSOCOMIAL),3,- ESTUDIO DE COMPLEJIDAD DE LA QUASISPECIES ASOCIADO CON EL TIPOS DE RESPUESTA AL TRATAMINETO COMBINADO CON INTERFERON PEGILADO (PEG-IFN) MAS RIBAVIRINA (RBV),4,- DETECCION DE MUTANTES DE RESISTENCIA A INHIBIDORES DE LA REGION NS3 PROTEASA Y NS5B RNA POLIMERASA RNA DEPENDIENTE DEL VHC EN PACIENTES CRONICOS ANTES DEL TRATAMIENTO CON EL FIN DE ESTABLECER POSIBLES ESTRATEGIAS DE PERSONALIZACION DE TERAPIAS DIRIGIDAS A DICHOS PACIENTES,5,- DETECCION DE POSICIONES ALTAMENTE CONSERVADAS COMO POSIBLES DIANAS PARA FUTURAS TERAPIAS ANTIVIRALES, VIRUS HEPATITIS C\PIROSECUENCIACION\TRATAMIENTO ver más
01/01/2009
FUNDACIO HOSPITAL...
121K€
Perfil tecnológico estimado

Línea de financiación: concedida

El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2009-01-01
Presupuesto El presupuesto total del proyecto asciende a 121K€
Líder del proyecto
FUNDACIO HOSPITAL UNIVERSITARI VALL HEBRON -... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.
Perfil tecnológico TRL 4-5 33M