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BIO2014-54411-C2-2-R

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DISEÑO MATEMATICO DE ESTRATEGIAS PARA LA INGENIERIA METABOLICA DE CEPAS DE E. CO...

DISEÑO MATEMATICO DE ESTRATEGIAS PARA LA INGENIERIA METABOLICA DE CEPAS DE E. COLI COMO PLATAFORMA PARA BIO-RUTAS SINTETICAS ROBUSTAS EL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES EL DISEÑO DE ESTRATEGIAS DE MODIFICACION GENETICA QUE, BASADAS EN LOS PRINCIPIOS DE LA INGENIERIA METABOLICA, PERMITA EL MEJORAMIENTO GENERAL DE PROCESOS BIOTECNOLOGICOS Y DE BIOSINTESIS DE PRODUCTO... ver más

01/01/2014

ULL

85K€

Presupuesto del proyecto: 85K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE LA LAGUNA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 686

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2014-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Características del participante

Este proyecto no cuenta con búsquedas de partenariado abiertas en este momento.

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Participantes

ULL

Lider

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE LA LAGUNA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 686

Presupuesto del proyecto 85K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto EL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES EL DISEÑO DE ESTRATEGIAS DE MODIFICACION GENETICA QUE, BASADAS EN LOS PRINCIPIOS DE LA INGENIERIA METABOLICA, PERMITA EL MEJORAMIENTO GENERAL DE PROCESOS BIOTECNOLOGICOS Y DE BIOSINTESIS DE PRODUCTOS CONDUCIDOS CON LA BACTERIA E, COLI, DICHAS ESTRATEGIA CONSISTIRA EN LA IDENTIFICACION DE LOS CAMBIOS GENETICOS QUE BIEN PLANEADOS Y REALIZADOS DE MANERA COORDINADA GENERARIAN CON ALTA PROBABILIDAD UNA PLATAFORMA MICROBIOLOGICA EFICIENTE, EN LA CUAL SE INSERTARIAN VARIOS MODULOS REGULADORES SINTETICOS DISEÑADOS AD-HOC, ESTA ESTRATEGIA DEBERA TENER TRES CARACTERISTICAS PRINCIPALES, EN PRIMER LUGAR, LOS CAMBIOS DEBEN GARANTIZAR LA SINTESIS DE METABOLITOS SECUNDARIOS DE INTERES CON UN MINIMO SOBRE-FLUJO DEL ACCOA, INCLUSO EN CONDICIONES DE ALTA CONCENTRACION DE GLUCOSA, EN SEGUNDO LUGAR, LA CEPA MODIFICADA DEBE SER VIABLE AUN EN CONDICIONES CAMBIANTES DE LAS FUENTES DE CARBONO (CAMBIO DE GLUCOSA A GLICEROL) Y, EN TERCER LUGAR, DEBE SER CAPAZ DE SOPORTAR LAS CONDICIONES DE ESTRES HABITUALES DE OPERACION EN LOS BIOREACTORES (ESTRES OXIDATIVO, OSMOTICOS, TERMICO, ETC),SE SEGUIRA PARA ELLO UNA APROXIMACION RACIONAL Y SISTEMICA, BASADA EN EL DESARROLLO DE MODELOS MATEMATICOS DE LOGICA MULTIVALUADA, SE CONSTRUIRA UN MODELO MATEMATICO DEL METABOLISMO DE E, COLI QUE DE CUENTA DE LA REGULACION DE LA ACETILACION/DESACETILACION DEL PROTEOMA, EN ESTE MODELO SE INTEGRARA LA INFORMACION DISPONIBLE EN BASES DE DATOS JUNTO CON LOS DATOS EXPERIMENTALES OBTENIDOS POR EL OTRO GRUPO COORDINADO DE LA UNIVERSIDAD DE MURCIA, EL MODELO INCLUIRA LA REGULACION DE LA RED GLOBAL DE LOS FACTORES DE TRANSCRIPCION INVOLUCRADOS, ESPECIFICAMENTE, CRP Y RCSB, ESTOS FACTORES DE TRASNCRIPCION INFLUYEN EN LA EXPRESION DE LAS ENZIMAS INVOLUCRADAS EN EL METABOLISMO DE CARBOHIDRATOS, CON LA PARTICULARIDAD QUE TANTO LAS ENZIMAS COMO LOS FACTORES DE TRANSCRIPCION, SON REGULADOS EN SU ACTIVIDAD A TRAVES DE MECANISMOS DE ACETILACION-DESACETILACION, PUESTO QUE LA SUCCINILACION COMPITE POR LA MAYORIA DE LOS SITIOS POTENCIALMENTE ACETILABLES EN EL PROTEOMA, MIENTRAS QUE LA FOSFORILACION PUEDE CONDICIONAR TANTO LA SUCCINILACION COMO LA ACETILACION, EL MODELO TAMBIEN INCLUIRA LA RED GLOBAL DE FOSFORILACION-DESFOSFORILACION DEL PROTEOMA Y DEL PROTEOMA SUCCINILADO, LAS PREDICCIONES DEL MODELO SE VALIDARAN FRENTE A NUEVOS DATOS EXPERIMENTALES PROPORCIONADOS POR EL GRUPO COORDINADO, EL MODELO ASI OBTENIDO SE RELACIONARA E INTEGRARA CON OTRO MODELO DE E, COLI DE ESCALA GENOMICA, SERA EN ESTE MODELO AMPLIADO EN EL QUE SE REALIZARA EL ANALISIS DE INGENIERIA METABOLICA QUE PERMITIRA IDENTIFICAR LAS CARACTERISTICAS REGULADORES QUE OPERAN EN LOS PROCESOS DE ACETILACION-DESACETILACION, BASANDONOS ENTONCES EN ESTOS RESULTADOS, SE LLEVARA A CABO UN ANALISIS DESDE LA PERSPECTIVA DE LA BIOLOGIA SINTETICA CON EL OBJETIVO DE DISEÑAR MODULOS DE REGULACION SINTETICOS CAPACES DE REDIRIGIR LAS SEÑALES DE REGULACION Y EL METABOLISMO HACIA LA DIRECCION DESEADA, ACETILACIÓN-DESACETILACIÓN\FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN DE REGULACIÓN\MODELIZACIÓN LÓGICA MULTIVALUADA\BIOLOGÍA DE SISTEMAS\E. COLI\PROTEOMA

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