Descripción del proyecto
EN PROYECTOS DE INVESTIGACION ANTERIORES, HEMOS DESARROLLADO PEQUEÑAS PROTEINAS QUIMERICAS DE CADENA SENCILLA, LLAMADAS COVNHR, QUE IMITAN CON PRECISION LA REGION NHR MUY CONSERVADA DE GP41 Y TIENEN UNA POTENTE ACTIVIDAD INHIBIDORA CONTRA UNA VARIEDAD DE CEPAS DEL VIH, INCLUIDOS VIRUS RESISTENTES A ENFUVIRTIDA (EL UNICO INHIBIDOR DE FUSION APROBADO PARA LA TERAPIA DEL VIH), DURANTE EL PROYECTO ACTUAL BIO2016-76640-R, HEMOS ESTUDIADO LOS DETALLES ESTRUCTURALES Y TERMODINAMICOS DE LAS INTERACCIONES ENTRE LAS PROTEINAS COVNHR CON SUS DIANAS EN GP41, ASI COMO SU MECANISMO DE INHIBICION DEL VIH, ADEMAS HEMOS PRODUCIDO NUEVAS VARIANTES DE PROTEINAS CON PROPIEDADES MEJORADAS, SOBRE LA BASE DE ESTOS RESULTADOS, ESTE PROYECTO COORDINADO TIENE COMO OBJETIVOS MEJORAR AUN MAS LAS PROTEINAS COVNHR, EXTENDER ESTE ENFOQUE PARA DISEÑAR PROTEINAS SIMILARES DIRIGIDAS CONTRA EBOV GP2, E IDENTIFICAR LIGANDOS DE MOLECULA PEQUEÑA DE ALTA AFINIDAD QUE PUEDAN INHIBIR EL VIH,EL SUBPROYECTO 1 ACTUARA COMO COORDINADOR DEL PROYECTO, CON LOS SIGUIENTES OBJETIVOS Y ACTIVIDADES: A) UTILIZANDO NUESTRA EXPERIENCIA PREVIA EN INGENIERIA Y DISEÑO DE PROTEINAS, MODIFICAREMOS LAS PROTEINAS COVNHR PARA MEJORAR SU ESTABILIDAD CONFORMACIONAL, PROPIEDAD DIRECTAMENTE RELACIONADA CON LA ACTIVIDAD INHIBITORIA, ADEMAS, SE AÑADIRAN A LAS PROTEINAS NUEVOS DETERMINANTES DE UNION DIRIGIDOS A OTRAS REGIONES GP41, BUSCANDO SINERGIAS FUNCIONALES PARA MEJORAR LA EFICACIA INHIBITORIA, LAS PROTEINAS RECOMBINANTES SE PRODUCIRAN EN NUESTRO LABORATORIO Y TRANSFERIREMOS MUESTRAS Y PROTOCOLOS DE PRODUCCION AL SUBPROYECTO 2 PARA LA DETERMINACION ESTRUCTURAL, ADEMAS, SE REALIZARA UNA EXTENSA CARACTERIZACION BIOFISICA Y CONFORMACIONAL DE LAS PROTEINAS CON UNA VARIEDAD DE TECNICAS EN COLABORACION CON LA DRA, PATRIZIA POLVERINO DE LA UNIVERSIDAD DE PADUA,B) DADA LA SIMILITUD ENTRE EL MECANISMO DE FUSION DEL VIH Y EL EBOV, DISEÑAREMOS PROTEINAS SIMILARES DIRIGIDAS CONTRA EBOV GP2 UTILIZANDO ENFOQUES DE DISEÑO COMPUTACIONAL YA UTILIZADOS CON EXITO PARA COVNHR, LAS PROTEINAS SERAN CLONADAS, EXPRESADAS, PURIFICADAS Y CARACTERIZADAS PARA VERIFICAR SU VIABILIDAD, EN CASO DE EXITO EN LA PRODUCCION DE PROTEINAS ESTABLES, EL SUBPROYECTO 2 LAS ANALIZARA ESTRUCTURALMENTE,C) LAS PROTEINAS COVNHR IMITAN CON PRECISION LA REGION NHR EXPUESTA DE GP41, DE MODO QUE CONSTITUYEN OBJETIVOS MOLECULARES PERFECTOS PARA LA IDENTIFICACION DE LIGANDOS, REALIZAREMOS EL CRIBADO COMPUTACIONAL DE BIBLIOTECAS DE COMPUESTOS MEDIANTE TECNICAS DE ACOPLAMIENTO MOLECULAR COMBINADAS CON DINAMICA MOLECULAR, LOS COMPUESTOS IDENTIFICADOS SERAN ANALIZADOS PARA DETERMINAR EXPERIMENTALMENTE SU AFINIDAD DE UNION Y LOS CASOS POSITIVOS SERAN TRANSFERIDOS AL SUBPROYECTO 2 PARA SU ANALISIS ESTRUCTURAL,D) LA ACTIVIDAD INHIBIDORA DE LAS PROTEINAS DISEÑADAS Y LOS COMPUESTOS IDENTIFICADOS SERA ANALIZADA IN VITRO POR LA DRA, CHRISTIANE MOOG, DE LA UNIVERSIDAD DE ESTRASBURGO, UTILIZANDO VARIOS ENSAYOS CON VIRUS DEL VIH Y PSEUDOVIRUS, SE EXPLORARAN DETALLES ESPECIFICOS DEL MECANISMO DE INHIBICION EN EXPERIMENTOS DE UNION A LA PROTEINA DE LA ENVOLTURA DEL VIH Y A PARTICULAS VIRALES, LA ACTIVIDAD INHIBIDORA DE LA FUSION DE LAS PROTEINAS DIRIGIDAS A EBOV SE ANALIZARA USANDO PSEUDOVIRUS QUE EXPRESAN GP2,TODAS ESTAS ACTIVIDADES, JUNTO CON LA EXTENSA INFORMACION ESTRUCTURAL DE ALTA RESOLUCION PROPORCIONADA POR EL SUBPROYECTO 2, SERVIRAN PARA OBTENER NUEVOS INHIBIDORES PARA ESTOS VIRUS QUE PUEDAN DESARROLLARSE COMO MEDICAMENTOS ANTIVIRALES, VIH\SIDA\EBOLA\DISEÑO BIOMOLECULAR\INGENIERIA DE PROTEINAS\INHIBIDORES DE FUSION\ESTRUCTURA DE PROTEINAS\INTERACCION PROTEINA-LIGANDO\DESCUBRIMIENTO DE FARMACOS