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CGL2011-27866

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VARIABILIDAD POBLACIONAL DE REGIONES GENOMICAS IDENTIFICADAS EN GWAS SOBRE RIESG...

VARIABILIDAD POBLACIONAL DE REGIONES GENOMICAS IDENTIFICADAS EN GWAS SOBRE RIESGO CARDIOVASCULAR: RELACIONES GENOTIPO-FENOTIPO E INFERENCIAS EVOLUTIVAS Y EPIDEMIOLOGICAS RECIENTEMENTE, ESTUDIOS GWAS (GENOME-WIDE ASSOCIATION STUDIES) HAN IDENTIFICADO NUEVAS REGIONES GENOMICAS ASOCIADAS CON EL RIESGO PARA ENFERMEDADES CARDIOVASCULARES (CAD). ESTOS ESTUDIOS SE HAN REALIZADO EN MUESTRAS COSMOPOLITAS D... ver más

01/01/2011

97K€

Presupuesto del proyecto: 97K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE BARCELONA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 327

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2011-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE BARCELONA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 327

Presupuesto del proyecto 97K€

Descripción del proyecto RECIENTEMENTE, ESTUDIOS GWAS (GENOME-WIDE ASSOCIATION STUDIES) HAN IDENTIFICADO NUEVAS REGIONES GENOMICAS ASOCIADAS CON EL RIESGO PARA ENFERMEDADES CARDIOVASCULARES (CAD). ESTOS ESTUDIOS SE HAN REALIZADO EN MUESTRAS COSMOPOLITAS DE CONSORCIOS INTERNACIONALES, PERO NO HAN SIDO REPLICADOS EN MUESTRAS CON DEFINICION SOCIAL, GEOGRAFICA Y/O FENOTIPICA PRECISA. MUCHOS DE LOS ALELOS DE RIESGO IDENTIFICADOS EN ESTAS REGIONES PRESENTAN ELEVADAS FRECUENCIAS LO QUE SUGIERE UN PAPEL SUBSTANCIAL DEL RIESGO ATRIBUIBLE A LA POBLACION (POPULATION-ATTRIBUTABLE RISK). SIN EMBARGO, NI LAS FRECUENCIAS DE LAS VARIANTES DE RIESGO NI LOS PATRONES DE VARIACION GENETICA SUBYACENTE A DICHAS VARIANTES HAN SIDO ANALIZADOS SISTEMATICAMENTE EN POBLACIONES HUMANAS.EN ESTE CONTEXTO, EL PRESENTE PROYECTO PROPONE EXPLORAR EN DETALLE LA VARIACION DE ALGUNAS REGIONES DEL GENOMA HUMANO Y SUS IMPLICACIONES EN LA HISTORIA NATURAL DE LA ENFERMEDAD Y LA BIOLOGIA DE LAS POBLACIONES HUMANAS.PARA ELLO SE PROPONE EL ANALISIS DE LAS CUATRO REGIONES GENOMICAS, 9P21.3, 1P13.3, 1Q41 Y 10Q11, ASOCIADAS CON RIESGO CAD Y REPLICADAS EN GWAS INDEPENDIENTES. LA VARIACION MOLECULAR DE ESTAS REGIONES SERA ANALIZADA EN DISTINTAS MUESTRAS POBLACIONALES DE LA REGION MEDITERRANEA, INCLUYENDO TAMBIEN OTROS GRUPOS COMO REFERENCIA EXTERNA.LA DISECCION MOLECULAR DE CADA REGION ANALIZADA (500KB-1MB POR REGION, EN FUNCION DE LOS PATRONES DE DESEQUILIBRIO DE LIGAMIENTO, LD) SE LLEVARA A CABO MEDIANTE EL ANALISIS DE UNA BATERIA DE SNPS, STRS Y CNVS. ESTOS ANALISIS INCLUIRAN LA VARIACION GENOTIPICA, HAPLOTIPICA Y PATRONES DE LD.LA VARIACION POBLACIONAL DE ESTAS CUATRO REGIONES GENOMICAS SE ANALIZARA EN TRES COLECTIVOS MUESTRALES DISTINTOS, INCLUYENDO:A) 20 POBLACIONES DE DISTINTOS PAISES MEDITERRANEOS, DISPONIBLES EN EL LABORATORIO PARA I) CARACTERIZAR LOS PATRONES DE VARIACION EN UN CONJUNTO IMPORTANTE DE POBLACIONES HUMANS Y II) EVALUAR LA UTILIDAD DE LA VARIACION DESCRITA PARA ESTUDIOS FILOGENETICOS, INCLUYENDO LA DETECCION DE DE POSIBLES EFECTOS SELECTIVOS.B) CUATRO MUESTRAS DE NUEVA COLECCION DE POBLACIONES RURALES DE LA ZONA DEL PIRINEO CON INFORMACION FENOTIPICA PRECISA (ESTILO DE VIDA Y VARIABLES SUBCLINICAS Y CLINICAS), CON EL FIN DE IDENTIFICAR POTENCIALES ASOCIACIONES GENOTIPO-FENOTIPO QUE PERMITAN EVALUAR INTERACCIONES GEN-AMBIENTE EN LA SUSCEPTIBILIDAD A LA ENFERMEDAD.C) MUESTRAS DE ENFERMOS CAD (ESPAÑA, CORCEGA, TUNEEZ Y MARRUECOS) DISPONIBLES EN EL LABORATORIO, CON EL OBJETIVO DE I) REPLICAR LAS ASOCIACIONES PROPUESTAS EN LA LITERATURA, Y II) ESTIMAR LA ANTIGUEDAD Y EL POSIBLE ORIGEN, UNICO O MULTIPLE, DE VARIANTES DE RIESGO CAD EN EL MEDITERRANEO.EN CUANTO A RESULTADOS ESPERADOS, ESTE PROYECTO PROPORCIONARA DATOS NUEVOS Y ESENCIALES PARA COMPRENDER LA ESTRUCTURA MOLECULAR (VARIACION GENETICA Y PATRONES DE LD) Y LA HISTORIA EVOLUTIVA DE REGIONES GENOMICAS DE RELEVANCIA EPIDEMIOLOGICA. EL ANALISIS DE LAS NUEVAS MUESTRAS POBLACIONALES APORTARA INFORMACION ADICIONAL SOBRE LAS INTERACCIONES GENES-AMBIENTE QUE NO PUEDEN PROPORCIONAR OTROS DISEÑOS MUESTRALES. MAS ESPECIFICAMENTE, SE ESPERA: I) OBTENER LOS PRIMEROS DATOS SOBRE LA VARIACION POBLACIONAL DE LAS CUATRO REGIONES GENOMICAS PROPUESTAS, II) EVALUAR EL SIGNIFICADO EVOLUTIVO DE LA VARIACION DESCRITA Y SU UTILIDAD PARA ESTUDIOS FILOGENETICOS EN HUMANOS, E III) IDENTIFICAR INTERACCIONES ENTRE LA VARIACION MOLECULAR DE LAS REGIONES ANALIZADAS Y VARIABLES FENOTIPICAS, ASI COMO LA REPLICACION DE LAS ASOCIACIONES GENETICAS PREVIAS WAS\GENETIC ASSOCIATION\CUENCA MEDITERRANEA\GENETICA DE POBLACIONES HUMANS\VARIACION GENETICA\ENFERMEDAD CARDIOVASCULAR

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