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BIO2010-22109

Financiado

ESTUDIO FUNCIONAL DE REDES DE INTERACCIONES ENTRE PROTEINAS

EL OBJETIVO GENERAL DEL PROYECTO PROPUESTO ES EXTRAER NUEVO CONOCIMIENTO DE REDES BIOLOGICAS, ESPECIALMENTE DE LA RED DE INTERACCIONES ENTRE PROTEINAS (¿INTERACTOMA¿), USANDO UNA APROXIMACION SISTEMICA, OTRO OBJETIVO DEL PROYECTO... ver más

01/01/2010

CSIC

103K€

Presupuesto del proyecto: 103K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2010-01-01

0% 100%

Participantes

CSIC

Lider

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA...

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 103K€

Descripción del proyecto EL OBJETIVO GENERAL DEL PROYECTO PROPUESTO ES EXTRAER NUEVO CONOCIMIENTO DE REDES BIOLOGICAS, ESPECIALMENTE DE LA RED DE INTERACCIONES ENTRE PROTEINAS (¿INTERACTOMA¿), USANDO UNA APROXIMACION SISTEMICA, OTRO OBJETIVO DEL PROYECTO ES APORTAR LUZ SOBRE EL COMPLEJO FENOMENO DE ¿FUNCION DE PROTEINAS¿ DESDE UNA PERSPECTIVA DE REDES BIOLOGICAS,NO TODOS LOS FENOMENOS BIOLOGICOS SON ABORDABLES POR UNA APROXIMACION REDUCCIONISTA, HAY INFORMACION BIOLOGICA IMPORTANTE QUE NO SE PUEDE OBTENER POR COMBINACION SENCILLA DE LAS PROPIEDADES DE GENES Y PROTEINAS, SINO QUE ESTA ¿ESCONDIDA¿ EN NIVELES SUPERIORES DE ORGANIZACION, COMO PUEDEN SER LAS COMPLEJAS REDES DE RELACIONES E INTERACCIONES ENTRE ESTOS COMPONENTES MOLECULARES, LA BIOLOGIA DE SISTEMAS ESTUDIA LOS FENOMENOS BIOLOGICOS DESDE EL PUNTO DE VISTA DE ESAS COMPLEJAS RELACIONES, SIGUIENDO UN ENFOQUE DIFERENTE Y COMPLEMENTARIO AL REDUCCIONISTA, LAS REDES DE RELACIONES ENTRE BIOMOLECULAS SON EL OBJETO PROTOTIPICO DE ESTUDIO DE ESTA DISCIPLINA, Y DE ELLAS SE HA EMPEZADO A EXTRAER INFORMACION QUE, AUNQUE TODAVIA MODESTA, NO SE PODRIA HABER OBTENIDO SIGUIENDO UN ENFOQUE REDUCCIONISTA, EL PROYECTO SE PLANTEA COMO UNA CONTINUACION DEL FINANCIADO EN LA CONVOCATORIA 2006 DEL PLAN NACIONAL DE I-D-I (BIO2006-15318), PROYECTO EXTENDIDO MEDIANTE UN ¿PROYECTO PUENTE¿ EN LA CONVOTATORIA DEL AÑO PASADO (BIO2009-11966)*, LOS OBJETIVOS DE ESE PROYECTO FUERON CUMPLIDOS EN SU MAYORIA Y LOS CORRESPONDIENTES RESULTADOS FUERON PUBLICADOS EN REVISTAS INTERNACIONALES DE ALTO IMPACTO (VER ¿HISTORIAL¿),UNO DE LOS OBJETIVOS DEL PROYECTO PROPUESTO ES CONTINUAR MEJORANDO NUESTRA METODOLOGIA DE PREDICCION DE PARES DE PROTEINAS INTERACCIONANTES BASADA EN INFORMACION CO-EVOLUTIVA (MIRRORTREE), ESTA METODOLOGIA, AMPLIAMENTE ACEPTADA POR LA COMUNIDAD, FUE YA MEJORADA EN EL MARCO DEL PROYECTO BIO2006 MENCIONADO, ADEMAS, USANDO UNA VARIACION DE ESTA TECNICA, NOS PROPONEMOS OBTENER GRUPOS DE PROTEINAS QUE FORMEN ¿UNIDADES CO-EVOLUTIVAS INDEPENDIENTES¿: PROTEINAS QUE CO-EVOLUCIONAN FUERTEMENTE ENTRE ELLAS PERO NO CON EL RESTO DEL PROTEOMA, NOS PROPONEMOS ESTUDIAR SI ESTOS GRUPOS PUEDEN ESTAR REFLEJANDO UNIDADES FUNCIONALES INDEPENDIENTES QUE NO NECESITAN AL RESTO DEL PROTEOMA PARA FUNCIONAR, CON LAS IMPLICACIONES QUE ESO PODRIA TENER EN BIOLOGIA SINTETICA Y BIOTECNOLOGIA, TAMBIEN NOS PROPONEMOS SEGUIR CON EL ESTUDIO YA INICIADO DURANTE EL PROYECTO BIO2006 SOBRE COMO LAS PROTEINAS AISLADAS (CON SUS FUNCIONES MOLECULARES ¿¿PALABRAS¿- SIN SENTIDO BIOLOGICO PER SE EN MUCHOS CASOS) DAN LUGAR A SECUENCIAS FUNCIONALES TIPICAS (¿FRASES FUNCIONALES¿ QUE SI ADQUIEREN UN SENTIDO MAS BIOLOGICO) AL INTERACCIONAR Y RELACIONARSE UNAS CON OTRAS EN COMPLEJAS REDES, NOS PROPONEMOS TAMBIEN CONTINUAR CON NUESTRO TRABAJO PIONERO EN LA CUANTIFICACION DEL ¿SENTIDO BIOLOGICO¿ DE TERMINOS FUNCIONALES DE GENE ONTOLOGY, DISTINGUIENDO AQUELLOS QUE SON MERAS CONCEPTUALIZACIONES DE LOS QUE REALMENTE REFLEJAN FUNCIONES CON UN SENTIDO BIOLOGICO, FINALMENTE, NOS GUSTARIA SEGUIR TRABAJANDO EN EL OBJETIVO DEL PROYECTO BIO2006 QUE AUN ESTA EN FASES MAS INICIALES: LA COMBINACION DE DATOS DE INTERACCIONES ENTRE PROTEINAS CON DATOS DE EXPRESION (DNA ARRAYS) PARA OBTENER UNA VISION DINAMICA DEL INTERACTOMA,

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