Descripción del proyecto
ENTENDER COMO FUNCIONA LA EXPRESION GENETICA NOS PERMITE CONOCER COMO SE LOGRA LA HETEROGENEIDAD DE TRANSCRIPTOMAS Y PROTEOMAS QUE FAVORECEN LA DIVERSIDAD MOLECULAR Y FUNCIONAL DE LOS DIFERENTES TIPOS CELULARES QUE DEFINEN UN ORGANISMO EN CONDICIONES DE HOMEOSTASIS O DE ESTRES CELULAR, LOS ANTIGENOS INTRACELULARES TIA1 (T-CELL INTRACELLULAR ANTIGEN 1) Y TIAR/TIAL1 (TIA1-LIKE/RELATED PROTEIN), SE HAN IMPLICADO EN LA REGULACION DE LA EXPRESION GENETICA SOBRE DIFERENTES ASPECTOS DEL METABOLISMO DEL RNA, COMO SON: 1) LA TRANSCRIPCION, A TRAVES DE SU INTERACCION CON EL DNA Y LA RNA POLIMERASA II; 2) EL PROCESAMIENTO/SPLICING ALTERNATIVO DEL PRE-MRNA, A TRAVES DE LA SELECCION DE SITIOS 5 DE CORTE Y EMPALME CONSTITUTIVOS Y ATIPICOS; 3) LA LOCALIZACION, ESTABILIDAD Y/O TRADUCCION DE LOS MRNAS, A TRAVES DE LA INTERACCION CON REGIONES 5' Y/O 3' NO TRADUCIBLES; Y 4) EL CONTROL DE PROGRAMAS BIOLOGICOS FUNDAMENTALES PARA LA SUPERVIVENCIA CELULAR (P,E, INFLAMACION, PROLIFERACION, APOPTOSIS, AUTOFAGIA, ESTRES O INFECCIONES VIRALES), POR TODO ELLO, LA HIPOTESIS DE PARTIDA DE NUESTRA LINEA DE INVESTIGACION, COMO UNA CONTINUACION LOGICA DE LOS ESTUDIOS INICIADOS HACE DOCE AÑOS (FIS (PI051605) ENERO 2006-DICIEMBRE 2008; MICINN (200920I108) ENERO-DICIEMBRE 2010; MICINN (BFU-2008-00354) ENERO 2009-DICIEMBRE 2011; MICINN (BFU-2011-29653) ENERO 2012-DICIEMBRE 2014; MINECO (BFU2014-57735R) ENERO 2015-ABRIL 2018), ES QUE ESTOS GENES DESEMPEÑAN UN PAPEL RELEVANTE EN EL CONTROL DE LA EXPRESION GENETICA ADAPTANDO EL TRANSCRIPTOMA Y PROTEOMA HUMANOS, SU EXPRESION Y FUNCION, CON EL FIN DE SOBREVIVIR Y EVITAR SITUACIONES ABERRANTES QUE COMPROMETEN LA HOMEOSTASIS CELULAR EN CONDICIONES FISIOPATOLOGICAS ASOCIADAS AL ESTRES CELULAR O ENFERMEDADES LIGADAS AL ENVEJECIMIENTO COMO LA MIOPATIA DISTAL DE WELANDER (MDW), EN ESTE PROYECTO, EN CONCRETO, PROPONEMOS PURIFICAR Y CARACTERIZAR LOS GRANULOS DE ESTRES (GS) DEPENDIENTES DE TIA1 PARA CONOCER SU COMPOSICION MOLECULAR EN CONDICIONES EXPERIMENTALES DE PROTEOSTASIS (HOMEOSTASIS PROTEICA CELULAR) Y DE LA MIOPATIA DISTAL DE WELANDER, IDENTIFICAREMOS, POR TANTO, LOS COMPONENTES MOLECULARES Y LOS EVENTOS CELULARES DEPENDIENTES DIRECTA O INDIRECTAMENTE DE LOS GS DE TIA1 MEDIANTE PODEROSAS TECNICAS MASIVAS CAPACES DE IDENTIFICAR LOS CONSTITUYENTES (RNAS Y PROTEINAS) NATIVOS EN PROTEOSTASIS ASI COMO LOS ANORMALES/ATIPICOS SECUESTRADOS EN LOS GS DE TIA1 DE LA MDW, EN CONCRETO, ABORDAREMOS CINCO OBJETIVOS ESPECIFICOS: 1) LA PURIFICACION DE LOS GRANULOS DE ESTRES DEPENDIENTES DE TIA1, DE SUS ISOFORMAS (A/B), SALVAJES Y CON LA MUTACION DE LA MDW; 2) LA IDENTIFICACION DE SUS TRANSCRIPTOMAS, O COLECCIONES Y TIPOS DE RNAS, MEDIANTE SECUENCIACION MASIVA (RNA-SEQ); 3) LA COMPOSICION DE SUS PROTEOMAS, O COLECCIONES DE PROTEINAS Y SUS POSIBLES MODIFICACIONES POST-TRADUCCIONALES, MEDIANTE ANALISIS PROTEOMICOS DE ESPECTROMETRIA DE MASAS CUANTITATIVA (LC-MS/MS); 4) LA VALIDACION EXPERIMENTAL DE LOS RNAS Y LAS PROTEINAS IDENTIFICADOS MAS SIGNIFICATIVOS Y/O CON UN SIGNIFICADO BIOLOGICO MAS RELEVANTE; Y 5) EL ANALISIS DEL POTENCIAL DE LOS RNAS Y LAS PROTEINAS ASOCIADOS SOLO CON LA MDW COMO DIANAS Y/O MARCADORES MOLECULARES DE PROGNOSIS Y/O TERAPIA, PARA LOGRAR TODOS ESTOS OBJETIVOS EMPLEAREMOS ABORDAJES EXPERIMENTALES MASIVOS Y CLASICOS DE BIOTECNOLOGIA, SU COMBINACION NOS PERMITIRA ENTENDER LOS ASPECTOS MOLECULARES Y CELULARES LIGADOS AL CONTROL DE LA EXPRESION GENETICA EJERCIDA POR LAS ISOFORMAS A Y B DE TIA1 EN PROTEOSTASIS Y EN LA MDW, TIA1\TIAR\HUR\GRÁNULOS DE ESTRÉS\MIOPATÍA DISTAL DE WELANDER\REGULACIÓN POST-TRANSCRIPCIONAL DE LA EX