Descripción del proyecto
EL OBJETIVO GENERAL DEL PROYECTO ES AVANZAR EN EL CONOCIMIENTO DE LA SECRECION DE PROTEINAS EN MICROORGANISMOS DE APLICACION INDUSTRIAL, COMO SON LOS ESTREPTOMICETOS, QUE ADEMAS DE ANTIBIOTICOS, Y ANTITUMORALES, SON PRODUCTORES DE ENZIMAS HIDROLITICAS EXTRACELULARES CON MARCADA CAPACIDAD BIOCIDA, UTILIZANDO STREPTOMYCES LIVIDANS COMO BACTERIA MODELO CON EL PROPOSITO DE GENERAR CEPAS ANFITRIONAS DE S, LIVIDANS PARA LA ROBUSTA SOBREPRODUCCION DE PROTEINAS DE SECRECION HOMOLOGAS Y HETEROLOGAS, EL PROYECTO ES UNA CONTINUACION NATURAL DE LA INVESTIGACION LLEVADA A CABO EN NUESTRO LABORATORIO DURANTE VARIOS AÑOS UTILIZANDO HERRAMIENTAS DE GENOMICA FUNCIONAL Y PROTEOMICA PARA EL ESTUDIO DE LA RESPUESTA CELULAR AL ESTRES GENERADO POR LA ACUMULACION EN CONDICIONES DE SOBREPRODUCCION DE PROTEINAS EXTRACELULARES, EN EL PROYECTO SE PRETENDE AVANZAR EN PRIMER LUGAR EN LA CARACTERIZACION DE LOS COMPONENTES QUE AFECTAN A LA CANTIDAD Y CALIDAD DE LA PROTEINA SECRETADA EN S, LIVIDANS, PARA ELLO, EL PROYECTO ABORDA LA CARACTERIZACION DEL FUNCIONAMIENTO DE LAS TRES PROTEASAS ESPECIFICAS, DESCRITAS EN NUESTRO LABORATORIO, RESPONSABLES DE LA DEGRADACION DE PROTEINAS SECRETADAS INCORRECTAMENTE PLEGADAS O NO PLEGADAS, ACUMULADAS EN CONDICIONES DE SOBREPRODUCCION, Y QUE, PRESUMIBLEMENTE, FORMAN PARTE DE LOS FACTORES DE CONTROL DE CALIDAD PRESENTES EN LA BACTERIA, IGUALMENTE ABORDA LA CARACTERIZACION DE LAS PROTEINAS QUE LA CELULA UTILIZA PARA PLEGAR CORRECTAMENTE LAS PROTEINAS SECRETADAS (PEPTIDIL-PROLIL CIS-TRANS ISOMERASAS Y TIOL-OXIDORREDUCTASAS), PARA DILUCIDAR EL EQUILIBRIO ADECUADO DE TODAS ELLAS PERMITIENDO UNA SECRECION EFICIENTE DE LAS PROTEINAS SOBREPRODUCIDAS,EL PROYECTO EXPLORA TAMBIEN LA DETERMINACION DE LAS CARACTERISTICAS ESTRUCTURALES QUE PUEDEN FAVORECER LA SECRECION DE PROTEINAS POR LA RUTA MAYORITARIA (SEC) QUE LIBERA PROTEINAS INCORRECTAMENTE PLEGADAS, FRENTE A LA SECRECION POR LA RUTA MINORITARIA (TAT) QUE LIBERA LAS PROTEINAS CORRECTAMENTE PLEGADAS AL MEDIO DE CULTIVO, SE DESARROLLARAN ALGORITMOS PARA PREDECIR LA RUTA DE SECRECION MAS EFECTIVA PARA UNA PROTEINA BASADOS EN SU ESTRUCTURA, PERMITIENDO ASI HACER LA INGENIERIA GENETICA QUE POTENCIALMENTE PERMITA EL TRANSPORTE MAS EFECTIVO AL EXTERIOR CELULAR, ADICIONALMENTE, EL ABORDAJE DEL ESTUDIO DE LOS CAMBIOS METABOLICOS INDUCIDOS POR LA SOBREPRODUCCION DE PROTEINAS EXTRACELULARES PERMITIRA ESTIMAR EL COSTE METABOLICO DE ESA SOBREPRODUCCION, LO QUE A SU VEZ NOS PERMITIRA DISEÑAR FORMAS DE SOBREPRODUCCION CON UN EQUILIBRIO APROPIADO ENTRE CANTIDAD DE PRODUCTO Y COSTE RELATIVO,LOS RESULTADOS OBTENIDOS SERAN DE DIRECTA APLICACION A NIVEL INDUSTRIAL PARA EL ESCALADO DE PRODUCCION DE PROTEINAS SECRETADAS, PERMITIENDO LA OPTIMIZACION DE LA SOBREPRODUCCION DE PROTEINAS EXTRACELULARES, Y FACILITANDO EL DISEÑO Y CONSTRUCCION DE NUEVAS Y EFICIENTES CEPAS SECRETORAS EN STREPTOMYCES LIVIDANS, STREPTOMYCES LIVIDANS. SECRECIÓN SOSTENI