DECONSTRUCCION POR MEDIO DE BIOLOGIA SINTETICA DE PROTEINOPATIAS AMILOIDES EN CO...
DECONSTRUCCION POR MEDIO DE BIOLOGIA SINTETICA DE PROTEINOPATIAS AMILOIDES EN COMUNIDADES BACTERIANAS Y CELULAS HUMANAS EN CULTIVO
LA NEURODEGENERACION ESTA LIGADA A LA CITOTOXICIDAD DE AGREGADOS AMILOIDES DE PROTEINAS, SIN EMBARGO, LA AMILOIDOSIS EN MODELOS MICROBIANOS COMO LA LEVADURA S, CEREVISIAE NO ES CITOTOXICA, SINO QUE TIENE FUNCION EPIGENETICA, DURAN...
LA NEURODEGENERACION ESTA LIGADA A LA CITOTOXICIDAD DE AGREGADOS AMILOIDES DE PROTEINAS, SIN EMBARGO, LA AMILOIDOSIS EN MODELOS MICROBIANOS COMO LA LEVADURA S, CEREVISIAE NO ES CITOTOXICA, SINO QUE TIENE FUNCION EPIGENETICA, DURANTE LOS ULTIMOS AÑOS, HEMOS ABORDADO EL RETO DE GENERAR EN BACTERIAS, POR MEDIO DE LA BIOLOGIA SINTETICA, UN SISTEMA MODELO UTIL PARA ABORDAR LAS BASES MOLECULARES DE LA AMILOIDOSIS INTRACELULAR DE PROTEINAS,DISEÑAMOS UN DISPOSITIVO AMILOIDOGENICO A PARTIR DEL DOMINIO WH1 DE REPA, UNA PROTEINA DE REPLICACION PLASMIDICA, REPA-WH1 CAMBIA SU CONFORMACION IN VITRO AL UNIRSE A SECUENCIAS DEFINIDAS DE DNA, O AL MOLDEAR SU ESTRUCTURA SOBRE LA DE AGREGADOS DE LA PROPIA PROTEINA, ENSAMBLANDOSE COMO FIBRAS AMILOIDES, EN E, COLI, REPA-WH1 FORMA PARTICULAS HEREDABLES, DISTINTAS DE LOS CUERPOS DE INCLUSION CONVENCIONALES POR SU MORFOLOGIA, DISTRIBUCION INTRACELULAR, SU MAYOR AFINIDAD POR UN FLUOROFORO ESPECIFICO DE AMILOIDES Y SU AGUDA CITOTOXICIDAD, REPA-WH1 SE PROPAGA COMO DOS ESTIRPES AMILOIDES DIFERENCIADAS QUE MUESTRAN CITOTOXICIDAD DISTINTA Y CUYA INTERCONVERSION SE MODULA POR UNA CHAPERONA HSP70 (DNAK), LA UNION DE REPA-WH1 A VESICULAS CON FOSFOLIPIDOS ACIDOS PROMUEVE LA AMILOIDOGENESIS, FORMANDOSE POROS EN LA BICAPA LIPIDICA, APROXIMACIONES OMICAS HAN PERMITIDO DETERMINAR LOS PERFILES GLOBALES DE EXPRESION GENICA Y LA FRACCION DEL PROTEOMA DE E, COLI PREFERENCIALMENTE COAGREGADA CON EL PRIONOIDE QUE, COMPLEMENTADAS CON ENSAYOS FISIOLOGICOS, INDICAN UN INCREMENTO DEL ESTRES OXIDATIVO POR H2O2, REPA-WH1 MIMETIZA EN BACTERIAS LA TOXICIDAD MITOCONDRIAL ASOCIADA A NEURODEGENERACION, COMO HERRAMIENTAS BIOTECNOLOGICAS, HEMOS GENERADO DOS SISTEMAS REPORTEROS PARA MONITORIZAR AMILOIDOSIS INTRACELULARES, EN LEVADURA Y EN E, COLI, MEDIANTE EL TROQUELADO EN FACTORES DE TERMINACION DE LA TRADUCCION DE LA SECUENCIA PEPTIDICA AMILOIDOGENICA DE REPA-WH1, POSIBILITANDO ASI SU CONTROL EPIGENETICO,EN UN PRIMER BLOQUE DE OBJETIVOS DE LA PRESENTE PROPUESTA, TRAS HABER GENERADO UNA AMILOIDOSIS INTRACELULAR EN BACTERIAS, DESPLAZAREMOS NUESTRA ATENCION HACIA AFUERA, ASI, EXPLORAREMOS EN E, COLI COMO LOS CONSORCIOS BACTERIANOS RESPONDEN A LA AMILOIDOSIS POR REPA-WH1 EN UNA SUBPOBLACION DE CELULAS, ADEMAS, MEDIANTE LA INGENIERIA DE UNA PORINA DE LA MEMBRANA EXTERNA, GENERAREMOS: I) UN RECEPTOR DE SUPERFICIE PARA SECUENCIAS PEPTIDICAS AMILOIDOGENICAS; II) UNA VALVULA REGULADA POR AMILOIDES QUE CONTROLE EL FLUJO DE ANTIBIOTICOS; III) UNA TRAMPA CAPTADORA DE AMILOIDES, QUE POSTERIORMENTE CONVERTIREMOS EN IV) UNA PROTEASA ESPECIFICA DE AMILOIDES, ESTOS DISPOSITIVOS PERMITIRAN LA DETECCION, SELECCION Y ELIMINACION POR LAS BACTERIAS DE AMILOIDES PRESENTES COMO CONTAMINANTES EN EL MEDIO AMBIENTE, ADEMAS DEL CRIBADO DE MOLECULAS ANTI-AMILOIDOGENICAS CON INTERES FARMACOLOGICO, EN UN SEGUNDO BLOQUE, BASADO EN RESULTADOS EXPERIMENTALES PRELIMINARES, EXPLORAREMOS LAS RUTAS DE CITOTOXICIDAD AMILOIDE DE REPA-WH1 EN CELULAS HUMANAS EN CULTIVO, COMO PRUEBA DE CONCEPTO DEL PRIONOIDE BACTERIANO SINTETICO COMO MODELO DE MINIMALISTA DE NEURODEGENERACION, I) EXPRESAREMOS REPA-WH1 EN EL CITOPLASMA, DISECCIONANDO RUTAS APOPTOTICAS, NECROTICAS O AUTOFAGICAS, Y EXPLORAREMOS EL POTENCIAL DE NUCLEACION CRUZADA DE LA AGREGACION AMILOIDE DE REPA-WH1; II) ESTUDIAREMOS EL EFECTO QUE REPA-WH1, SIENDO UN DISPOSITIVO CUYA AMILOIDOGENESIS ESTA PROMOVIDA POR DNA, PODRIA TENER EN EL NUCLEO SOBRE EL CICLO CELULAR Y LA ARQUITECTURA Y DINAMICA DE LOS CROMOSOMAS, BIOLOGÍA SINTÉTICA\AMILOIDOSIS DE PROTEÍNAS\ESCHERICHIA COLI\SISTEMAS MODELO DE PROTEINOPATÍAS\METABOLÓMICA\PORINASver más
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