Descripción del proyecto
LA PRACTICA DE LA MEDICINA SE HA BASADO TRADICIONALMENTE EN EL DIAGNOSTICO DE ENFERMEDADES A TRAVES DE LA HISTORIA DEL PACIENTE, LA EXPLORACION FISICA Y LOS PARAMETROS DE LABORATORIO CLINICO, EN LOS ULTIMOS AÑOS, ESTA PRACTICA SE HA COMPLEMENTADO CON LA INFORMACION GENERADA POR LAS NUEVAS TECNOLOGIAS MOLECULARES, INCLUIDAS LAS TECNICAS DE IMAGEN Y LOS ANALISIS GENOMICOS Y PROTEOMICOS, QUE CONECTAN LA COMPLEJIDAD BIOLOGICA CON LA COMPRENSION DE LOS MECANISMOS PATOLOGICOS, ENTRE ELLOS, LA PROTEOMICA SE HA CONVERTIDO EN UNA HERRAMIENTA CLAVE EN MUCHOS PROYECTOS DE INVESTIGACION TRASLACIONAL TANTO PARA EL DIAGNOSTICO COMO PARA LA COMPRENSION DE LOS MECANISMOS DE LA ENFERMEDAD, VARIOS TRABAJOS RECIENTES DE NUESTRO GRUPO HAN PERMITIDO VALIDAR BIOMARCADORES EN BIOPSIAS LIQUIDAS DE DIFERENTES AREAS CLINICAS CON ALTA SENSIBILIDAD, REPRODUCIBILIDAD, EXACTITUD Y PRECISION, SIN EMBARGO, LA PROTEOMICA BASADA EN ESPECTROMETRIA DE MASAS TIENE CLARAMENTE EL POTENCIAL DE REALIZAR MEDICIONES MULTIPLEXADAS Y ALTAMENTE ESPECIFICAS, EN LAS QUE SE PUEDEN UTILIZAR TODA LA INFORMACION DEL PROTEOMAEN LUGAR DE BIOMARCADORES INDIVIDUALESPARA MEJORAR EL DIAGNOSTICO Y PRONOSTICO DE ENFERMEDADES COMPLEJAS, DE HECHO, LA EFICIENCIA DE LOS BIOMARCADORES INDIVIDUALES NO ES HOMOGENEA DENTRO DE UNA POBLACION DEBIDO A LA DIVERSIDAD GENETICA ENTRE INDIVIDUOS Y LA COMPLEJIDAD BIOLOGICA SUBYACENTE A CIERTAS PATOLOGIAS, EN ESTE SENTIDO, RECIENTEMENTE SE HA PROPUESTO ESTABLECER CORRELACIONES ENTRE LOS PATRONES DEL PROTEOMA OBTENIDOS DE GRANDES COHORTES DE PACIENTES Y SUS FENOTIPOS ASOCIADOS, EN LUGAR DE USAR BIOMARCADORES INDIVIDUALES, EL USO DE LA PROTEOMICA PARA CARACTERIZAR RAPIDAMENTE PROTEOMAS COMPLETOS DE CIENTOS DE BIOPSIAS LIQUIDAS, Y SU EVOLUCION DENTRO DE LA VIDA DE CADA INDIVIDUO, PERMITIRIA NO SOLO ESTABLECER ESTRATEGIAS DE ESTRATIFICACION DE PACIENTES, SINO TAMBIEN EXPLORAR LA DEFINICION MOLECULAR DE LA TRANSICION DE SALUD A LA ENFERMEDAD, POR MUY ATRACTIVA QUE PUEDA PARECER ESTA NUEVA ESTRATEGIA DE PROTEOMAS COMPLETOS, ESTE NUEVO PARADIGMA AUN PRESENTA VARIOS DESAFIOS ANALITICOS QUE LIMITAN SU IMPLEMENTACION EN PROYECTOS DE MEDICINA PERSONALIZADA QUE REQUIEREN ANALISIS RAPIDOS DE CIENTOS DE BIOPSIAS LIQUIDAS, DE HECHO, ACTUALMENTE EXISTE UN EQUILIBRIO ENTRE LA SENSIBILIDAD, EL NUMERO DE ANALITOS, EL NUMERO DE MUESTRAS Y LA CALIDAD DE LA CUANTIFICACION DE PEPTIDOS Y PROTEINAS, POR TANTO, EL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES ABORDAR LOS ASPECTOS PRINCIPALES PARA SUPERAR ESTAS LIMITACIONES Y PERMITIR UNA CUANTIFICACION RAPIDA Y DE ALTA CALIDAD DEL PROTEOMA DE BIOPSIAS LIQUIDAS PARA LA MEDICINA PERSONALIZADA: 1) DEFINIR QUE PEPTIDOS SON LOS MEJORES PARA LA CUANTIFICACION DE PROTEINAS EN ANALISIS DE PROTEOMA COMPLETO, 2) EXTENDER LA PRECISION Y EXACTITUD DE LOS METODOS CUANTIFICACION DE BIOMARCADORES INDIVIDUALES A LOS ANALISIS DE CUANTIFICACION DE PROTEOMAS COMPLETOS, Y 3) DESARROLLAR METODOS DE ADQUISICION DE ALTA SENSIBILIDAD COMPATIBLES CON ANALISIS RAPIDOS DE PROTEOMAS PARA OBTENER UN ALTO RENDIMIENTO DE MUESTRAS, AL ABORDAR ESTAS TRES PREGUNTAS, NUESTRO OBJETIVO ES REDUCIR LAS LIMITACIONES ANALITICAS ACTUALES QUE IMPIDEN EL USO DE LA PROTEOMICA PARA APLICACIONES DE MEDICINA PERSONALIZADA QUE REQUIEREN LA CUANTIFICACION DE PROTEOMAS COMPLETOS EN UN GRAN NUMERO DE BIOPSIAS, PROTEOMICA\CUANTIFICACION\INTELIGENCIA ARTIFICIAL\MEDICINA PERSONALIZADA