Descripción del proyecto
UNO DE LOS RETOS MAS IMPORTANTES A LOS QUE SE ENFRENTA LA SOCIEDAD EN ESTE SIGLO ES LA APARICION DE CEPAS BACTERIANAS PATOGENAS RESISTENTES A TODOS LOS ANTIBIOTICOS DISPONIBLES, PARA HACER FRENTE A ESTE PROBLEMA, RESULTA PRIORITARIO EL DESCUBRIMIENTO DE NUEVAS MOLECULAS CON ACTIVIDAD ANTIBIOTICA, ASI COMO LA MEJORA DE SU PRODUCCION, EN ESTE CONTEXTO, LAS BACTERIAS DEL GENERO STREPTOMYCES (S,) JUEGAN UN PAPEL ESENCIAL, YA QUE PRODUCEN MAS DEL 50% DE TODOS LOS ANTIBIOTICOS DISPONIBLES Y, ADEMAS, POSEEN EN SU GENOMA UN AUTENTICO ARSENAL SILENCIADO QUE VARIA DE 20 Y 40 POSIBLES METABOLITOS SECUNDARIOS POR CEPA, UNA DE LAS PRINCIPALES ESTRATEGIAS PARA EXPLORAR ESTE GRAN ARSENAL SILENCIADO Y PARA INCREMENTAR LA PRODUCCION DE COMPUESTOS YA CONOCIDOS ES SER CAPAZ DE MODULAR SUS CASCADAS DE REGULACION SIENDO CRUCIAL SU CONOCIMIENTO, EL PROYECTO PROPONE AÑADIR NUEVOS ELEMENTOS A ESTA RED DE REGULACION CON EL ESTUDIO DEL MODO DE ACCION DE VARIOS SISTEMAS DE DOS COMPONENTES (TCSS) DE STREPTOMYCES COELICOLOR IMPLICADOS EN LA PRODUCCION DE ANTIBIOTICOS ASI COMO EL ESTUDIO DE 15 PAREJAS DE GENES QUE CODIFICAN PARA DOS PROTEINAS CON DOMINIOS XRE (XENOBIOTIC RESPONSE ELEMENT) Y DUF397 (DOMAIN OF UNKNOWN FUNCTION), EL ESTUDIO FUNCIONAL SOBRE UNA DE ESTAS PAREJAS XRE/DUF397 (SCR1/SCR2) HA DEMOSTRADO QUE SE COMPORTA COMO UN ACTIVADOR MUY FUERTE DE LA PRODUCCION DE ANTIBIOTICOS A PESAR DE HABER SIDO PROPUESTA COMO UN SISTEMA TOXINA/ANTITOXINA POR OTROS AUTORES, EL OTRO OBJETIVO DEL PROYECTO ES LA TRASLACION DEL CONOCIMIENTO ADQUIRIDO CON LOS REGULADORES ESTUDIADOS BIEN PARA DESPERTAR RUTAS CRIPTICAS O INCREMENTAR SU PRODUCCION (USANDO REGULADORES POSITIVOS), BIEN PARA MEJORAR CEPAS HOSPEDADORAS (DELECIONADAS EN LOS REGULADORES NEGATIVOS) PARA LA EXPRESION HETEROLOGA DE CLUSTER DE PRODUCCION DE ANTIBIOTICOS, LOS OBJETIVOS DEL PROYECTO SON: 1) PROFUNDIZAR EN EL CONOCIMIENTO DE LOS ELEMENTOS INVOLUCRADOS EN LA RED DE REGULACION DE LOS TCSS EN ESTUDIO, 2) ESTUDIO FUNCIONAL DE LAS PROTEINAS REGULADORAS XRE/DUF397 POTENCIALMENTE IMPLICADAS EN LA REGULACION DE LA PRODUCCION DE ANTIBIOTICOS, 3) IMPLEMENTAR APLICACIONES BIOTECNOLOGICAS PARA LOS SISTEMAS REGULADORES ESTUDIADOS, PARA ABORDAR ESTOS OBJETIVOS SE REALIZARAN DISTINTAS TAREAS ENTRE LAS QUE PODEMOS RESALTAR: A) DESARROLLAR NUEVAS HERRAMIENTAS PARA EL ESTUDIO DE LA RELACION ESPECIFICA ENTRE LAS SEÑALES DE ACTIVACION Y SUS HK CORRESPONDIENTES EN STREPTOMYCES; B) ESTABLECER LAS REDES REGULADORAS DE LOS RRS ESTUDIADOS SOBRE LA PRODUCCION DE ANTIBIOTICOS Y LA IDENTIFICACION DE LOS GENES CONTROLADOS DIRECTAMENTE; C) PROFUNDIZAR EN LA RED REGULADORA ACTIVADA POR SCR1/SCR2, SU INTERACCION Y MODO DE ACCION; D) DETERMINAR EL PAPEL EN RELACION CON ANTIBIOTICOS DE OTROS 14 SISTEMAS XRE-DUF397 PRESENTES EN EL GENOMA DE S, COELICOLOR; E) MEJORAR EL USO DE CEPAS PARA LA PRODUCCION HETEROLOGA DE ANTIBIOTICOS; F) USAR REGULADORES POSITIVOS PARA DESENCADENAR LA PRODUCCION DE VIAS CRIPTICAS O CON PRODUCCION PEQUEÑA EN DIFERENTES ESPECIES DE STREPTOMYCES Y AMPLIAR NUESTRA COLECCION DE CEPAS DE STREPTOMYCES OBTENIDAS DE DIFERENTES ENTORNOS, EL PROYECTO PLANTEA UNA APROXIMACION BALANCEADA DE LA UTILIZACION DE HERRAMIENTAS PREVIAMENTE OBTENIDAS EN EL GRUPO CON UNA FINALIDAD BIOTECNOLOGICA A MEDIO PLAZO JUNTO CON ESTRATEGIAS DE INVESTIGACION BASICA QUE GENERARAN NUEVO CONOCIMIENTO A APLICAR A MAS LARGO PLAZO, TODAS ELLAS CON LA FINALIDAD ULTIMA DE MEJORAR LA PRODUCCION DE NUEVOS COMPUESTOS CON ACTIVIDAD ANTIBIOTICA, STREPTOMYCES\ANTIBIOTICOS\REGULADORES\MEJORA PRODUCCION\ACTIVADORES\SISTEMAS DE DOS COMPONENTES.