HACIA LA MEDICINA PERSONALIZADA: DESARROLLO DE METODOS DE INTELIGENCIA ARTIFICIA...
HACIA LA MEDICINA PERSONALIZADA: DESARROLLO DE METODOS DE INTELIGENCIA ARTIFICIAL PARA IDENTIFICAR NUEVOS MARCADORES GENETICOS Y EPIGENETICOS. APLICACION AL CANCER COLONRECTAL
ESTE PROYECTO CONTINUA LA INVESTIGACION DEL PROYECTO ANTERIOR Y EL ACTUAL, AMBOS DENTRO DEL PLAN NACIONAL, EN LOS QUE SE HAN DESARROLLADO NUEVAS HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS PARA CONTRIBUIR EN EL PROGRESO HACIA LA MEDICINA PERSONA...
ESTE PROYECTO CONTINUA LA INVESTIGACION DEL PROYECTO ANTERIOR Y EL ACTUAL, AMBOS DENTRO DEL PLAN NACIONAL, EN LOS QUE SE HAN DESARROLLADO NUEVAS HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS PARA CONTRIBUIR EN EL PROGRESO HACIA LA MEDICINA PERSONALIZADA, A PESAR DE LOS AVANCES CONSEGUIDOS, LA COMUNIDAD CIENTIFICA ENCARA UN NUEVO ESCENARIO A PARTIR DE LOS SIGUIENTES HITOS RECIENTEMENTE ALCANZADOS: A) LOS AVANCES EN LAS TECNOLOGIAS DE SECUENCIACION (NGS) HAN REDUCIDO DRASTICAMENTE EL TIEMPO Y COSTE DE LA INVESTIGACION GENETICA, B) EL POTENCIAL DE INFORMACION DE REGIONES NO CODIFICANTES DEL ADN ESTA AYUDANDO A LA COMPRENSION DE LOS MECANISMOS REGULADORES DE LA CELULA, ESTE ADN ES TRANSCRITO A ARN NO CODIFICANTE (NCRNA, ARN QUE NO SE TRADUCE A PROTEINA), EN PARTICULAR, LOS ARN LARGOS NO CODIFICANTES (LNCRNAS), HAN SIDO LLAMADOS POR ALGUNOS INVESTIGADORES "UN NUEVO TIPO DE GENES" [MERCER 2013] Y SU ESTUDIO TENDRA UN PROFUNDO IMPACTO EN LA IDENTIFICACION DE NUEVOS ELEMENTOS CLAVE EN REGULACION, C) LOS AVANCES EN EPIGENETICA, EL ESTUDIO DE LAS CAPAS DE INFORMACION POR ENCIMA DE LAS CUATRO BASES (ACGT) QUE CONFORMAN EL ADN, EN PARTICULAR, LA METILACION DE LA CITOSINA (C) JUEGA UN PAPEL FUNDAMENTAL EN ASPECTOS COMO LA REGULACION DE LA EXPRESION GENICA O INMUNIDAD, NUEVAS TECNOLOGIAS ESTAN PERMITIENDO MEDIR NIVELES DE METILACION EN MILES DE LOCI DE INTERES,ESTOS DESCUBRIMIENTOS, JUNTO CON LA CANTIDAD MASIVA DATOS PRODUCIDOS POR LAS NUEVAS TECNOLOGIAS, HACEN QUE EL CENTRO DE ATENCION RECAIGA ACTUALMENTE EN LA NECESIDAD DE DESARROLLAR HERRAMIENTAS COMPUTACIONALES CAPACES DE ANALIZAR E INTERPRETAR DICHOS DATOS, EL PRINCIPAL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES AYUDAR AL PROGRESO DE LA MEDICINA PERSONALIZADA DESARROLLANDO NUEVAS METODOLOGIAS COMPUTACIONALES PATENTABLES PARA LA DETECCION DE NUEVOS BIOMARCADORES GENETICOS Y EPIGENETICOS, ASI COMO LA IDENTIFICACION DE NUEVAS RELACIONES ENTRE ESTAS ENTIDADES, ADEMAS, PLANEAMOS APLICAR LAS METODOLOGIAS PROPUESTAS A DATOS REALES DE CANCER COLORRECTAL (CRC),ESTE OBJETIVO PRINCIPAL SE PUEDE DIVIDIR EN LOS SIGUIENTES OBJETIVOS ESPECIFICOS:1, DESARROLLO DE HERRAMIENTAS COMPUTACIONALES PARA IDENTIFICACION AUTOMATICA Y ANOTACION DE BIOMARCADORES GENETICOS ASOCIADOS A ELEMENTOS REGULADORES EN LNCRNAS: SNPS, TFBSS, MODULOS REGULADORES CIS,2, DESARROLLO DE METODOLOGIAS COMPUTACIONALES PARA IDENTIFICACION DE BIOMARCADORES DE METILACION Y LA RESOLUCION DEL PROBLEMA DEL HAPLOTIPADO CONSIDERANDO PATRONES DE METILACION (ASPECTO MUY INNOVADOR),3, DESARROLLO DE METODOLOGIAS COMPUTACIONALES PARA EXTRACCION DE RELACIONES ENTRE LNCRNAS Y TEJIDOS, GENES, ENFERMEDADES Y MARCADORES DE METILACION PARA DILUCIDAR FUNCIONES BIOLOGICAS DE ESTOS ELEMENTOS,4, APLICACION TRASLACIONAL DE LAS METODOLOGIAS EN DATOS REALES DE CRC,5, IMPLEMENTACION DE UN SERVIDOR WEB PUBLICO,ES EVIDENTE QUE LA CONSECUCION DE ESTOS OBJETIVOS REQUIERE UN GRAN ESFUERZO EN EL DESARROLLO DE HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS, ESTAS HERRAMIENTAS IMPLEMENTARAN DIVERSOS PARADIGMAS COMPUTACIONALES Y ESTADISTICOS: TECNOLOGIAS DIFUSAS, REGLAS DE ASOCIACION, HMMS, SVMS, RANDOM FORESTS, TESTS PARAMETRICOS Y NO PARAMETRICOS, ENTRE OTROS,LAS METODOLOGIAS DESARROLLADAS SE APLICARAN A CRC, EL CANCER CON MAYOR INCIDENCIA EN ESPAÑA, ESTE PROYECTO CUENTA CON EXPERTOS EN CRC DIRIGIENDO PROYECTOS DE PREVENCION Y UNIDADES DE CRC, QUE CONTRIBUIRAN CON DATOS Y EXPERIENCIA, NO OBSTANTE, LAS METODOLOGIAS DESARROLLADAS PODRAN SER APLICADAS AL ESTUDIO DE CUALQUIER ENFERMEDAD, BIOINFORMÁTICA\ BIOLOGÍA COMPUTACIONAL\ INTELIGENCIA ARTIFICIAL\ MEDICINA PERSONALIZADA\ EPIGENÉTICA\ METILACIÓN\ CÁNCER COLORRECTAL\ SISTEMAS INTELIGENTES\ MACHINE LEARNING\ MINERÍA DE DATOS.ver más
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