Descripción del proyecto
LA CONJUGACION BACTERIANA ES UN EFICIENTE MECANISMO DE TRANSFERENCIA GENETICA HORIZONTAL, SU PROMISCUIDAD SE HA EXPLORADO Y EXPLOTADO DURANTE DECADAS, LOS MECANISMOS BASADOS EN CONJUGACION SE PUEDEN USAR PARA TRANSFERIR PROTEINAS Y ADN DESDE LAS BACTERIAS A VIRTUALMENTE CUALQUIER CELULA PROCARIOTA, Y EXISTEN VARIOS EJEMPLOS DOCUMENTADOS DE TRANSFERENCIA ENTRE REINOS, A PESAR DE ELLO, NUESTROS RESULTADOS RECIENTES NOS HAN HECHO ADVERTIR QUE ESTA VIA DE EXPLORACION ESTA LEJOS DE SER AGOTADA, HEMOS DEMOSTRADO TRANSFERENCIA CONJUGATIVA DESDE CEPAS DE LABORATORIO DE E, COLI A VARIOS GENEROS GRAM-POSITIVOS, EN PARTICULAR CEPAS SALVAJES QUE SON RECALCITRANTES A LA TRANSFORMACION, Y CONTIENEN UN CONSIDERABLE INTERES BIOTECNOLOGICO Y BIOMEDICO, POR TANTO, NUESTRO PRIMER OBJETIVO ES CONTINUAR CON ESTA NUEVA VIA DE EXPLORACION, Y COMBINAR LA HERRAMIENTA DE INTRODUCCION DE ADN CON ELEMENTOS ADICIONALES PARA OBTENER INTEGRACION, RECOMBINACION Y RESOLUCION DEL ADN ENTRANTE, GENERANDO ASI UNA BATERIA DE HERRAMIENTAS DE MODIFICACION GENETICA VALIDAS PARA BACTERIAS TAN INTERESANTES COMO LACTOBACILLUS PARABUCHNERI O STAPHYLOCOCCUS EPIDERMIDIS,LA MOLECULA DE ADN TRANSFERIDA POR CONJUGACION ENTRA EN LA CELULA RECEPTORA GUIADA POR LA RELAXASA CONJUGATIVA, LLAMADA TRWC EN NUESTRO SISTEMA MODELO DEL PLASMIDO R388, EN PROYECTOS PREVIOS HEMOS REPORTADO QUE TRWC ES ACTIVA EN LA CELULA RECEPTORA, QUE PUEDE SER TANTO PROCARIOTA COMO EUCARIOTA, RECIENTEMENTE, HEMOS DEMOSTRADO QUE TRWC SE PUEDE USAR PARA TRANSFERIR UNA NUCLEASA CAS FUSIONADA, Y ESTA PARTE DE LA PROTEINA DE FUSION ES ACTIVA EN LA BACTERIA RECEPTORA, ESTE IMPORTANTE AVANCE (PATENTE SOLICITADA) ABRE LA POSIBILIDAD DE UTILIZAR LA CONJUGACION COMO UN METODO IN VIVO PARA ENVIAR EL PAQUETE DE HERRAMIENTAS CRISPR-CAS DE MODIFICACION GENETICA, OBVIANDO LA NECESIDAD DE EXPRESION EN LAS CELULAS RECEPTORAS, NUESTRO SEGUNDO OBJETIVO ES EXPLOTAR LAS MUCHAS POSIBILIDADES DE ESTA NOVEDOSA METODOLOGIA, A) PROBANDO SU APLICABILIDAD PARA REALIZAR MUTAGENESIS DIRIGIDA EN BACTERIAS RECEPTORAS, B) ENSAYANDO SU USO EN GENEROS BACTERIANOS QUE RECIENTEMENTE HEMOS AÑADIDO A LA AMPLIA COMUNIDAD PROCARIOTA DE RECEPTORAS CONJUGATIVAS, Y C) EXPLORANDO SU USO PARA LA MODIFICACION GENETICA DE CELULAS HUMANAS, MEDIANTE EL USO DE UN SISTEMA DE ENVIO BASADO EN EL SISTEMA DE SECRECION TIPO IV DE BARTONELLA HENSELAE, PREVIAMENTE DESCRITO EN NUESTRO LABORATORIO,COMO RESULTADO DE ESTE PROYECTO, PRETENDEMOS DESARROLLAR NUEVOS PAQUETES DE HERRAMIENTAS PARA REALIZAR MUTAGENESIS DIRIGIDA EN UN AMPLIO ESPECTRO DE BACTERIAS RECALCITRANTES, Y ESPERAMOS SENTAR LAS BASES DE UN SISTEMA IN VIVO DE MODIFICACION GENETICA DIRIGIDA DE CELULAS HUMANAS, PARA ILUSTRAR EL INTERES BIOTECNOLOGICO DE NUESTRO ABORDAJE, SE INCLUYE EN ESTA PROPUESTA UNA CARTA DE APOYO DE ACIES BIO, UNA EMPRESA DE BIOTECNOLOGIA BASADA EN LA INVESTIGACION MICROBIANA, CONJUGACION BACTERIANA\CRISPR-CAS\ENDONUCLEASA CAS12A\RELAXASA TRWC\PLASMIDO R388\MODIFICACION GENETICA DIRIGIDA\LACTOBACILLAE\STAPHYLOCOCCI\STREPTOMYCES\GRAS