APLICACIONES BIOINFORMATICAS EN FILOGENETICA, METAGENOMICA, BIOLOGIA DE SISTEMAS...
APLICACIONES BIOINFORMATICAS EN FILOGENETICA, METAGENOMICA, BIOLOGIA DE SISTEMAS Y GENOMICA DEL CANCER
ESTE PROYECTO SE ENMARCA EN EL CAMPO DE LA BIOINFORMATICA, SU FINALIDAD ES RESOLVER DIVERSOS PROBLEMAS ESPECIFICOS EN DIFERENTES CAMPOS DE LA BIOLOGIA Y LA BIOQUIMICA, E IMPLEMENTAR ESTAS SOLUCIONES EN HERRAMIENTAS INFORMATICAS UT...
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Descripción del proyecto
ESTE PROYECTO SE ENMARCA EN EL CAMPO DE LA BIOINFORMATICA, SU FINALIDAD ES RESOLVER DIVERSOS PROBLEMAS ESPECIFICOS EN DIFERENTES CAMPOS DE LA BIOLOGIA Y LA BIOQUIMICA, E IMPLEMENTAR ESTAS SOLUCIONES EN HERRAMIENTAS INFORMATICAS UTILES PARA LOS BIOLOGOS, EN ESTE SENTIDO COMBINA AVANCES METODOLOGICOS CON EL DESARROLLO FINAL DE SOFTWARE ESPECIFICO: EL PESO DE CADA UNO DE ESTOS DOS ASPECTOS DIFIERE SEGUN EL PROBLEMA CONCRETO, LOS OBJETIVOS BASICOS DEL PROYECTO SON LOS SIGUIENTES: LA DEFINICION Y ESTUDIO DE INDICES DE BALANCE Y DE DIVERSIDAD PARA FILOGENIAS MAS GENERALES QUE LOS ARBOLES FILOGENETICOS, EL DESARROLLO Y ANALISIS DE MODELOS ESTOCASTICOS DE CRECIMIENTO DE FILOGENIAS MAS GENERALES QUE LOS ARBOLES FILOGENETICOS BINARIOS, Y SU CONTRASTE EN BASES DE DATOS FILOGENETICAS, EL DISEÑO DE NUEVOS ALGORITMOS DE RECONSTRUCCION DE REDES FILOGENETICAS QUE PRODUZCAN REDES CON RESTRICCIONES TOPOLOGICAS EVOLUTIVAMENTE SIGNIFICATIVAS, Y SU IMPLEMENTACION EN UNA HERRAMIENTA WEB QUE ESTAMOS DESARROLLANDO, EL DISEÑO E IMPLEMENTACION DE NUEVOS ALGORITMOS DE ASIGNACION TAXONOMICA DE SECUENCIAS METAGENOMICAS QUE PERMITAN USAR DIFERENTES ARBOLES TAXONOMICOS SIMULTANEAMENTE, Y DETERMINEN, DE MANERA MAS PRECISA QUE LOS ACTUALES, LAS RELACIONES TAXONOMICAS ENTRE LAS NUEVAS ESPECIES DETECTADAS, EL DESARROLLO E IMPLEMENTACION DE UN ALGORITMO PARA LA PREDICCION DE INTERACCIONES ENTRE PROTEINAS Y SU FUNCION USANDO UNA COMBINACION DE ALINEAMIENTOS ENTRE REDES DE INTERACCIONES DE PROTEINAS Y APRENDIZAJE ESTADISTICO, EL ANALISIS COMPARATIVO DE LA EVOLUCION METABOLICA DE LAS ESPECIES MEDIANTE EL ANALISIS MASIVO DE LOS DATOS OBTENIDOS AL COMPARAR TODOS LOS PARES DE RUTAS METABOLICAS DE LA BASE DE DATOS KEGG, EL DESARROLLO DE UNA HERRAMIENTA INFORMATICA QUE PERMITA EL ANALISIS DE LA RED METABOLICA DE UNA COMUNIDAD DE ORGANISMOS, EL DESARROLLO DE UNA HERRAMIENTA INFORMATICA QUE EVALUE LA PROBABILIDAD DE QUE PARES DE MUTACIONES EN GENES DIFERENTES ESTEN RELACIONADAS CON LA APARICION DE UN DETERMINADO TIPO DE CANCER, BIOINFORMÁTICA\ÁRBOLES FILOGENÉTICOS\REDES FILOGENÉTICAS\METAGENÓMICA\REDES PPI\REDES METABÓLICAS\GENÓMICA DEL CÁNCER
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