Descripción del proyecto
LA REGULACION DE LA HETEROGENEIDAD DEL TRANSCRIPTOMA Y DEL PROTEOMA REPRESENTA UNA ETAPA CLAVE PARA COMPRENDER LAS DIFERENCIAS EN LA DIVERSIDAD ENTRE ORGANISMOS DE COMPLEJIDADES GENETICAS SEMEJANTES, LOS ANTIGENOS INTRACELULARES TIA1 Y TIAR SE HAN IMPLICADO EN LA REGULACION Y/O MODULACION DE LA EXPRESION GENETICA SOBRE DIFERENTES ASPECTOS DEL METABOLISMO DEL RNA, COMO SON: 1) LA TRANSCRIPCION, A TRAVES DE SU INTERACCION CON EL DNA Y LA RNA POLIMERASA II; 2) EL PROCESAMIENTO ALTERNATIVO DEL PRE-MRNA, A TRAVES DE LA SELECCION DE SITIOS 5' DE CORTE Y EMPALME ATIPICOS; 3) LA LOCALIZACION, ESTABILIDAD Y/O TRADUCCION DE LOS MRNAS EUCARIOTICOS, A TRAVES DE LA INTERACCION CON LAS REGIONES 5' Y 3' NO TRADUCIBLES Y 4) EL CONTROL DE PROGRAMAS BIOLOGICOS FUNDAMENTALES PARA LA SUPERVIVENCIA CELULAR (INFLAMACION, PROLIFERACION, APOPTOSIS, ESTRES O INFECCIONES POR VIRUS), EN CONSECUENCIA, LA HIPOTESIS DE PARTIDA DE NUESTRA LINEA DE INVESTIGACION, COMO UNA CONTINUACION LOGICA DE LOS ESTUDIOS INICIADOS POR NUESTRO GRUPO HACE NUEVE AÑOS (FIS (PI051605) ENERO 2006-DICIEMBRE 2008; MINISTERIO DE CIENCIA E INNOVACION (200920I108) ENERO-DICIEMBRE 2010; MINISTERIO DE CIENCIA E INNOVACION (BFU-2008-00354) ENERO 2009-DICIEMBRE 2011; MINISTERIO DE ECONOMIA Y COMPETITIVIDAD (BFU-2011-29653) ENERO 2012-DICIEMBRE 2014, EN SU ULTIMA ANUALIDAD), ES QUE ESTAS PROTEINAS DESEMPEÑAN UN PAPEL RELEVANTE EN EL CONTROL DE LA EXPRESION GENETICA ADAPTANDO EL TRANSCRIPTOMA Y EL PROTEOMA HUMANO, SU EXPRESION Y SU FUNCION, CON EL FIN DE SOBREVIVIR A SITUACIONES ABERRANTES QUE COMPROMETAN LA HOMEOSTASIS CELULAR EN CONDICIONES FISIOPATOLOGICAS COMO EL ESTRES CELULAR, LA TUMOROGENESIS O ENFERMEDADES ASOCIADAS AL ENVEJECIMIENTO COMO LA MIOPATIA DISTAL DE WELANDER, EN ESTE PROYECTO PROPONEMOS DEFINIR LOS CAMBIOS EN EL TRANSCRIPTOMA Y EN EL PROTEOMA ASOCIADOS A LA GANANCIA DE FUNCION DE ESTAS PROTEINAS COMO FENOMENO QUE CONTRASTA Y PREVIENE EL DESARROLLO DE UN FENOTIPO PROLIFERATIVO ABERRANTE ASOCIADO A LAS CELULAS CON UNA EXPRESION REDUCIDA DE TIA1 Y/O TIAR, OBJETIVO ABORDADO EN LOS PROYECTOS ANTERIORES, POR LO TANTO, NUESTRO OBJETIVO ES COMPRENDER LOS PROCESOS CELULARES Y LOS MECANISMOS MOLECULARES TEMPRANOS EN LOS QUE PARTICIPAN ESTOS REGULADORES PARA CONTRIBUIR A REGULAR/MODULAR LA VIALIDAD CELULAR, EVITANDO EL DESARROLLO Y/O PROGRESION DE FENOTIPOS DELETEREOS, POR ELLO, ABORDAREMOS TRES GRANDES OBJETIVOS: 1) LA IDENTIFICACION Y CARACTERIZACION DE RNAS CELULARES ASOCIADOS A LA GANANCIA DE FUNCION DE TIA1 Y TIAR; 2) LA IDENTIFICACION Y CARACTERIZACION DEL PROTEOMA/TRANSLATOMA E INTERACTOMA ASOCIADO A LA GANANCIA DE FUNCION DE TIA1 Y TIAR Y 3) EL PAPEL DE LA PROTEINA TIA1 EN LA MIOPATIA DISTAL DE WELANDER, PARA LOGRAR ESTOS OBJETIVOS SE UTILIZARAN ABORDAJES EXPERIMENTALES DE SECUENCIACION MASIVA (RNA-SEQ), ANALISIS DE ICLIP, ESTUDIOS DE EXPRESION DE GENOMA COMPLETO MEDIANTE EL EMPLEO DE TECNICAS DE "MICROARRAYS"; JUNTO CON APROXIMACIONES PROTEOMICAS MASIVAS COMO SILAC, 2D-DIGE Y ESPECTROMETRIA DE MASAS MALDI-TOF, AMEN DE TECNICAS CLASICAS DE BIOLOGIA MOLECULAR Y BIOQUIMICA (CLONAJES, SECUENCIACION DE DNA, QRT-PCR, RNA INTERFERENTE, INMUNOBLOT, EMSA, ETC
) Y DE BIOLOGIA CELULAR (MICROSCOPIA DE FLUORESCENCIA, MICROSCOPIA ELECTRONICA, ETC
), LA COMBINACION DE ESTOS PODEROSOS ABORDAJES EXPERIMENTALES NOS PERMITIRA ENTENDER LOS ASPECTOS MOLECULARES LIGADOS AL CONTROL DE LA EXPRESION EJERCIDA POR ESTOS ANTIGENOS CON EL FIN DE IDENTIFICAR LAS REDES Y LOS NUDOS REGULADORES BAJO SU CONTROL, TIA1\TIAR\CONTROL DE LA EXPRESIÓN GENÉTICA\ESTRÉS CELULAR\MIOPATÍA DISTAL DE WELANDER