Descripción del proyecto
LOS ESTREPTOMICETOS SON BACTERIAS GRAM POSITIVAS PRODUCTORAS DE UN GRAN NUMERO DE COMPUESTOS BIOACTIVOS (METABOLITOS SECUNDARIOS) CON APLICACION EN MEDICINA, VETERINARIA Y AGRICULTURA, A PESAR DEL GRAN NUMERO DE COMPUESTOS COMERCIALIZADOS, HAY NECESIDAD DE NUEVOS COMPUESTOS, COMO ANTITUMORALES MAS ACTIVOS Y CON MENOS EFECTOS SECUNDARIOS O ANTIBIOTICOS FRENTE A BACTERIAS MULTIRRESISTENTES, LAS ESTRATEGIAS CLASICAS PARA BUSCAR NUEVOS COMPUESTOS CONDUCEN GENERALMENTE AL REAISLAMIENTO DE COMPUESTOS YA CONOCIDOS, LA BIOSINTESIS COMBINATORIA (CONSTRUCCION DE MICROORGANISMOS RECOMBINANTES CON COMBINACIONES GENICAS NO EXISTENTES EN LA NATURALEZA) Y LA MINERIA GENOMICA (ANALISIS DE GENOMAS DE MICROORGANISMOS PRODUCTORES PARA IDENTIFICAR Y ACTIVAR AGRUPACIONES DE GENES DE BIOSINTESIS) SON DOS ESTRATEGIAS NOVEDOSAS QUE ESTAN SIENDO UTILIZADAS PARA GENERAR NUEVOS COMPUESTOS, STREPTOMYCES ARGILLACEUS ES UNA CEPA GENETICAMENTE MANIPULABLE, PRODUCTORA DEL ANTITUMORAL MITRAMICINA, RECIENTEMENTE SE HA SECUENCIADO SU GENOMA Y SE HAN IDENTIFICADO 30 AGRUPACIONES DE BIOSINTESIS (CLUSTERS) DE METABOLITOS SECUNDARIOS, UTILIZANDO DISTINTAS ESTRATEGIAS DE INGENIERIA GENETICA Y/O METABOLICA SE HA PODIDO ACTIVAR LA AGRUPACION GENICA 1701 (ARP) E IDENTIFICAR UNA FAMILIA DE NUEVOS COMPUESTOS ALCALOIDES POLICETONICOS CON ACTIVIDAD ANTIBIOTICA (LAS ARGIMICINAS), EL PRESENTE PROYECTO TIENE COMO OBJETIVO GENERAL LA IDENTIFICACION Y GENERACION DE NUEVOS COMPUESTOS BIOACTIVOS PRODUCIDOS POR S, ARGILLACEUS, PARA ALCANZAR ESTE OBJETIVO, EL PROYECTO ESTA SUBDIVIDIDO EN DOS APARTADOS: (A) LA CARACTERIZACION DEL CLUSTER ARP Y LA GENERACION DE NUEVAS ARGIMICINAS POR BIOSINTESIS COMBINATORIA Y (B) LA IDENTIFICACION DE NUEVOS COMPUESTOS MEDIANTE LA ACTIVACION DE CUATRO CLUSTERS DEL GENOMA DE S, ARGILLACEUS, LA REALIZACION DEL PRIMER APARTADO IMPLICARA (I) DELIMITAR EL CLUSTER ARP INACTIVANDO/ELIMINANDO GENES DE SUS EXTREMOS; (II), DETERMINAR LAS FUNCIONES DE LOS GENES ARP MEDIANTE LA INACTIVACION DE LOS MISMOS Y EL AISLAMIENTO Y CARACTERIZACION QUIMICA DE LOS COMPUESTOS ACUMULADOS; (III) ESTABLECER UNA RUTA DE BIOSINTESIS PARA LAS ARGIMICINAS QUE IMPLICARA EXPERIMENTOS DE CO-SINTESIS, BIOCONVERSION Y EXPRESION SECUENCIAL DE GENES EN HUESPEDES HETEROLOGOS; (IV) ANALIZAR LA REGULACION DEL CLUSTER MEDIANTE LA INACTIVACION/SOBREEXPRESION DE LOS GENES REGULADORES Y EL ANALISIS TRANSCRIPTOMICO DE LAS CEPAS POR RT-PCR, E IDENTIFICAR REGULADORES PARA SUPERPRODUCIR ARGIMICINAS; Y (V) GENERAR Y CARACTERIZAR QUIMICA Y BIOLOGICAMENTE NUEVOS DERIVADOS DE ARGIMICINAS OBTENIDOS POR ESTRATEGIAS DE BIOSINTESIS COMBINATORIA (INACTIVACION GENICA Y EXPRESION DE GENES DE OTRAS RUTAS), LA REALIZACION DEL SEGUNDO APARTADO IMPLICARA (I) ACTIVAR UN CLUSTER PARA TERPENOS (CLUSTER 25) Y DOS PARA COMPUESTOS HIBRIDOS PEPTIDO-POLICETONICOS (CLUSTERS 10 Y 26), MEDIANTE LA SOBREEXPRESION/INACTIVACION DE GENES REGULADORES POSITIVOS/NEGATIVOS, LA SOBREEXPRESION DE GENES IMPLICADOS EN LA BIOSINTESIS DE METABOLITOS PRECURSORES Y/O LA EXPRESION HETEROLOGA DEL CLUSTER; (III) PURIFICAR Y CARACTERIZAR QUIMICA Y BIOLOGICAMENTE LOS COMPUESTOS CODIFICADOS POR LOS CLUSTERS 1705, 10, 25 Y 26; (IV) CARACTERIZAR LOS CLUSTERS, ESTABLECIENDO SUS LIMITES, CARACTERIZANDO SUS GENES, FUNDAMENTALMENTE LOS IMPLICADOS EN REACCIONES DE DECORACION, Y PROPONIENDO RUTAS DE BIOSINTESIS; Y (V) GENERAR NUEVOS DERIVADOS POR INACTIVACION GENICA Y EXPRESION DE GENES DE OTRAS RUTAS, STREPTOMYCES\ANTIBIÓTICO\ANTITUMORAL\BIOACTIVO\MINERÍA GENÓMICA\BIOSÍNTESIS COMBINATORIA\POLICÉTIDOS\AHBA