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PGC2018-097019-B-I00

Financiado

PROTEOMICA POSTTRADUCCIONAL: APLICACIONES EN INVESTIGACION CARDIOVASCULAR

LAS MODIFICACIONES POSTTRADUCCIONALES (PTM) DE PROTEINAS DESEMPEÑAN UN PAPEL PIVOTAL EN LA FISIOLOGIA HUMANA Y EN LA ENFERMEDAD, Y SU ESTUDIO CONSTITUYE UNO DE LOS MAYORES RETOS DE LA PROTEOMICA BASADA EN ESPECTROMETRIA DE MASAS (... ver más

01/01/2018

CENTRO NACIONAL DE...

254K€

Presupuesto del proyecto: 254K€

Líder del proyecto

CENTRO NACIONAL DE INVESTIGACIONES CARDIOVASC... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5 | 28M€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2018-01-01

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Participantes

CENTRO NACIONAL DE INVESTIGA...

Lider

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Líder del proyecto

CENTRO NACIONAL DE INVESTIGACIONES CARDIOVASC...

TRL 4-5 | 28M€

Presupuesto del proyecto 254K€

Descripción del proyecto LAS MODIFICACIONES POSTTRADUCCIONALES (PTM) DE PROTEINAS DESEMPEÑAN UN PAPEL PIVOTAL EN LA FISIOLOGIA HUMANA Y EN LA ENFERMEDAD, Y SU ESTUDIO CONSTITUYE UNO DE LOS MAYORES RETOS DE LA PROTEOMICA BASADA EN ESPECTROMETRIA DE MASAS (MS), RECIENTEMENTE SE HAN DESARROLLADO ALGORITMOS BASADOS EN BUSQUEDAS ULTRATOLERANTES (ABIERTAS) EN BASES DE DATOS, QUE ESTAN COMENZADO A ABRIR EL CAMINO AL ANALISIS NO SESGADO DE PTM MEDIANTE PROTEOMICA DE ALTO RENDIMIENTO, NO OBSTANTE, ESTOS METODOS SOLO IDENTIFICAN LA MITAD DE LAS MODIFICACIONES POTENCIALMENTE DETECTABLES POR MS Y NO MAPEAN EL SITIO MODIFICADO, ADEMAS, SE ECHAN EN FALTA METODOS SISTEMATICOS PARA EL ANALISIS CUANTITATIVO DE PTM, NUESTRO GRUPO HA PUBLICADO MUY RECIENTEMENTE UN ALGORITMO DE BUSQUEDA ABIERTA (COMET-PTM) QUE PERMITE UNA IDENTIFICACION Y CUANTIFICACION NO SESGADAS DE LA GRAN MAYORIA DE LAS PTM DETECTABLES POR MS EN ESTUDIOS A GRAN ESCALA CON UNAS PRESTACIONES SIN PRECEDENTES (CELL REP, 2018, 23: 3685 3697), EL PRINCIPAL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES CONTINUAR EL DESARROLLO DE ESTA PROMETEDORA TECNOLOGIA PARA EL ANALISIS NO SESGADO DE TODOS LOS TIPOS DE PTMS CON OBJETO DE EXPLOTAR TODO SU POTENCIAL TANTO EN INVESTIGACION BASICA COMO APLICADA, PLANEAMOS DESARROLLAR NUEVAS APROXIMACIONES PARA LA IDENTIFICACION DE LA MODIFICACION Y PARA LA LOCALIZACION DEL SITIO MODIFICADO, PARA LLEVAR A CABO LA CUANTIFICACION DE PTMS EN NUMEROS MUY ALTOS DE MUESTRAS Y PARA HACER EL ALGORITMO COMPATIBLE CON LAS APROXIMACIONES DE MS INDEPENDIENTES DE DATOS (DATA-INDEPENDENT), TAMBIEN APLICAREMOS ESTA TECNOLOGIA PARA LLEVAR A CABO UN BARRIDO EXHAUSTIVO DE TODOS LOS TIPOS DE PTM QUE PUEDAN JUGAR UN PAPEL EN EL ENSAMBLAJE Y DESENSAMBLAJE DE LOS SUPERCOMPLEJOS DE LA CADENA DE TRANSPORTE DE ELECTRONES MITOCONDRIAL, UN PROCESO CLAVE EN LA REGULACION DEL METABOLISMO ENERGETICO Y QUE TODAVIA NO SE CONOCE BIEN, PARA ELLO EXPLOTAREMOS CONJUNTAMENTE LA TECNOLOGIA BLUE-DIS QUE HEMOS DESARROLLADO PARA LLEVAR A CABO ANALISIS PROFUNDOS DE PERFILES DE COMPLEXOMA (NATURE, 2016, 539: 579-582) Y NUESTRA TECNOLOGIA COMET-PTM PARA LA IDENTIFICACION DE PTM, ANALIZAREMOS PREPARACIONES MITOCONDRIALES DE DIFERENTES TEJIDOS Y FONDOS GENETICOS EN RATON (QUE DIFIEREN EN SU CAPACIDAD DE FORMAR SUPERCOMPLEJOS CONTENIENDO CIII Y CIV) Y TAMBIEN CELULAS WT Y MUTANTES DE DIFERENTES PROTEINAS DE LOS COMPLEJOS RESPIRATORIOS, TAMBIEN VALIDAREMOS EL PAPEL BIOLOGICO DE ESAS MODIFICACIONES, PARTICULARMENTE EN LA FORMACION DE SUPERCOMPLEJOS CONTENIENDO CIII Y CIV,FINALMENTE, EXPLORAREMOS EL POTENCIAL DE ESTA TECNOLOGIA PARA DESCUBRIR PTM QUE PUEDAN USARSE COMO BIOMARCADORES DE ENFERMEDADES HUMANAS, PARA ELLO REANALIZAREMOS RESULTADOS DE PROTEOMICA OBTENIDOS EN PLASMA DE UNA COHORTE DE INDIVIDUOS (DOS VISITAS CON N=476 EN CADA UNA, 714 CARRERAS) DEL ESTUDIO PESA DEL CNIC PARA BUSCAR PTM BIOMARCADORAS DE ATEROSCLEROSIS SUBCLINICA, TAMBIEN LLEVAREMOS A CABO ANALISIS SISTEMATICOS DE PTM EN MUESTRAS HUMANAS DE PARED AORTICA SANAS Y CON LESIONES ATEROSCLEROTICAS, LOS BIOMARCADORES SE VALIDARAN EN MUESTRAS DE PLASMA DE UNA COHORTE DEL ESTUDIO ARAGON WORKERS HEALTH STUDY (AWHS) (N=500), MODIFICACIONES POSTTRADUCCIONALE\PROTEÓMICA\ESPECTROMETRÍA DE MASAS\BIOINFORMÁTICA\MITOCONDRIA\SUPERCOMPLEJOS\ATEROSCLEROSIS\BIOMARCADORES

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