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PGC2018-096956-B-C43

Financiado

DESARROLLO DE ESTRATEGIAS -OMICAS PARA DESVELAR PANGENOMAS, COEVOLUCION VIRICA Y...

DESARROLLO DE ESTRATEGIAS -OMICAS PARA DESVELAR PANGENOMAS, COEVOLUCION VIRICA Y ADAPTACION A LOS EXTREMOS DE CONCENTRACION SALINA-SP4 EL PRESENTE PROYECTO COORDINADO INVOLUCRA UN CONSORCIO FORMADO POR CUATRO GRUPOS DE INVESTIGACION, CON SUS RESPECTIVOS SUBPROYECTOS, QUE SE CENTRARA EN EL ESTUDIO DEL PANGENOMA DE LAS ESPECIES PROCARIOTAS, LA COEVOLUCION CON SUS V... ver más

01/01/2018

UIB

80K€

Presupuesto del proyecto: 80K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE LAS ISLAS BALEARES No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 20

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2018-01-01

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Participantes

UIB

Lider

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE LAS ISLAS BALEARES

Total investigadores 20

Presupuesto del proyecto 80K€

Descripción del proyecto EL PRESENTE PROYECTO COORDINADO INVOLUCRA UN CONSORCIO FORMADO POR CUATRO GRUPOS DE INVESTIGACION, CON SUS RESPECTIVOS SUBPROYECTOS, QUE SE CENTRARA EN EL ESTUDIO DEL PANGENOMA DE LAS ESPECIES PROCARIOTAS, LA COEVOLUCION CON SUS VIRUS Y LOS MECANISMOS DE ADAPTACION DE ESTAS A AMBIENTES QUE SE SITUAN EN LOS EXTREMOS DEL RANGO DE SALINIDAD (HIPERSALINOS Y OLIGOSALINOS) EMPLEANDO NUEVAS ESTRATEGIAS OMICAS, CONSTA DE 4 SUBPROYECTOS,ESTE SUBPROYECTO SE ENMARCA ESPECIFICAMENTE EN EL CAMPO DE LA BIOLOGIA COMPUTACIONAL Y LA BIOINFORMATICA, SU FINALIDAD ES RESOLVER ALGUNOS PROBLEMAS MATEMATICOS O ALGORITMICOS ESPECIFICOS EN DIFERENTES CAMPOS DE LA MICROBIOLOGIA QUE SON NECESARIOS PARA CUMPLIR LOS OBJETIVOS DEL PROYECTO COORDINADO, E IMPLEMENTAR ESTAS SOLUCIONES EN HERRAMIENTAS INFORMATICAS UTILES, EN ESTE SENTIDO COMBINA AVANCES METODOLOGICOS CON EL DESARROLLO FINAL DE SOFTWARE ESPECIFICO,LOS OBJETIVOS ESPECIFICOS DE ESTE SUBPROYECTO SON LOS SIGUIENTES:- EL DESARROLLO E IMPLEMENTACION DE NUEVAS TECNICAS PARA EL ANALISIS DE LA COMPOSICION Y LA EVOLUCION DE COMUNIDADES MICROBIANAS - EL DESARROLLO E IMPLEMENTACION DE NUEVAS TECNICAS PARA LA COMPARACION DE COMUNIDADES MICROBIANAS, TANTO A PARTIR DE MUESTRAS METAGENOMICAS COMO DE SU COMPOSICION ESTIMADA A PARTIR DE ASIGNACIONES TAXONOMICAS O FILOGENETICAS- LA PROPUESTA DE UN MODELO ESTOCASTICO EVOLUTIVO QUE EXPLIQUE EL ANI-GAP (LA EXISTENCIA DE UNA FRANJA DE VALORES CON UNA MUY BAJA OCURRENCIA DE VALORES DEL ANI (INDICE DE IDENTIDAD DE ACIDOS NUCLEICOS) ENTRE PARES DE ESPECIES DIFERENTES DEL MISMO GENERO)- EL DISEÑO E IMPLEMENTACION DE NUEVOS ALGORITMOS DE ASIGNACION TAXONOMICA DE SECUENCIAS METAGENOMICAS - EL DISEÑO E IMPLEMENTACION DE UN ALGORITMO QUE AUTOMATICE TODO LO POSIBLE Y ACELERE EL PROCESO DE ASIGNACION DE OPU (OPERATIONAL PHYLOGENETIC UNITS) A SECUENCIAS METAGENOMICAS - EL DESARROLLO E IMPLEMENTACION DE UNA NUEVA HERRAMIENTA DE PREDICCION Y ANALISIS DEL METABOLISMO CONJUNTO DE UNA COMUNIDAD MICROBIANA A PARTIR DE UNA MUESTRA METAGENOMICA- EL DESARROLLO E IMPLEMENTACION DE UNA NUEVA HERRAMIENTA PARA LA RECONSTRUCCION DE REDES PPI FUNCIONALES, SU ALINEAMIENTO, Y LA PREDICCION DE LA FUNCION E INTERACCION DE PROTEINAS- LA INTEGRACION DE LAS HERRAMIENTAS DE ASIGNACION METAGENOMICA, DE ANALISIS Y COMPARACION DE COMUNIDADES MICROBIANAS, DE PREDICCION Y ANALISIS DEL METABOLISMO CONJUNTO Y DE RECONSTRUCCION DE PPI FUNCIONALES, JUNTO A OTRAS HERRAMIENTAS PRODUCIDAS PREVIAMENTE POR NUESTRO GRUPO, EN UNA SUITE COMPLETA DE ANALISIS DE MUESTRAS METAGENOMICAS - EL DISEÑO E IMPLEMENTACION DE ALGORITMOS DE PREDICCION DE RELACIONES INFECCIOSAS ENTRE VIRUS Y HUESPEDES BASADOS EN EL ANALISIS GENOMICO Y FILOGENETICO- LA ORGANIZACION DE LOS DATOS OMICOS OBTENIDOS POR LOS OTROS SUBPROYECTOS EN BASES DE DATOS ADECUADASADEMAS COLABORAREMOS CON LOS OTROS SUBPROYECTOS EN LA CONSECUCION DE SUS OBJETIVOS LLEVANDO A CABO EL ANALISIS DE LOS DATOS OMICOS OBTENIDOS POR LOS MISMOS, TANTO CON HERRAMIENTAS YA EXISTENTES COMO CON LAS HERRAMIENTAS DISEÑADAS EN EL MARCO DE ESTE SUBPROYECTO, BIOINFORMÁTICA\ESTADÍSTICA\GENÓMICA\METAGENÓMICA\METAVIRÓMICA\METABOLÓMICA\METAPROTEÓMICA\COEVOLUCIÓN\FILOGENÉTICA

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