Descripción del proyecto
LOS PERROS SHAR PEI SON UN MODELO EXTRAORDINARIO PARA EL ESTUDIO DE LA RELACION ENTRE GENETICA Y ENFERMEDAD, HACE 3 AÑOS NUESTRO GRUPO INICIO EL ESTUDIO DE LA MUCINOSIS CUTANEA Y DEMOSTRO QUE ERA DEBIDA A UN ACUMULO DE ACIDO HIALURONICO (HA) POR UNA SOBRE-EXPRESION DE LA HAS2, PARALELAMENTE, JUNTO CON EXPERTOS EN GENOMICA CANINA DE LA UNIVERSIDAD DE UPPSALA, SE INICIO EL GENOTIPADO DE SHAR PEIS CON MUCINOSIS/HIALURONOSIS Y SE DETECTO UNA ASOCIACION ENTRE EL CARACTER Y UNA REGION DE HOMOZIGOSIS EN EL CROMOSOMA 13, UNA PRIMERA SECUENCIACION DE ESTA REGION HA DETECTADO UNA VARIACION EN EL NUMERO DE COPIAS (CNV, COPY NUMBER VARIATION) ASOCIADA A LOS DIFERENTES NIVELES SERICOS DE HA,OTRAS 2 ENFERMEDADES GENETICAS DEL SHAR PEI ASOCIADAS A LA MUCINOSIS SON LA AMILOIDOSIS RENAL Y LA FIEBRE RECURRENTE (FRSP), ENFERMEDADES QUE SE HAN CONSIDERADO UN MODELO PARA LA ¿FIEBRE FAMILIAR MEDITERRANEA¿ (FFM) DE LAS PERSONAS, A PARTIR DE ESTA INFORMACION, LAS HIPOTESIS SON: (1) LA HIALURONOSIS ES CONSECUENCIA DE UN CNV EN EL CROMOSOMA 13 (23-24MB) QUE CONDUCE A UNA SOBRE-EXPRESION DEL GEN HAS2 (2) LA FRSP ES UNO DE LOS PROCESOS ¿AUTOINFLAMATORIOS¿ CONSECUENCIA DE UNA ALTERACION EN LA FUNCION REGULADORA DE LA PIRINA, LA AMILOIDOSIS QUE SE PRESENTA EN UNA MINORIA DE CASOS ES UNA DE SUS CONSECUENCIAS, UNA CNV EN CROMOSOMA 6 ES UN CANDIDATO A EXPLICAR LA ENFERMEDAD (3) EXISTE UNA RELACION ENTRE AMBAS ENFERMEDADES (HIALURONOSIS-FRSP),PLAN DE TRABAJO:CARACTERIZACION DE LAS ENFERMEDADES:DETERMINACION DE NIVELES DE HA DE ALTO Y BAJO PM, ECOGRAFIA CUTANEA, CUANTIFICACION POR RT-PCR DE LA EXPRESION DE LOS ENZIMAS DE LA SINTESIS DE HA EN EL PERRO EN BIOPSIAS DE PIEL Y CULTIVOS DE FIBROBLASTOS, EN RELACION A LA FRSP EL TRABAJO DE CARACTERIZACION CONSISTIRA EN : (1) CLINICA Y ANALITICA (2) PROTEINA C REACTIVA (3) IL-6 (4) SAAOBTENCION DE LA COHORTE:SE DISPONE DE MUESTRAS DE 36 SHAR PEIS: 7 SIN HIALURONOSIS (CONTROLES) Y 29 CON DIFERENTES GRADOS DE HIALURONOSIS, SE AUMENTARA EL NUMERO DE MUESTRAS HASTA 75, CON SHAR PEIS SANOS Y CON CASOS EXTREMOS DE HIALURONOSIS, AMILOIDOSIS Y FIEBRE RECURRENTE QUE SERAN CARACTERIZADA SEGUN SE HA DESCRITO PREVIAMENTE,ANALISIS GENETICO DE LA COHORTE:USO DE MICROARRAYS DE ALTA DENSIDAD (CANINE HD, ILLUMINA, 170,000 SNP) JUNTO CON SONDAS ESPECIFICAS PARA DETECTAR LA CNV, ESTUDIO DE ASOCIACION CASO-CONTROL PARA COMPARAR LAS FRECUENCIAS ALELICAS ENTRE CASOS Y CONTROLES (GENOME-WIDE ASSOCIATION STUDY; GWAS), CARACTERIZACION DE LAS REGIONES DE INTERES POR SECUENCIACION MASIVA PARA IDENTIFICAR POLIMORFISMOS ASOCIADOS A LAS ENFERMEDADES (ARRAYS DE CAPTURA DE NIMBLEGEN/ROCHE O GENIOM® BIOCHIP PLATFORM DE FEBIT), ANALISIS DE GENES CANDIDATOS Y DISEÑO DE PCR-CUANTITATIVAS PARA DOSIS GENICA, QUE PERMITAN ASIGNAR EL NUMERO DE COPIAS EN LAS REGIONES DE INTERES Y ESTUDIO DE LA ASOCIACION DEL POLIMORFISMO CNV CON EL NIVEL DE EXPRESION DE LOS GENES CANDIDATOS, DISEÑO DE RT-PCR CUANTITATIVAS PARA DETERMINAR SI LOS NIVELES DE EXPRESION DE LOS GENES MEFV Y TNFR1 DEL CROMOSOMA 6 Y DEL HAS2 EN EL CROMOSOMA 13 ESTAN RELACIONADOS CON EL NUMERO DE COPIAS DE LAS REGIONES POLIMORFICAS DESCRITAS,DEMOSTRACION DE LA RELACION CAUSAL CNV CROMOSOMA 13 DEL PERRO ¿ HAS2- HIALURONOSIS:ESTUDIO EN BIOPSIAS DE PIEL Y EN CULTIVOS DE FIBROBLASTOS DE LA CORRELACION ENTRE CNV (13) LA SOBRE-EXPRESION DE HAS2 (RT-PCR) Y SOBREPRODUCCION DE HA EN EL SOBRENADANTE Y EN LAS CELULAS POR MICROSCOPIA DE FLUORESCENCIA (CAUSALIDAD CNV ¿ HIALURONOSIS),