Descripción del proyecto
EL VIRUS DE INMUNODEFICIENCIA HUMANA (VIH) EMPLEA VARIAS ESTRATEGIAS PARA EVITAR SU NEUTRALIZACION, ENTRE ELLAS, LA ALTERACION DE SU SECUENCIA EN LOS SUCESIVOS CICLOS DE REPLICACION FACILITA LA EVASION DE LA RESPUESTA INMUNE ADAPTATIVA, LOS ANTICUERPOS AMPLIAMENTE NEUTRALIZANTES DEL VIH (BNAB) SON CAPACES DE NEUTRALIZAR CEPAS DE VIH GENETICAMENTE DIFERENTES, EL RECONOCIMIENTO Y LA NEUTRALIZACION DEL VIH POR VARIOS TIPOS DE BNAB SOLO SE PRODUCEN EN PRESENCIA DE LA BICAPA LIPIDICA QUE CUBRE LA CAPSIDE DEL VIH, SUBRAYANDO EL PAPEL ACTIVO DE LA ENVOLTURA LIPIDICA EN LA INTERACCION ANTICUERPO-EPITOPO, UNA VIA MUY PROMETEDORA PARA DESARROLLAR HERRAMIENTAS PROFILACTICAS Y TERAPEUTICAS DEL VIH ES LA MODIFICACION RACIONAL DE AQUELLOS BNAB QUE MUESTRAN LA RESPUESTA NEUTRALIZANTE MAS AMPLIA CON EL OBJETIVO DE MEJORAR SU POTENCIA, SIN EMBARGO, EL PAPEL DE LA MEMBRANA VIRAL Y SUS PROPIEDADES BIOFISICAS EN LOS MECANISMOS DE LA INTERACCION DE ANTICUERPOS Y EPITOPOS ES AUN MUY POCO CONOCIDO, EL OBJETIVO ESPECIFICO DE ESTA PROPUESTA ES ENTENDER, A NIVEL MOLECULAR, LA MANERA EN QUE LAS PROPIEDADES BIOFISICAS DE LA MEMBRANA VIRAL DETERMINAN FUNCIONALMENTE EL RECONOCIMIENTO Y LA NEUTRALIZACION DEL VIH POR ANTICUERPOS BNAB QUE HAN SIDO DISEÑADOS PARA MEJORAR LA POTENCIA DE NEUTRALIZACION, PARA COMPLETAR ESTE OBJETIVO, COMBINAMOS METODOLOGIAS OPTICAS AVANZADAS CON RESOLUCION DE MOLECULA INDIVIDUAL CON MODELOS ESTADISTICOS COMPLEJOS Y SIMULACIONES COMPUTACIONALES PARA PROPORCIONAR UNA DESCRIPCION CUANTITATIVA COMPLETA DE LA INTERACCION DEL ANTICUERPO CON SU EPITOPO EN EL CONTEXTO DE LA MEMBRANA, NUESTRO ENFOQUE TIENE EN CUENTA QUE LAS MEMBRANAS BIOLOGICAS SON ENTORNOS ALTAMENTE DINAMICOS Y ESPACIALMENTE HETEROGENEOS, EN LOS CUALES LA ESCALA TEMPORAL Y ESPACIAL DE LOS EVENTOS MOLECULARES ABARCA VARIOS ORDENES DE MAGNITUD, LAS OBSERVACIONES DE CONJUNTO, COMO LAS REALIZADAS BAJO EL MICROSCOPIO CONFOCAL LIMITADO POR DIFRACCION O LAS TECNICAS BIOQUIMICAS MASIVAS, PROMEDIAN INFORMACION CRITICA DINAMICA Y ESPACIALMENTE RESUELTA QUE GOBIERNA LOS ENCUENTROS MOLECULARES EN LA MEMBRANA Y ENMASCARA LA INFORMACION SOBRE EVENTOS MOLECULARES INDIVIDUALES, ESTE PROYECTO ABORDA ESTE PROBLEMA CON UN ENFOQUE DOBLE: PRIMERO, ESTUDIAMOS LA DIFUSION E INTERACCIONES DE ANTICUERPOS EN PARTICULAS VIRALES Y AMBIENTES DE LIPIDOS CONTROLADOS USANDO METODOLOGIAS AVANZADAS DE MOLECULAS INDIVIDUALES PARA PRODUCIR OBSERVACIONES NO PROMEDIADAS Y, EN SEGUNDO LUGAR, ADEMAS DE LAS HERRAMIENTAS DE ANALISIS ESTADISTICO COMUNES BASADAS EN LA DESCRIPCION DE LAS DISTRIBUCIONES DE PROBABILIDAD (ESTADISTICA DESCRIPTIVA), UTILIZAMOS MODELOS ESTADISTICOS COMPLEJOS (ESTADISTICA INFERENCIAL) QUE REVELAN ESTADOS MOLECULARES QUE NO SON ACCESIBLES MEDIANTE OBSERVACION DIRECTA, PERO QUE PUEDEN OBSERVARSE ANALIZANDO LAS SECUENCIAS DE DIFUSION O INTERACCION OBSERVADAS, AL SER UNA INVESTIGACION INTRINSECAMENTE MULTIDISCIPLINAR, NUESTRO TRABAJO SE APOYA EN LA COLABORACION CONTINUA CON UN GRUPO LIDER DE INVESTIGACION EN FUSION DE MEMBRANAS Y VIH, CON CUYO PROYECTO NOS COORDINAMOS, PROPORCIONANDO LA REALIMENTACION NECESARIA PARA OPTIMIZAR LA INGENIERIA DE ANTICUERPOS, NUESTRO ENFOQUE CONTRIBUYE A UNA INVESTIGACION DE MAYOR IMPACTO DEBIDO AL HECHO DE QUE UNA CUESTION BIOMEDICA EXTREMADAMENTE RELEVANTE, COMO ES LA PROFILAXIS Y TERAPEUTICA DEL VIH, SE ABORDA CON HERRAMIENTAS DE LA FISICA QUE PROPORCIONAN UNA COMPRENSION MAS PROFUNDA DE LOS PROCESOS BIOLOGICOS MEDIANTE SU CUANTIFICACION Y MODELADO, INGENIERÍA DE ANTICUERPOS\QUÍMICA BIOLÓGICA\DESARROLLO DE FÁRMACOS\VIRUS DE LA INMUNODEFICIENCIA HUMANA\INMUNOTERAPIA VIH\VACUNA VIH\MICROSCOPÍA CUANTITATIVA\MICROSCOPÍA DE SUPER-RESOLUCIÓN\BIOFÍSICA Y DINÁMICA MOLECULAR