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PID2021-122348NB-I00

Financiado

ANALISIS DE MODIFICACIONES POSTTRADUCCIONALES EN ENFERMEDADES ASOCIADAS A REMODE...

ANALISIS DE MODIFICACIONES POSTTRADUCCIONALES EN ENFERMEDADES ASOCIADAS A REMODELADO VASCULAR LAS MODIFICACIONES POSTTRADUCCIONALES (PTM) DE PROTEINAS DESEMPEÑAN UN PAPEL PIVOTAL EN LA FISIOLOGIA HUMANA Y EN LA ENFERMEDAD, Y SU ESTUDIO CONSTITUYE UNO DE LOS MAYORES RETOS DE LA PROTEOMICA BASADA EN ESPECTROMETRIA DE MASAS (... ver más

01/01/2021

CENTRO NACIONAL DE...

254K€

Presupuesto del proyecto: 254K€

Líder del proyecto

CENTRO NACIONAL DE INVESTIGACIONES CARDIOVASC... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5 | 28M€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2021-01-01

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Participantes

CENTRO NACIONAL DE INVESTIGA...

Lider

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Líder del proyecto

CENTRO NACIONAL DE INVESTIGACIONES CARDIOVASC...

TRL 4-5 | 28M€

Presupuesto del proyecto 254K€

Descripción del proyecto LAS MODIFICACIONES POSTTRADUCCIONALES (PTM) DE PROTEINAS DESEMPEÑAN UN PAPEL PIVOTAL EN LA FISIOLOGIA HUMANA Y EN LA ENFERMEDAD, Y SU ESTUDIO CONSTITUYE UNO DE LOS MAYORES RETOS DE LA PROTEOMICA BASADA EN ESPECTROMETRIA DE MASAS (MS). HEMOS DESARROLLADO RECIENTEMENTE UN NUEVO ALGORITMO DE BUSQUEDA ABIERTA (COMET-PTM) QUE PERMITE UNA IDENTIFICACION Y CUANTIFICACION NO SESGADAS DE PTM MEDIANTE MS EN ESTUDIOS A GRAN ESCALA CON UNAS PRESTACIONES SIN PRECEDENTES [CELL REP, 2018. 23: 3685 3697]. NUESTRO LABORATORIO HA APLICADO EXITOSAMENTE ESTA TECNOLOGIA AL ESTUDIO DE PTM ASOCIADAS A ENFERMEDADES VASCULARES [EBIOMEDICINE (2019), 43:43-53] [CIRCULATION (2019), 139:949-64]. SIN EMBARGO, VARIOS PROBLEMAS ESPECIFICOS PERMANECEN SIN RESOLVER, INCLUYENDO, ENTRE OTROS, LA EXCESIVA DILUCION DE LA INFORMACION CUANTITATIVA Y LA PRESENCIA DE CAMBIOS ZONALES NO ESPECIFICOS DE PTM, QUE DIFICULTAN LA APLICACION DE ESTA TECNICA EN ESTUDIOS A GRAN ESCALA. UNO DE LOS OBJETIVOS DE ESTE PROYECTO ES MEJORAR ESTA PROMETEDORA TECNOLOGIA PARA EL ANALISIS LIBRE DE HIPOTESIS DE TODO TIPO DE PTM, EXPLOTANDO TODO SU POTENCIAL EN PROYECTOS DE INVESTIGACION BASICA Y APLICADA. APROVECHANDO NUEVOS ALGORITMOS DISEÑADOS POR EL GRUPO [MOL CELL PROTEOMICS (2016), 15:1740-60] [BIOINFORMATICS (2019), 35:1594-6] PRETENDEMOS DESARROLLAR NUEVAS VIAS PARA INTEGRAR LA INFORMACION CUANTITATIVA Y PARA DETECTAR CAMBIOS ESPECIFICOS Y ZONALES, Y VALIDAR LAS NUEVAS HERRAMIENTAS EN PROYECTOS COLABORATIVOS DE ANALISIS DE PTM EN CURSO. EL SEGUNDO ES APLICAR ESTA TECNOLOGIA AL ESTUDIO DE ENFERMEDADES RELACIONADAS CON EL REMODELADO VASCULAR, ESPECIFICAMENTE ATEROSCLEROSIS (AT) Y SINDROME DE MARFAN (MFS) (UNA FORMA DE ANEURISMA TORACICO). USAREMOS EL MODELO DE CERDO TRANSGENICO PCSK9 PARA ESTUDIAR LA PAUTA DE CAMBIOS EN PTM EN LA PARED VASCULAR EN SITIOS ATEROSUSCEPTIBLES -EXPUESTOS A DISTURBED SHEAR STRESS (TENSION DE DESLIZAMIENTO DISTORSIONADA)- EN COMPARACION CON REGIONES EXPUESTAS A LINEAR SHEAR STRESS (TENSION DE DESLIZAMIENTO LINEAL). TAMBIEN DETERMINAREMOS QUE PTM SE ASOCIAN CON LA ACTIVIDAD DE LA PLACA ATEROSCLEROTICA Y LA COMPARTIMENTALIZACION TISULAR Y CELULAR DE PTM EN RELACION AL DESARROLLO DE LA AT. TAMBIEN CARACTERIZAREMOS LAS MODIFICACIONES QUE SE INDUCEN EN EL AMBIENTE ATEROSCLEROTICO EN LA PROTEINA ALDHA4, UN NUEVO ANTIGENO QUE HEMOS DESCUBIERTO RECIENTEMENTE EN LA RESPUESTA INMUNE ASOCIADA A AT [NATURE (2021), 589:287-92]. LOS RESULTADOS SE VALIDARAN EN HUMANO USANDO DATOS MASIVOS DE MS QUE HEMOS OBTENIDO A PARTIR DE UNA COLECCION DE MUESTRAS DE LESIONES ATEROSCLEROTICAS HUMANAS [J AM COLL CARDIOL (2021)], 77:575-89] Y DE PLASMAS HUMANOS ANALIZADOS DURANTE EL ESTUDIO PESA (N=880). ASIMISMO, PROYECTAMOS DETERMINAR LA PAUTA DE PTMS QUE SE INDUCEN DURANTE EL MSF COMPARANDO MUESTRAS DE ANEURISMAS AORTICOS HUMANOS Y DE TEJIDOS CONTROLES. TAMBIEN ANALIZAREMOS SI DICHAS MODIFICACIONES DE DETECTAN EN PLASMA DE PACIENTES DE MFS (N=95) EN COMPARACION CON PLASMAS CONTROLES (N=40).ESPERAMOS QUE ESTE PROYECTO HARA PLENAMENTE ACCESIBLE A LA COMUNIDAD CIENTIFICA NUESTRA TECNOLOGIA DE ANALISIS DE PTM. TAMBIEN ESPERAMOS OBTENER NUEVA INFORMACION SOBRE EL PAPEL DE LAS PTM EN LAS ENFERMEDADES DE REMODELADO VASCULAR, MEJORANDO NUESTRA COMPRENSION DE SU MECANISMO PATOGENICO, CON POTENCIAL TRASLACIONAL EN EL DISEÑO DE APROXIMACIONES FARMACOLOGICAS Y TAMBIEN DESDE EL PUNTO DE VISTA DE NUEVOS BIOMARCADORES BASADOS EN MODIFICACIONES POSTRADUCCIONALES. ODIFICACIONES POSTTRADUCCIONALES\BIOMARCADORES\SINDROME DE MARFAN\ANEURISMA\ATEROSCLEROSIS\BIOINFORMATICA\ESPECTROMETRIA DE MASAS\PROTEOMICA

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