Descripción del proyecto
EL DESCUBRIMIENTO DE NUEVAS VARIANTES GENETICAS POTENCIALMENTE ASOCIADAS A LAS ENFERMEDADES CARDIOVASCULARES (ECV) Y A OTRAS ENFERMEDADES CRONICAS SE HA VISTO REVOLUCIONADO EN LOS ULTIMOS AÑOS POR LA APLICACION DE LOS DENOMINADOS ¿GENOME WIDE ASSOCIATION STUDIES (GWAS)¿, ESTUDIOS DE BARRIDO GENOMICO CON VARIOS MILES DE MARCADORES DISTRIBUIDOS A LO LARGO DE TODOS LOS CROMOSOMAS PARA IDENTIFICAR INCLUSO NUEVOS GENES NO CONOCIDOS PREVIAMENTE, POR ELLO, LA CANTIDAD DE DATOS QUE SE GENERAN EN ESTUDIOS (A NIVEL INTERNACIONAL) QUE CUENTAN CON MILES DE MUESTRAS REQUIERE EL DESARROLLO DE PROGRAMAS Y ALGORITMOS ESPECIFICOS DE GESTION DE DATOS Y ANALISIS, DADO EL ELEVADO COSTE ECONOMICO Y LA GRAN PROBABILIDAD DE RESULTADOS FALSOS POSITIVOS QUE SE PUEDEN OBTENER POR EL GRAN NUMERO DE COMPARACIONES ESTADISTICAS QUE SE REALIZAN, SE HA CONSIDERADO NECESARIO AUMENTAR LA CALIDAD METODOLOGICA DE ESTOS ESTUDIOS INCLUYENDO EL ESTUDIO DE LA POSIBLE INFLUENCIA AMBIENTAL (TODOS AQUELLOS FACTORES NO GENETICOS) PLANTEANDO LOS DENOMINADOS ¿GENE-ENVIRONMENT-WIDE INTERACTION STUDIES (GEWIS)¿ EN LOS QUE SE TENGA EN CUENTA, NO SOLO EL GENOTIPO DETERMINADO EN LOS GWAS CLASICOS, SINO TAMBIEN LA CAPACIDAD DE RECOGER INFORMACION Y DE ANALIZAR SIMULTANEAMENTE LOS DATOS AMBIENTALES Y DE SUS POSIBLES INTERACCIONES DETERMINANDO LOS FENOTIPOS DE INTERES, EL INVESTIGADOR PRINCIPAL DEL PROYECTO SOLICITADO ESTA TRABAJANDO DESDE HACE VARIOS AÑOS EN ESTA LINEA DE INTEGRACION DE DATOS GENETICOS Y AMBIENTALES EN LA ETIOLOGIA DE LAS ECV, CONCRETAMENTE EN EL AMBITO DE LAS INTERACCIONES GEN-DIETA, POR ELLO, EL PROYECTO DE INVESTIGACION QUE SE SOLICITA SE ENMARCA EN EL DESARROLLO Y VALIDACION DE NUEVAS METODOLOGIAS Y HERRAMIENTAS DE BIOINFORMATICA APLICADAS A LA INVESTIGACION EN GENOMICA CARDIOVASCULAR, CON UN ESPECIAL ENFASIS EN NUTRIGENOMICA, ASI PUES, SE PRESENTA UN PROYECTO QUE SUPONE UN RETO CIENTIFICO-TECNOLOGICO EN CUANTO A LA INTEGRACION DE DIVERSAS TECNOLOGIAS (SERVICIOS Y APLICACIONES WEB, LAS BASES DE DATOS, LA ADQUISICION DE CONOCIMIENTO, LAS ONTOLOGIAS COMO LOS MODELOS FORMALES DEL CONOCIMIENTO, Y EL SOFTWARE LIBRE), DISCIPLINAS (ERGONOMIA), Y DISTINTOS NIVELES DE DATOS QUE SE PUEDEN MANEJAR (DATOS GENOMICOS, DATOS DE ALIMENTOS Y NUTRIENTES, DATOS DE PACIENTES (ANTROPOMETRICOS, BIOQUIMICOS, CLINICOS, ESTILO DE VIDA), DATOS DE ENFERMEDADES -OBESIDAD Y PATOLOGIAS DIRECTAMENTE ASOCIADAS) QUE SE VALIDARAN CON DATOS REALES OBTENIDOS DE MILES DE MUESTRAS POR INVESTIGADORES BIOMEDICOS EN OTROS PROYECTOS EPIDEMIOLOGICOS Y CLINICOS EN CURSO, POR LO TANTO, EL OBJETIVO DEL PRESENTE PROYECTO ES LA REALIZACION DE UN SISTEMA BIOINFORMATICO QUE IMPLEMENTE UNA NUEVA METODOLOGIA PARA LA CONSTRUCCION INTEGRACION Y VALIDACION DE MODELOS DE CONOCIMIENTO FORMAL DE DATOS GENOMICOS, AMBIENTALES Y FENOTIPICOS PARA LA INVESTIGACION EN GENOMICA NUTRICIONAL APLICADOS AL ESTUDIO DE LAS ECV Y FENOTIPOS RELACIONADOS, TENIENDO EN CUENTA LA RECIENTE PERSPECTIVA DE LOS GWAS Y LOS FUTUROS GEWIS, METAMODELOS\ONTOLOGIAS\INTERACCIONES GEN-GEN\INTERACCIONESGEN-AMBIENTE\BIOINFORMATICA\EPIDEMIOLOGIA GENOMICA\NUTRIGENOMICA