Descripción del proyecto
LA NATURALEZA PROPENSA A ERRORES DE LAS ARN POLIMERASAS DEPENDIENTES DE ARN CODIFICADAS POR LOS VIRUS, EN COMBINACION CON SUS CORTOS TIEMPOS DE GENERACION Y GRANDES TAMAÑOS POBLACIONALES GENERAN UNA ENORME HETEROGENEIDAD GENETICA Y ANTIGENICA DENTRO DE LAS POBLACIONES DE VIRUS DE ARN, LA PROGRESION DE LA ENFERMEDAD, LA PERSISTENCIA VIRAL, LA APARICION DE NUEVOS VIRUS O VARIANTES, Y LA EFICIENCIA DE LOS TRATAMIENTOS ANTIVIRALES ESTAN TODOS INFLUENCIADOS POR LA HETEROGENEIDAD DE ESTE ENJAMBRE DE MUTANTE, PARA LOS VIRUS, LA CELULA ES LA UNIDAD FUNDAMENTAL Y MINIMA DE INFECCION, FENOMENOS MACROSCOPICOS IMPORTANTES DURANTE EL PROGRESO DE UNA INFECCION VIRAL -INMUNIDAD, VIRULENCIA, TRANSMISION Y EVOLUCION- TODOS DEPENDEN DEL RESULTADO DE LA INFECCION DE CELULAS INDIVIDUALES, LAS BASES BIOQUIMICAS Y MOLECULARES DE LA INFECCION POR VIRUS DE ARN HAN RECIBIDO MUCHA ATENCION, Y EN LAS ULTIMAS DECADAS TAMBIEN HA HABIDO GRANDES AVANCES EN LA COMPRENSION DE LA DINAMICA EVOLUTIVA VIRAL A NIVEL DE HUESPED Y DE POBLACIONES DE HUESPEDES, EL PROXIMO GRAN DESAFIO ES OBTENER UNA IMAGEN UNIFICADA DE LA DINAMICA DE LA INFECCION DE VIRUS Y SU EVOLUCION QUE INTEGRE DIFERENTES ESCALAS ESPACIO-TEMPORALES, SIN EMBARGO, LA INTEGRACION A TRAVES DE DIFERENTES ESCALAS ESPACIO-TEMPORALES EFECTIVAMENTE NO HA TENIDO LUGAR TODAVIA A NIVEL DE CELULAS INDIVIDUALES Y ENTRE CELULAS DEBIDO A LIMITACIONES PRACTICAS Y METODOLOGICAS, LA RECIENTE LLEGADA DE LAS TECNICAS GENOMICAS PARA CELULAS INDIVIDUALES (SINGLE-CELL GENOMICS), BASADOS EN MICROFLUIDICA Y DE PLATAFORMAS DE SECUENCIACION MASIVAS DE NUEVA GENERACION PUEDE EMPEZAR A HACER DESAPARECER ESTAS LIMITACIONES Y CONTRIBUIR A DESCRIBIR UNA IMAGEN PRECISA DE LOS PROCESOS EVOLUTIVOS QUE RIGEN EN ESTE NIVEL BASICO DEL CICLO VITAL DE LOS VIRUS, EN ESTE PROYECTO PROPONEMOS UNA COMBINACION DE ESTAS TECNICAS AVANZADAS PARA ANALIZAR LAS DINAMICAS DE REPLICACION DE UN VIRUS MODELO DE ARN Y LA GENERACION DE DIVERSIDAD GENETICA DURANTE LA INFECCION DE CELULAS EUCARIOTAS INDIVIDUALES, PROCEDENTES DE DIFERENTES TEJIDOS Y ESPECIES DE HUESPEDES, POR CEPAS VIRALES DE DIFERENTE EFICACIA Y VIRULENCIA, A CONTINUACION, EVALUAREMOS LA CONTRIBUCION DE LA SELECCION NATURAL Y LA DERIVA GENETICA EN LA MODULACION DE LA COMPOSICION DE LOS ENJAMBRES DE MUTANTES DURANTE SU REPLICACION EN CELULAS INDIVIDUALES Y DURANTE SU PROPAGACION A CELULAS VECINAS, AL MISMO TIEMPO, VAMOS A CARACTERIZAR EL EFECTO DE LA INFECCION EN EL TRANSCRIPTOMA DE LAS CELULAS Y A EVALUAR COMO LA PERTURBACION INDUCIDA POR LOS DISTINTOS MUTANTES VIRALES AUMENTA A MEDIDA QUE LA COMPLEJIDAD DEL ENJAMBRE DE MUTANTES AUMENTA Y SE MUEVE DE CELULA A CELULA, BIOLOGÍA DE SISTEMAS\EVOLUCIÓN DE VIRUS\EVOLUCIÓN EXPERIMENTAL\GENÉTICA EVOLUTIVA\GENÓMICA DE CÉLULAS INDIVIDUALES\GENÓMICA DE POBLACIONES\INTERACCIÓN VIRUS-PLANTA\MICROFLUÍDICA\RNA-SEQ\TRANSCRIPTÓMICA