Descripción del proyecto
LA TRANSCRIPCION ES EL PRIMER PASO EN LA EXPRESION GENICA Y ESTA ALTAMENTE REGULADA EN LAS CELULAS VIVAS, LAS ALTERACIONES EN ESTE PROCESO, QUE LLEVAN A CABO LAS ARN POLIMERASAS, TIENEN UN ENORME IMPACTO EN LA HOMEOSTASIS CELULAR Y ESTAN DIRECTAMENTE RELACIONADAS CON EL DESARROLLO DE ENFERMEDADES, LAS LESIONES EN EL DNA INTERFIEREN CON LA TRANSCRIPCION A TRAVES DEL BLOQUEO DE LAS ARN POLIMERASAS, LO QUE PUEDE CONDUCIR A LA MUERTE CELULAR, LA REPARACION DE ADN ACOPLADA A LA TRASCRIPCION (TRANSCRIPTION-COUPLED REPAIR, TCR) ES UNA RUTA CELULAR QUE CORRIGE LAS LESIONES DEL ADN EN LA CADENA MOLDE DE LOS GENES ACTIVOS Y PERMITE QUE LA ARN POLIMERASA REANUDE SU TAREA, LAS DEFICIENCIAS EN ESTA RUTA SE ASOCIAN CON UN ALTO RIESGO DE DESARROLLO DE CANCER, POR TANTO, ESTUDIAR LA TRANSCRIPCION Y LA TCR ES CRUCIAL PARA COMPRENDER LOS MECANISMOS MOLECULARES QUE REGULAN ESTOS PROCESOS CELULARES ESENCIALES,LA PROPUESTA ACTUAL ES UNA CONTINUACION DE NUESTRO PRIMER PROYECTO FINANCIADO POR EL MINISTERIO DE CIENCIA E INNOVACION DENTRO DEL PLAN ESTATAL DE I+D (BFU2010-16336), QUE CULMINO CON LA RECIENTE PUBLICACION DE LA ESTRUCTURA CRISTALOGRAFICA DE LA ARN POLIMERASA I EN LA REVISTA NATURE (FERNANDEZ- TORNERO ET AL,, 2013), AHORA NUESTRO OBJETIVO ES CONTINUAR CON LOS ESTUDIOS SOBRE LA TRANSCRIPCION, A LA VEZ QUE AMPLIAMOS NUESTRO CAMPO DE INTERES HACIA EL ANALISIS DE LA REPARACION DEL ADN ACOPLADA A LA TRANSCRIPCION,EL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO DE INVESTIGACION ES LA CARACTERIZACION ESTRUCTURAL Y FUNCIONAL DE PROTEINAS Y COMPLEJOS ESENCIALES PARA LA TRANSCRIPCION Y LA TCR, LA PROPUESTA SE ESTRUCTURA EN TRES BLOQUES DE TRABAJO, CADA UNO DE LOS CUALES SE OCUPA DE UN ASPECTO ESPECIFICO DE DICHOS PROCESOS, EN PRIMER LUGAR, TENEMOS INTENCION DE INVESTIGAR LOS EVENTOS MOLECULARES QUE CONTROLAN LA ACTIVACION DE LA ARN POLIMERASA I Y PERMITEN QUE ESTA ENZIMA TRANSCRIBA LOS GENES DEL ARN RIBOSOMICO, EN SEGUNDO LUGAR, ESTUDIAREMOS VARIOS FACTORES QUE REGULAN LA SINTESIS DEL ARN MENSAJERO QUE REALIZA LA ARN POLIMERASA II, FINALMENTE, PLANEAMOS COMENZAR LA CARACTERIZACION MOLECULAR DE LA TCR A TRAVES DEL ESTUDIO DE LA PROTEINA XPG, UNA ENDONUCLEASA INVOLUCRADA EN LA ELIMINACION DE LESIONES QUE BLOQUEAN LA TRANSCRIPCION,EL PROYECTO QUE PROPONEMOS PRETENDE SUPERAR ESTE DESAFIO A TRAVES DE UN ENFOQUE ESTRUCTURAL INNOVADOR QUE COMBINA VARIAS TECNICAS EXPERIMENTALES PARA PROPORCIONAR UNA VISION INTEGRADORA DE LA TRANSCRIPCION Y LA TCR, NUESTRO ENFOQUE COMBINA POTENTES METODOS ESTRUCTURALES COMO LA CRISTALOGRAFIA DE RAYOS X Y LA MICROSCOPIA ELECTRONICA, ESTUDIOS GENETICOS Y BIOQUIMICOS CLASICOS, Y TECNICAS EMERGENTES COMO LA ESPECTROMETRIA DE MASAS NATIVAS Y EL FRET,EL TRABAJO PROPUESTO CONTRIBUIRA A UNA MEJOR COMPRENSION DE LA CONEXION ENTRE LA SINTESIS DE ARN Y LA REPARACION DEL ADN, ASI COMO AL DESARROLLO DE ESTRATEGIAS PARA ESTUDIAR COMPLEJOS PROTEICOS Y SUS INTERACCIONES CON OTRAS MACROMOLECULAS, POR OTRA PARTE, PUESTO QUE LAS PROTEINAS INVESTIGADAS ESTAN RELACIONADAS CON EL DESARROLLO DE TUMORES, LAS ESTRUCTURAS OBTENIDAS PODRIAN SERVIR DE PUNTO DE PARTIDA PARA EL DISEÑO RACIONAL DE FARMACOS, TRANSCRIPCIÓN\ LESIÓN EN ADN\ REPARACIÓN ACOPLADA A TRASCRIPCIÓN\ ARN POLIMERASA\ FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN\ ENDONUCLEASA\ CRISTALOGRAFÍA DE RAYOS X\ MICROSCOPÍA ELECTRÓNICA\ COMPLEJO MACROMOLECULAR