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TIN2009-13489

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APROXIMACION A REDES GENETICAS RELACIONADAS CON ENFERMEDADES MEDIANTE INTELIGENC...

APROXIMACION A REDES GENETICAS RELACIONADAS CON ENFERMEDADES MEDIANTE INTELIGENCIA ARTIFICIAL. ESTUDIO EN CANCER EL PRESENTE PROYECTO PRETENDE SER CONTINUACION DEL PROYECTO ¿APPROACH TO THE PERSONALIZED MEDICINE BY MEANS OF INTELLIGENT SYSTEMS APPLIED TO DNA SEQUENCES AND MICROARRAYS¿ QUE ESTA SIENDO EJECUTADO EN LA ACTUALIDAD, Y EN EL QUE S... ver más

01/01/2009

UGR

136K€

Presupuesto del proyecto: 136K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE GRANADA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 5511

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2009-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE GRANADA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 5511

Presupuesto del proyecto 136K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto EL PRESENTE PROYECTO PRETENDE SER CONTINUACION DEL PROYECTO ¿APPROACH TO THE PERSONALIZED MEDICINE BY MEANS OF INTELLIGENT SYSTEMS APPLIED TO DNA SEQUENCES AND MICROARRAYS¿ QUE ESTA SIENDO EJECUTADO EN LA ACTUALIDAD, Y EN EL QUE SE HAN DESARROLLADO HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS CON BUENOS RESULTADOS QUE PERMITIRAN AVANZAR HACIA LA MEDICINA PERSONALIZADA, ESTAS HERRAMIENTAS SERAN INTEGRADAS EN EL PRESENTE PROYECTO,UNO DE LOS RETOS MAS IMPORTANTES A LOS QUE SE ENFRENTA LA COMUNIDAD CIENTIFICA HOY DIA CONSISTE EN DESCIFRAR LOS MECANISMOS GENETICOS QUE PRODUCEN LAS ENFERMEDADES, EL DESCUBRIMIENTO DE LA BASE GENETICA DE LAS ENFERMEDADES SUPONE, EN ULTIMA INSTANCIA, LA IDENTIFICACION DE LOS GENES CUYA DESREGULACION PRODUCE ESA ENFERMEDAD, DESCUBRIMIENTO QUE TRASLADADO AL AMBITO CLINICO PERMITE EL DESARROLLO DE NUEVAS TECNICAS DE PREVENCION, DIAGNOSTICO Y TRATAMIENTO DE LA ENFERMEDAD, UNA DE LAS BASES DE DATOS MAS EXTENDIDAS QUE CONTIENE ASOCIACIONES GEN-ENFERMEDAD ES LA ONLINE MENDELIAN INHERITANCE IN MAN (OMIM) [HAMOSH 2005], SIN EMBARGO, EL VOLUMEN DE CONOCIMIENTO EN LA LITERATURA CRECE A TAL RITMO (PUBMED CONTIENE ACTUALMENTE MAS DE 14 MILLONES DE ARTICULOS INDEXADOS) QUE NO PERMITE QUE LAS BASES DE DATOS AJUSTADAS MANUALMENTE ESTEN ACTUALIZADAS,POR OTRA PARTE, GENES CANDIDATOS A ESTAR INVOLUCRADOS EN UNA ENFERMEDAD PUEDEN OBTENERSE A PARTIR DE CARACTERISTICAS ESTRUCTURALES Y FUNCIONALES DE GENES ASOCIADOS A LA ENFERMEDAD, QUE SE ENCUENTRAN DISPERSAS EN MULTITUD DE FUENTES DE DATOS BIOLOGICAS,LA MAYORIA DE LAS ENFERMEDADES NO ESTAN CAUSADAS POR UN UNICO GEN SINO POR LA INTERACCION DE COMPLEJOS DE GENES, POR TANTO, LAS REDES GENETICAS JUEGAN UN PAPEL FUNDAMENTAL EN EL DESCUBRIMIENTO DE LAS CAUSAS Y LOS MECANISMOS QUE PRODUCEN LAS ENFERMEDADES, LA INVESTIGACION EN REDES DE INTERACCIONES DE GENES (PROTEINAS) ASSOCIADAS CON ENFERMEDADES HA EXPERIMENTADO UN ENORME CRECIMIENTO EN LOS ULTIMOS DOS O TRES AÑOS, EXPLOTANDO LA HIPOTESIS DE BASE DE QUE "GENES DE LA RED QUE SE ENCUENTRAN EN EL VECINDARIO DE UN GEN INVOLUCRADO EN UNA ENFERMEDAD PROBABLEMENTE PARTICIPEN DE LA MISMA ENFERMEDAD U OTRAS RELACIONADAS" [GOH 2007; IDEKER 2008; SCHUSTER 2008],LA INTEGRACION DE CONOCIMIENTO DE DISTINTAS FUENTES BIOLOGICAS DE DATOS (UNIPROT, GO, MICROARRAYS, PUBLISHED LITERATURE, ETC) EN LAS REDES GENETICAS PERMITE EL DESCUBRIMIENTO DE NUEVOS GENES CANDIDATOS A ESTAR INVOLUCRADOS EN LA ENFERMEDAD,EL OBJETIVO PRINCIPAL DE ESTE PROYECTO ES LA IDENTIFICACION DE GENES CANDIDATOS A ESTAR INVOLUCRADOS EN UNA ENFERMEDAD MEDIANTE LA INTEGRACION DE CONOCIMIENTO DE DISTINTAS FUENTES DE DATOS BIOLOGICAS: CONOCIMIENTO PUBLICADO EN LA LITERATURA ESPECIALIZADA, MICROARRAYS, BIO-ONTOLOGIAS Y BASES DE DATOS BIOLOGICAS,ESTE OBJETIVO PUEDE SER DESCOMPUESTO EN LOS SIGUIENTES:1,- DESARROLLO DE UN METODO DE TEXT-MINING PARA IDENTIFICAR RELACIONES GEN-GEN Y GEN-ENFERMEDAD A PARTIR DE TEXTOS BIOMEDICOS,2,- OBTENER REDES DE INTERACCION GENETICA, 3,- ANALIZAR LAS CARACTERISTICAS DE LOS GENES/PROTEINAS DE DIFERENTES FUENTES BIOLOGICAS PARA DEFINIR E INTEGRAR MEDIDAS DE SIMILITUD EN CADA AMBITO,4,- OBTENER UNA LISTA PRIORIZADA DE GENES CANDIDATOS MEDIANTE TECNICAS SUPERVISADAS (CLASIFICADORES BAYESIANOS, SVM) Y SEMI-SUPERVISADAS (TSVM) 5,- OBTENER UNA LISTA PRIORIZADA DE GENES CANDIDATOS MEDIANTE CLASIFICADORES BASADOS EN REGLAS DE ASOCIACION DIFUSAS,6,- DISEÑO DE UN SERVIDOR WEB QUE IMPLEMENTE UN MARCO PARA LA OBTENCION DE LISTAS PRIORIZADAS DE GENES ENFERMEDAD-GEN\TEXT-MINIG\REDES DE GENES\MEDIDAS DIFUSAS\SVM

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