DESARROLLO DE ESTRATEGIAS AVANZADAS PARA EL ANALISIS DINAMICO DEL PROTEOMA PROFU...
DESARROLLO DE ESTRATEGIAS AVANZADAS PARA EL ANALISIS DINAMICO DEL PROTEOMA PROFUNDO: APLICACION EN PROTEOMICA CARDIOVASCULAR
AVANCES MUY RECIENTES HAN DEMOSTRADO QUE YA ES POSIBLE LA CUANTIFICACION DE PROTEOMAS COMPLETOS DE LINEAS CELULARES HUMANAS MEDIANTE ESPECTROMETRIA DE MASAS. ADEMAS, HAY EVIDENCIAS RECIENTES QUE SUGIEREN QUE APROVECHANDO LA INFORM...
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Descripción del proyecto
AVANCES MUY RECIENTES HAN DEMOSTRADO QUE YA ES POSIBLE LA CUANTIFICACION DE PROTEOMAS COMPLETOS DE LINEAS CELULARES HUMANAS MEDIANTE ESPECTROMETRIA DE MASAS. ADEMAS, HAY EVIDENCIAS RECIENTES QUE SUGIEREN QUE APROVECHANDO LA INFORMACION PREVIAMENTE ADQUIRIDA ES POSIBLE ACELERAR NOTABLEMENTE EL ANALISIS DE PROTEOMAS MUY COMPLEJOS. POR TANTO, ESTAS TECNICAS ESTAN ABRIENDO EL CAMINO AL ANALISIS RUTINARIO, RAPIDO Y PROFUNDO DE PROTEOMAS PRACTICAMENTECOMPLETOS. ESTE PODEROSO TIPO DE ANALISIS, APLICADO AL CAMPO CARDIOVASCULAR, SERIA CAPAZ DE REVELAR NUEVAS CLAVES SOBRE EL MECANISMO MOLECULAR DE LAS ENFERNEDADES VASCULARES Y PERMITIRIA LA IDENTIFICACION DE FACTORES NO DESCUBIERTOS TODAVIA, QUE PODRIAN USARSE COMO DIANAS FARMACOLOGICASO COMO BIOMARCADORES EN POTENCIA.EN ESTE PROYECTO, QUE CONTINUA LA FRUCTIFERA LINEA DE TRES PROYECTOS ANTERIORES, PRETENDEMOS DESARROLLAR NUEVOS PROCEDIMIENTOS PARA EL ANALISIS RAPIDO DE PROTEOMAS CASI COMPLETOS, MEJORAR LOS ALGORITMOS EXISTENTES PARA EL ANALISIS ESTADISTICO Y PARA LA INTEGRACION DE DATOS CUANTITATIVOS Y SU INTERPRETACION MEDIANTE HERRAMIENTAS DE BIOLOGIA DE SISTEMAS, Y DESARROLLAR NUEVOS METODOS PARA EL ANALISIS PROFUNDO DEL REDOXOMA DE GRUPOS CYS. EL DESARROLLO DE ESTAS NUEVAS TECNICAS Y SU VALIDACION SE LLEVARA A CABO CONCENTRANDO EL ESTUDIO EN TRES MODELOS BIOLOGICOS DEL MAYOR INTERES CARDIOVASCULAR. EN UNA PRIMERA FASE, LOS PROTEOMAS DE ESTOS MODELOS SE CARACTERIZARAN COMPLETAMENTE UTILIZANDO FRACCIONAMIENTO INTENSIVO, Y LA INFORMACION ADQUIRIDA SE UTILIZARA POSTERIORMENTE PARA LLEVAR A CABO ANALISIS CUANTITATIVOS PROFUNDOS DE ESTOS PROTEOMAS DE FORMA SISTEMATICA. UTILIZANDO UN MAPA DE EVENTOS PEPTIDICOS DE MITOCONDRIAS DE RATON, ANALIZAREMOS EL PAPEL DE LAS ESPECIES REACTIVAS DE OXIGENO EN LA DEGRADACION DE LOS COMPLEJOS DE LA FOSFORILACION OXIDATIVA Y EL IMPACTO DE LA ISQUEMIA-REPERFUSION Y EL PAPEL PROTECTOR DEL RECONDICIONAMIENTO SOBRE EL DAÑO OXIDATIVO EN PROTEINAS MITOCONDRIALES. TAMBIEN HAREMOS UN ANALISIS PORMENORIZADO DE LOS DETERMINANTES MITOCONDRIALES DE UN CASO ESPECIFICO DE HIPERTROFIA CARDIACA MALADAPTATIVA, Y DETERMINAREMOS LAS DIANAS DE DAÑO OXIDATIVO PRODUCIDO EN MITOCONDRIAS DE FIBROBLASTOS Y LEUCOCITOSEN MODELOS ANIMALES DE ENVEJECIMIENTO PREMATURO. TAMBIEN NOS CONCENTRAREMOS EN EL ANALISIS DEL PROTEOMA EXOSOMAL DE CELULAS T HUMANAS. CON ESTE PROTEOMA EXPLORAREMOS EL COMPORTAMIENTO DINAMICO DE LOS EXOSOMAS DURANTE LA ACTIVACION DE CELULAS T Y SU PAPEL EN EL TRANSPORTE DE MIRNA DE LA CELULA T A LA CELULA PRESENTADORA DE ANTIGENO. FINALMENTE, HAREMOS UNA CARACTERIZACION MUY PROFUNDA DEL PROTEOMA DE CELULAS DEL MUSCULO LISO VASCULAR MEDIANTE FRACCIONAMIENTO SUBCELULAR, INCLUYENDO TAMBIEN EL SECRETOMA. ESTE MODELO SE USARA PARA ESTUDIAR EL REMODELADO VASCULARPRODUCIDO POR ANGIOTENSINA-II EN RATONES RCAN-/- , QUE CONSTITUYEN UN MODELO DE RESISTENCIA AL ANEURISMA Y LA RESTENOSIS. EL PAPEL COMO POTENCIALES BIOMARCADORES DE LOS EFECTORES O DIANAS DE DAÑO Y/O MODIFICACION QUE SE DESCUBRAN EN ESTOS ESTUDIOS SERAN POSTERIORMENTE ESTUDIADOS UTILIZANDO TECNICAS DE PROTEOMICA DIRIGIDA.
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