DESCUBRIMIENTO, CARACTERIZACION Y DISEÑO DE NUEVOS AMILOIDES FUNCIONALES AUTO-RE...
DESCUBRIMIENTO, CARACTERIZACION Y DISEÑO DE NUEVOS AMILOIDES FUNCIONALES AUTO-REPLICATIVOS
EN LA CELULA, ES LA ESTRUCTURA NATIVA DE LAS PROTEINAS QUIEN DETERMINA SU FUNCION BIOLOGICA; POR ELLO, SU MAL PLEGAMIENTO IMPACTA NEGATIVAMENTE LA FISIOLOGIA CELULAR, LAS PROTEINAS MAL PLEGADAS PUEDEN FORMAR ESTRUCTURAS SUPRAMOLEC...
EN LA CELULA, ES LA ESTRUCTURA NATIVA DE LAS PROTEINAS QUIEN DETERMINA SU FUNCION BIOLOGICA; POR ELLO, SU MAL PLEGAMIENTO IMPACTA NEGATIVAMENTE LA FISIOLOGIA CELULAR, LAS PROTEINAS MAL PLEGADAS PUEDEN FORMAR ESTRUCTURAS SUPRAMOLECULARES ALTAMENTE ORDENADAS Y RICAS EN HOJAS-BETA, CONOCIDAS COMO FIBRAS AMILOIDES, CUANDO LAS FIBRAS AMILOIDES CRECEN Y SE DIVIDEN CON UNA ELEVADA EFICIENCIA PUEDEN PROPAGARSE Y SON ENTONCES DENOMINADAS PRIONES,GENERALMENTE, ASOCIAMOS LA FORMACION DE AMILOIDES Y PRIONES CON ENFERMEDADES, ESTA VISION HA ENSOMBRECIDO UNO DE LOS ATRIBUTOS MAS INTERESANTES DE LOS PRIONES: SU HABILIDAD PARA CAMBIAR ENTRE DIFERENTES ESTADOS ESTRUCTURALES Y FUNCIONALES DE FORMA ESPONTANEA, ES CADA VEZ MAS EVIDENTE QUE ESTE MECANISMO ES EXPLOTADO PARA FUNCIONES BENEFICIOSAS EN LA NATURALEZA, DESDE LOS MICROORGANISMOS HASTA LOS HUMANOS, DE HECHO, ES LA BASE DE VARIOS NUEVOS Y REVOLUCIONARIOS CONCEPTOS EN BIOLOGIA, COMO SON LOS ELEMENTOS GENETICOS DE BASE PROTEICA, LA FORMACION DE ENSAMBLAJES DINAMICOS Y LA EXPRESION DE VARIACIONES EPIGENETICAS,LOS AMILOIDES FUNCIONALES AUTO-REPLICATIVOS MEJOR CARACTERIZADOS SON LOS PRIONES DE LEVADURA, UNA CARACTERISTICA COMUN DE ESTAS PROTEINAS ES LA PRESENCIA DE UN DOMINIO PRIONICO (PRD) CARACTERISTICO, EL CUAL ES NECESARIO Y SUFICIENTE PARA LA PROPAGACION, EN GENERAL, ESTOS DOMINIOS SON MUY RICOS EN ASPARAGINA Y/O GLUTAMINA Y PRESENTAN UN "BIAS" COMPOSICIONAL PARA OTROS RESIDUOS, EN EL PROYECTO ANTERIOR EXPLOTAMOS ESTAS CARACTERISTICAS PARA DESARROLLAR UN ALGORITMO CAPAZ DE IDENTIFICAR DOMINIOS PRION-LIKE (PRLD) EN GRANDES BASES DE DATOS Y LO HEMOS USADO PARA PREDECIR PRLD EN TODOS LOS PROTEOMAS COMPLETOS DISPONIBLES, HASTA DONDE SABEMOS, SE TRATA DEL ESTUDIO MAS EXHAUSTIVO REALIZADO PARA LA IDENTIFICACION DE DOMINIOS CON PROPIEDADES AMILOIDES FUNCIONALES AUTO-REPLICATIVAS,NUESTRO OBJETIVO EN EL PRESENTE PROYECTO ES COMBINAR APROXIMACIONES TEORICAS Y EXPERIMENTALES PARA IDENTIFICAR Y CARACTERIZAR EXPERIMENTALMENTE PROTEINAS AMILOIDES FUNCIONALES EN TRES ORGANISMOS DIFERENTES: HUMANOS, PLASMODIUM Y STAPHYLOCOCCUS,EN HUMANOS, SE PREDICE QUE LOS PRLD SE ENCUENTRAN IMPLICADOS EN PROCESOS FUNDAMENTALES, COMO EL DESARROLLO EMBRIONARIO O CEREBRAL, EN ESTE SENTIDO, RECIENTEMENTE SE HA DEMOSTRADO QUE MUTACIONES EN ESTOS DOMINIOS DESENCADENAN DIFERENTES PROTEINOPATIAS DE CARACTER NEURODEGENERATIVO, A CAUSA DEL DESPLAZAMIENTO DEL EQUILIBRIO ENTRE LAS FORMAS SOLUBLES Y LAS AUTO-ENSAMBLADAS HACIA LA ACUMULACION DE ESTAS ULTIMAS, ESTE PROCESO PUEDE TENER UNA GRAN RELEVANCIA EN SALUD HUMANA, PUES LA MAYORIA DE PROTEINAS CON PRLD TIENEN FUNCION REGULADORA, NOS CENTRAREMOS EN LA CARACTERIZACION DE NUEVOS PRLD HUMANOS INVOLUCRADOS EN ENFERMEDADES, EN PROMEDIO, EN ORGANISMOS INFERIORES, EL NUMERO DE PRLD ES SIGNIFICATIVAMENTE SUPERIOR EN LAS ESPECIES PATOGENAS, INCLUYENDO S, AUREUS Y P, FALCIPARUM, ESTO SUGIERE QUE PODRIAN ESTAR INVOLUCRADOS EN PROCESOS ADAPTATIVOS, PERMITIENDO A ALGUNAS CELULAS PERSISTIR EN ENTORNOS ESTRESANTES COMO EN PRESENCIA DE ANTIBIOTICOS O EVADIR LA RESPUESTA INMUNITARIA, EXPLORAREMOS ESTA POSIBILIDAD Y DESARROLLAREMOS NUEVAS APROXIMACIONES TERAPEUTICAS USANDO ESTAS SECUENCIAS COMO DIANAS,IDEALMENTE, EL CONOCIMIENTO ACUMULADO DEBERIA PERMITIRNOS ELABORAR HERRAMIENTAS PARA INACTIVAR IN VIVO Y "A LA CARTA" PROTEINAS CON PRLD, CON EL OBJETIVO DE ESTUDIAR FUNCION PROTEICA, COMO ESTRATEGIA ANTI-PATOGENICA O PARA SU APLICACION COMO CAPACITADORES MOLECULARES EN BIOLOGIA SINTETICA, PLEGAMIENTO Y AGREGACIÓN PROTEICA\ AMILOIDES\ PROTEINOPATÍAS\ PRIONES\ PRIONES DE LEVADURA\ STAPHYLOCOCCUS\ PLASMODIUM\ AGENTES ANTI-PATOGÉNICOS\ BIOINFORMÁTICAver más
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