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BFU2011-29653

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IDENTIFICACION Y CARACTERIZACION DEL TRANSCRIPTOMA Y DEL PROTEOMA REGULADO POR L...

IDENTIFICACION Y CARACTERIZACION DEL TRANSCRIPTOMA Y DEL PROTEOMA REGULADO POR LAS PROTEINAS TIA. IMPLICACIONES FISIOPATOLOGICAS CADA VEZ SE ACUMULAN MAS EVIDENCIAS APOYANDO LA IDEA DE QUE LA REGULACION Y LA HETEROGENEIDAD DEL TRANSCRIPTOMA Y DEL PROTEOMA REPRESENTAN UNA ETAPA CLAVE PARA COMPRENDER LAS DIFERENCIAS EN LA DIVERSIDAD ENTRE ORGANISMOS DE COMPLE... ver más

01/01/2011

CSIC

103K€

Presupuesto del proyecto: 103K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2011-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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CSIC

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 103K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto CADA VEZ SE ACUMULAN MAS EVIDENCIAS APOYANDO LA IDEA DE QUE LA REGULACION Y LA HETEROGENEIDAD DEL TRANSCRIPTOMA Y DEL PROTEOMA REPRESENTAN UNA ETAPA CLAVE PARA COMPRENDER LAS DIFERENCIAS EN LA DIVERSIDAD ENTRE ORGANISMOS DE COMPLEJIDADES GENETICAS SEMEJANTES. LAS PROTEINAS TIA1 ("T-CELL INTRACELLULAR ANTIGEN 1") Y TIAR/TIAL1 ("TIA1 RELATED/LIKE PROTEIN") SE HAN IMPLICADO EN LA REGULACION DE LA EXPRESION GENICA Y DE DISTINTOS ASPECTOS DEL METABOLISMO DEL RNA COMO SON: 1) LA TRANSCRIPCION, A TRAVES DE SU INTERACCION CON EL DNA Y LA RNA POLIMERASA II; 2) EL PROCESAMIENTO ALTERNATIVO DEL PRE-MRNA, A TRAVES DE LA SELECCION DE SITIOS 5' DE CORTE Y EMPALME ATIPICOS Y 3) LA ESTABILIDAD Y/O LA TRADUCCION DE MRNAS EUCARIOTICOS, A TRAVES DE LA INTERACCION CON LAS REGIONES 3' NO TRADUCIBLES Y 4) EL CONTROL DE PROGRAMAS BIOLOGICOS FUNDAMENTALES PARA LA HOMEOSTASIS CELULAR COMO LA INDUCCION DE LA APOPTOSIS, LA RESPUESTA CELULAR AL ESTRES O A LAS INFECCIONES MEDIADAS POR VIRUS. EN CONSECUENCIA, LA HIPOTESIS DE PARTIDA DE NUESTRO PROYECTO DE INVESTIGACION, COMO UNA CONTINUACION LOGICA DE LOS ESTUDIOS INICIADOS POR NUESTRO GRUPO HACE 5 AÑOS (MINISTERIO DE SANIDAD/FONDO DE INVESTIGACIONES SANITARIAS (PI051605) ENERO 2006-DICIEMBRE 2008; MINISTERIO DE CIENCIA E INNOVACION (REF. 200920I108) ENERO-DICIEMBRE 2010; MINISTERIO DE CIENCIA E INNOVACION (BFU/BMC-2008-00354) ENERO 2009-DICIEMBRE 2011, EN SU ULTIMA ANUALIDAD), ES QUE ESTAS PROTEINAS PODRIAN JUGAR UN PAPEL RELEVANTE EN EL CONTROL DE LA EXPRESION GENICA MODULANDO EL TRANSCRIPTOMA Y EL PROTEOMA HUMANO, EXPRESION Y FUNCION, PARA PREVENIR SITUACIONES QUE COMPROMETAN LA VIABILIDAD CELULAR ABERRANTE. EN ESTE PROYECTO PROPONEMOS DEFINIR LOS CAMBIOS EN EL TRANSCRIPTOMA Y EN EL PROTEOMA ASOCIADOS AL FENOTIPO PROLIFERATIVO QUE PRESENTAN LAS CELULAS CON UNA EXPRESION REDUCIDA DE TIA1 Y/O TIAR Y ABORDAR EL ESTUDIO DE SU CONTRIBUCION AL DESARROLLO Y/O PROGRESION DE UN FENOTIPO TUMORAL. POR ELLO, ABORDAREMOS TRES GRANDES OBJETIVOS: 1) IDENTIFICACION Y CARACTERIZACION DE RNAS CELULARES ASOCIADOS A LA FALTA DE FUNCION DE LAS PROTEINAS TIA; 2) IDENTIFICACION Y CARACTERIZACION DEL PROTEOMA ASOCIADO A LA FALTA DE FUNCION DE LAS PROTEINAS TIA Y 3) ANALISIS DE UNA COHORTE DE TUMORES DE PULMON PARA ESTABLECER LA CONTRIBUCION DE LAS PROTEINAS TIA A LA PROGRESION TUMORAL. PARA LOGRAR ESTOS OBJETIVOS SE UTILIZARAN ABORDAJES EXPERIMENTALES DE SECUENCIACION MASIVA (RNA-SEQ), ESTUDIOS DE EXPRESION DE GENOMA COMPLETO, DE RNAS NO CODIFICANTES Y DE RNAS PEQUEÑOS MEDIANTE EL EMPLEO DE TECNICAS DE "MICROARRAYS", APROXIMACIONES PROTEOMICAS QUE INCLUYEN 2D-DIGE Y ESPECTROMETRIA DE MASAS MALDI-TOF, JUNTO A TECNICAS CLASICAS DE BIOLOGIA MOLECULAR Y BIOQUIMICA (SECUENCIACION DE DNA, QRT-PCR, CLONAJES, RNA INTERFERENTE, "WESTERN BLOT", ENSAYOS DE UNION A RNA, ETC) Y BIOLOGIA CELULAR (MICROSCOPIA DE FLUORESCENCIA, MICROSCOPIA ELECTRONICA, INMUNOCITOQUIMICA, ETC). LA COMBINACION DE ESTAS PODEROSAS TECNICAS NOS PERMITIRA ENTENDER LOS ASPECTOS MOLECULARES LIGADOS AL CONTROL DE LA EXPRESION EJERCIDA POR ESTAS PROTEINAS CON EL FIN DE IDENTIFICAR LAS REDES Y LOS NUDOS REGULADORES BAJO SU CONTROL. LOS ASPECTOS CONCRETOS DE CADA UNO DE ESTOS OBJETIVOS SE DETALLAN EN LOS SIGUIENTES APARTADOS DE ESTA MEMORIA. IA1\REGULACION DE LA EXPRESION GENICA\PROGRESION TUMORAL\PROTEOMA\TRANSCRIPTOMA\TIAR

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