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BIO2014-57518-R

Financiado
DESARROLLO DE HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS PARA EL ESTUDIO DE LOS MECANISMOS DE...
DESARROLLO DE HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS PARA EL ESTUDIO DE LOS MECANISMOS DE RECONEXION DE LA RED DE INTERACCIONES DE PROTEINAS: APLICACION EN LA MEDICINA DE SISTEMAS LA VISION SISTEMICA DE PATOLOGIAS HA LLEVADO AL DESARROLLO DE LA MEDICINA DE REDES, ESTA SE BASA EN LOS AVANCES PROPORCIONADOS POR LA TEORIA DE REDES APLICADOS A LAS REDES BIOLOGICAS, LA REDES BIOLOGICAS SE DERIVAN DE LAS INTERACC... LA VISION SISTEMICA DE PATOLOGIAS HA LLEVADO AL DESARROLLO DE LA MEDICINA DE REDES, ESTA SE BASA EN LOS AVANCES PROPORCIONADOS POR LA TEORIA DE REDES APLICADOS A LAS REDES BIOLOGICAS, LA REDES BIOLOGICAS SE DERIVAN DE LAS INTERACCIONES ENTRE LOS GENES, LAS PROTEINAS Y LOS METABOLITOS, ES DECIR: LAS INTERACCIONES PROTEINA-PROTEINA (IPP), LAS REDES DE REGULACION GENICA Y LAS REDES METABOLICAS, ASI MISMO, LOS TRASTORNOS COMPLEJOS IMPLICAN PRODUCTOS DE MULTIPLES GENES, QUE ACTUAN COOPERATIVAMENTE Y ESTAN IMPLICADOS EN DIVERSOS PROCESOS BIOLOGICOS QUE CARACTERIZAN UN FENOTIPO PATOLOGICO, ESTE A SU VEZ ES EL RESULTADO DE LAS PERTURBACIONES EN LAS VIAS SUBYACENTES, DONDE LOS PRODUCTOS DE GENES CO-OPERAN A TRAVES DE DIVERSOS MECANISMOS, TALES COMO LAS IPP, LA BIOLOGIA DE REDES HA SIDO MUY UTIL PARA IDENTIFICAR GENES ASOCIADOS A ENFERMEDADES MEDIANTE EL PRINCIPIO DE “CULPABILIDAD POR ASOCIACION”, QUE RECIENTEMENTE EMPLEAMOS EN LA IDENTIFICACION DE MARCADORES PARA EL PRONOSTICO DE ALGUNAS METASTASIS, LA CARACTERIZACION ESTRUCTURAL DE LAS IPP NOS AYUDAN A COMPRENDER LAS CAUSAS POR LAS QUE LA RECONEXION EN UNA RED SANA CONLLEVA UN TRASTORNO, SIN EMBARGO, LA MODIFICACION DE LAS CONEXIONES DE UNA RED ES TAMBIEN EL MECANISMO DE REGULACION NORMAL DE UNA CELULA SANA, LA MODIFICACION DE LA SECUENCIA Y/O LA CONFORMACION DE UNA PROTEINA PUEDE AFECTAR UNA INTERACCION, YA SEA POR CAMBIOS DIRECTOS EN LA REGION DE UNION O A TRAVES DE SITIOS ALOSTERICOS, LAS MODIFICACIONES POST-TRANSCRIPCIONALES (MPT) JUEGAN UN PAPEL CLAVE EN LA REGULACION DE LA SEÑALIZACION CELULAR, CAMBIANDO DE FORMA TRANSITORIA INTERACCIONES DE PROTEINAS AL IGUAL QUE UN INTERRUPTOR, EL PAPEL DE LAS MPT ES CRUCIAL PARA ENTENDER LOS MECANISMOS DE REGULACION DE LAS INTERACCIONES, EL ESTUDIO COMBINADO DE LAS IPP Y MPT EMPIEZA A REVELAR LA RECONEXION DE LAS REDES MOLECULARES CONDICIONADA POR MPT, ESTOS ESTUDIOS MUESTRAN LA UTILIDAD DE LA RED DE INTERACCIONES DE PROTEINAS PARA PRIORIZAR MPT ESPECIFICAS, EN TANTO QUE LAS ACTIVIDADES DE ALGUNAS DE ESTAS CAUSAN VARIAS ENFERMEDADES, EN ESTE PROYECTO NOS PROPONEMOS ESTUDIAR LOS MECANISMOS IMPLICADOS EN LA ROTURA Y FORMACION DE INTERACCIONES Y EMPLEARLAS PARA PREDECIR LA RECONEXION DE UNA RED MEDIANTE MPT, MUTACIONES O SPLICING, QUE AFECTAN NUESTRA SALUD, ESTE ESTUDIO SE BASA EN: 1) EL ANALISIS DE LA INTERFAZ DE ESTRUCTURAS CONOCIDAS (O MODELADAS) DE LAS INTERACCIONES PARA PREDECIR SU FUERZA DE UNION; Y 2) EL ANALISIS DE LOS CAMBIOS EN LAS REGIONES FUERA DE LA INTERFAZ DE UNA INTERACCION QUE MODIFICAN SU POSIBLE PREDICCION, EN TRABAJOS PREVIOS DEMOSTRAMOS EL PAPEL DE LOS LAZOS DE PROTEINAS EN LA TOMA DE DECISION DE UNA POSIBLE INTERACCION, PENSAMOS ESTUDIAR MAS A FONDO EL PAPEL DE LOS RESIDUOS FUERA DE LA INTERFAZ PARA PREDECIR LA CONSTANTE DE ASOCIACION ENTRE DOS PROTEINAS Y SI LOS CAMBIOS EN LA SECUENCIA (O CONFORMACION) PUEDEN ROMPER UNA INTERACCION Y MODIFICAR LA RED, APLICAREMOS ESTAS PREDICCIONES AL ESTUDIO DE ENFERMEDADES MULTIFACTORIALES, COMO EL CANCER, Y DE CO-MORBILIDADES EN GENERAL, LO APLICAREMOS PARA ANALIZAR LOS DATOS DE NUESTROS COLABORADORES, ESPECIFICAMENTE EN METASTASIS CEREBRALES, EN LAS CO-MORBILIDADES ENTRE RINITIS, DERMATITIS Y ASMA, Y DE FORMA GENERAL EN LAS CO-MORBILIDADES DERIVADAS DE LA INFORMACION SUSTRAIDA DE FUENTES BIOMEDICAS, NUESTRO OBJETIVO FINAL ES PROPORCIONAR LAS HERRAMIENTAS QUE AYUDEN A ANALIZAR Y PREDECIR LA RECONEXION DE UNA RED, CAUSADA POR CAMBIOS EN LA SECUENCIA O LA CONFORMACION DE SUS PROTEINAS, INTERACCIONES PROTEÍNA-PROTEÍNA\RED DE INTERACCIONES DE PROTEÍNAS\RECONEXIÓN DE REDES EN MEDICINA\REDES CONDICIONADAS. ver más
01/01/2014
UPF
169K€
Perfil tecnológico estimado

Línea de financiación: concedida

El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2014-01-01
Presupuesto El presupuesto total del proyecto asciende a 169K€
Líder del proyecto
UNIVERSITAT POMPEU FABRA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.
Total investigadores 321