Descripción del proyecto
LA PROTEOMICA BASADA EN ESPECTROMETRIA DE MASAS HA EXPERIMENTADO UN FORMIDABLE DESARROLLO EN LOS ULTIMOS AÑOS Y LA APLICACION DE ESTA TECNOLOGIA EN BIOMEDICINA CARDIOVASCULAR Y EN OTROS CAMPOS ESTA PRODUCIENDO RESULTADOS CON UN GRADO DE PROFUNDIDAD, PRECISION Y DETALLE MOLECULAR SIN PRECEDENTES, ABRIENDO CON FRECUENCIA NUEVOS CAMINOS PARA EL TRATAMIENTO DE ENFERMEDADES, SIN EMBARGO, TODAVIA PERMANECEN VARIOS RETOS SIN RESOLVER QUE IMPIDEN LA EXPLOTACION DE ESTA TECNOLOGIA EN TODO SU POTENCIAL, EN ESTE PROYECTO PRETENDEMOS CONTINUAR LA FRUCTIFERA LINEA DE DESARROLLO BIOTECNOLOGICO DEL GRUPO, COMENZADA EN 2004, QUE HA DADO LUGAR A IMPORTANTES AVANCES EN ESTE CAMPO, POR UN LADO, EL PROYECTO ABORDA EL DESARROLLO DE NUEVAS ESTRATEGIAS PROTEOMICAS, QUE INCLUYEN A) EL DESARROLLO DE FLUJOS DE TRABAJO AVANZADOS PARA LA IDENTIFICACION, LA CUANTIFICACION Y EL ANALISIS MEDIANTE BIOLOGIA DE SISTEMAS, BASADOS EN ALGORITMOS ESTADISTICOS Y BIOINFORMATICOS DESARROLLADOS EN PROYECTOS ANTERIORES; B) EL DESARROLLO DE NUEVOS ALGORITMOS PARA LA IDENTIFICACION Y CUANTIFICACION A GRAN ESCALA DE MODIFICACIONES POSTTRADUCCIONALES DE FORMA RUTINARIA; C) EL DESARROLLO DE PROCEDIMIENTOS DE QUIMICA DE PROTEINAS PARA LA CUANTIFICACION PRECISA DE MODIFICACIONES REVERSIBLES REDOX EN CYS, TOTALMENTE COMPATIBLES CON ESTUDIOS PROTEOMICOS TOTALES, Y D) LA MEJORA DEL ANALISIS A NIVEL DE PEPTIDO EN EXPERIMENTOS DIS, UNA NUEVA TECNICA DE ADQUISICION DE DATOS TIPO DATA-INDEPENDENT DESARROLLADA EN NUESTRO LABORATORIO, POR OTRO LADO, EL PROYECTO PLANEA APLICAR ESTOS DESARROLLOS EN DOS TEMAS PARTICULARMENTE RELEVANTES EN EL AREA CARDIOVASCULAR, EN UNO DE ELLOS PLANEAMOS DETERMINAR, USANDO LAS ESTRATEGIAS PROTEOMICAS AVANZADAS, EL MECANISMO MOLECULAR QUE SUBYACE A LA PAUTA EDEMATOSA BIFASICA QUE TIENE LUGAR TRAS INFARTO EN CORAZON DE CERDO, Y AL EFECTO PRODUCIDO POR TRATAMIENTOS CONDICIONANTES ATENUAN EL DAÑO MOLECULAR PROVOCADO POR LA ISQUEMIA/REPERFUSION, Y EL IMPACTO DE ESOS EVENTOS EN EL PROTEOMICA PLASMATICO CIRCULANTE, EN EL OTRO TEMA, USAREMOS BLUE-DIS, UNA NUEVA ESTRATEGIA DESARROLLADA EN NUESTRO LABORATORIO, PARA ABORDAR DESDE UNA NUEVA PERSPECTIVA LA ESTRUCTURA DEL INTERACTOMA, DEL COMPLEXOMA Y DEL SUPERCOMPLEXOMA MITOCONDRIALES DE RATON, Y PARA IDENTIFICAR NUEVOS FACTORES O MODIFICACIONES, INCLUYENDO MODIFICACIONES REVERSIBLES REDOX EN CYS, QUE MODULEN EL ENSAMBLAJE DE COMPLEJOS Y SUPERCOMPLEJOS, PROTEÓMICA\BIOLOGÍA SISTEMAS\MODIFICACIONES POSTRADUCCIONALES\CARDIOVASCULAR\INFARTO\MITOCONDRIA