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BFU2013-48643-C3-3-P

Financiado

REGULACION CRUZADA ENTRE LA TRANSCRIPCION Y LA ESTABILIDAD DE LOS MRNAS: APROXIM...

REGULACION CRUZADA ENTRE LA TRANSCRIPCION Y LA ESTABILIDAD DE LOS MRNAS: APROXIMACIONES GENOMICAS Y MECANISMOS IMPLICADOS EN LA RESPUESTA AL ESTRES LAS MAQUINARIAS CELULARES DE TRANSCRIPCION Y DEGRADACION DE MRNA INTERACCIONAN FISICA Y FUNCIONALMENTE EN LOS ORGANISMOS EUCARIONTES, PERMITIENDO UNA REGULACION CONCERTADA QUE OTORGA GRAN ROBUSTEZ AL SISTEMA DE EXPRESION GENICA, E... ver más

01/01/2013

230K€

Presupuesto del proyecto: 230K€

Líder del proyecto

UNIVERSITAT DE VALÈNCIA (ESTUDI GENERAL) No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Sin perfil tecnológico

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2013-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

UNIVERSITAT DE VALÈNCIA (ESTUDI GENERAL) No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Sin perfil tecnológico

Presupuesto del proyecto 230K€

Descripción del proyecto LAS MAQUINARIAS CELULARES DE TRANSCRIPCION Y DEGRADACION DE MRNA INTERACCIONAN FISICA Y FUNCIONALMENTE EN LOS ORGANISMOS EUCARIONTES, PERMITIENDO UNA REGULACION CONCERTADA QUE OTORGA GRAN ROBUSTEZ AL SISTEMA DE EXPRESION GENICA, ESTE PROYECTO PRETENDE PROFUNDIZAR EN ESTE PROCESO Y CONTRIBUIR A DESENTRAÑAR LOS MECANISMOS MOLECULARES QUE LO SUSTENTAN UTILIZANDO LA LEVADURA S, CEREVISIAE COMO MODELO EUCARIOTICO,CIERTOS ELEMENTOS DE LA MAQUINARIA DE DEGRADACION DE LOS MRNA, TRAS REALIZAR SU FUNCION EN EL CITOPLASMA, MIGRAN AL NUCLEO E INTERACTUAN FISICAMENTE CON LOS GENES, ALLI ESTIMULAN EL RECLUTAMIENTO DE LA RNA POL II A LA CROMATINA Y FAVORECEN LA ELONGACION DE LA TRANSCRIPCION, ESTA, POR SU PARTE, TAMBIEN INFLUYE SOBRE LA DEGRADACION DEL MRNA MEDIANTE LA LLAMADA IMPRONTA DEL MRNA, EN ESE PROCESO LA PROPIA TRANSCRIPCION DETERMINA LA ESTABILIDAD DE LOS MRNAS MEDIANTE UN MECANISMO DE MARCAJE MOLECULAR MUY POBREMENTE CONOCIDO, IGNORAMOS SI ESTOS DOS FENOMENOS DE REGULACION CRUZADA SINTESIS-DEGRADACION DEL MRNA ESTAN ACOPLADOS EN UN PROCESO UNICO, TAMPOCO CONOCEMOS LAS BASES MOLECULARES DE ESTOS PROCESOS DE CROSS-TALK (CT) TRANSCRIPCION/DEGRADACION,NUESTROS RESULTADOS PREVIOS SUGIEREN LA EXISTENCIA DE FACTORES REGULADORES DEL CROSS-TALK TRANSCRIPCION-DEGRADACION, QUE SERIAN ESENCIALES PARA LA ROBUSTEZ DE LA EXPRESION DEL GENOMA, LA ESTRUCTURA DE LOS PROMOTORES, LA CONFIGURACION DE LA RNA POLIMERASA Y SUS FACTORES ASOCIADOS Y LA DINAMICA DE LA CROMATINA DURANTE LA ELONGACION DE LA TRANSCRIPCION SON ELEMENTOS QUE PUEDEN CONTRIBUIR A ESTE FENOMENO, JUNTO A ESTE SISTEMA DE CT COMPENSATORIO, QUE MANTIENE ESTABLES LOS NIVELES DE MRNA EN SITUACIONES ESTACIONARIAS Y REDUCE EL RUIDO ESPERABLE EN TODO SISTEMA COMPLEJO DE INFORMACION, PARECE EXISTIR OTRA FORMA DE CT TRANSCRIPCION-DEGRADACION QUE CONTRIBUYE A LA EXPRESION REGULADA DE CIERTOS GENES EN RESPUESTA A ESTIMULOS COMO LOS DERIVADOS DE SITUACIONES DE ESTRES, EN ESTE CASO EL ACOPLAMIENTO TRANSCRIPCION-DEGRADACION SIRVE PARA AJUSTAR LA DURACION DE LA RESPUESTA Y GENERAR LOS ADECUADOS NIVELES DE VARIABILIDAD ENTRE CELULAS QUE MAXIMICEN LAS OPORTUNIDADES DE SUPERVIVENCIA DE LA POBLACION,NUESTRA HIPOTESIS DE TRABAJO ES QUE LOS GENES EN S, CEREVISIAE POSEEN (AL MENOS) DOS DIFERENTES MANERAS DE INICIAR LA TRANSCRIPCION (TATA/SAGA Y TATA-LIKE/TFIID), DOS FORMAS DE ELONGAR LA TRANSCRIPCION (HISTONE-EVICTION, HE; Y HEXASOMA, HX) Y TAMBIEN DOS FORMAS DE REALIZAR EL CT (GENERAL Y ESPECIFICO), EXISTIRIA UNA FORMA PRINCIPAL DE ACTUACION PARA CADA GRUPO FUNCIONAL DE GENES, POR EJEMPLO LOS GENES CONSTITUTIVOS USARIAN TFIID, HX Y CT GENERAL, MIENTRAS QUE LOS INDUCIBLES POR ESTRES USARIAN SAGA, HE Y CT ESPECIFICO, COMBINACIONES DE ELLAS SON POSIBLES PARA OTROS GRUPOS O CONDICIONES,NUESTRO PROYECTO SE PROPONE: 1) DEFINIR LA CONTRIBUCION DE LOS DIFERENTES ELEMENTOS CIS Y TRANS DE EXPRESION GENICA AL CT TRANSCRIPCION/DEGRADACION, DIFERENCIANDO LOS ELEMENTOS QUE CONTRIBUYEN PASIVAMENTE AL FENOMENO DE AQUELLOS OTROS QUE SON ESENCIALES PARA SU FUNCIONAMIENTO,2) COMPROBAR LA EXISTENCIA DE MODOS ALTERNATIVOS EN LA DINAMICA DE LA CROMATINA (HX VERSUS HE) Y DETERMINAR SU POSIBLE RELACION CON LA DEGRADACION DEL MRNA Y, POR ELLO, CON EL CT,3) ASOCIAR GRUPOS DE GENES CORREGULADOS A LOS DIFERENTES ASPECTOS DEL CT TRANSCRIPCION/DEGRADACION, TANTO EN CONDICIONES ESTACIONARIAS DE CULTIVO, COMO EN SITUACIONES DE RESPUESTA GENOMICA GLOBAL (ESTRES, CICLO CELULAR), EXPRESIÓN GÉNICA\ TRANSCRIPCION\ RNA POLYMERASA II\ DEGRADACIÓN DE MRNA\ ESTABILIDAD DE MRNA\ RESPUESTA AL ESTRES\ SACCHAROMYCES\ CROMATINA

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