Descripción del proyecto
EN LA INDUSTRIA PORCINA, AUMENTAR LA SALUD Y EL BIENESTAR DE LOS ANIMALES SIN REDUCIR EL RENDIMIENTO DE LA PRODUCCION, CONTRIBUIRIA A DISMINUIR LA RESISTENCIA A ANTIBIOTICOS Y CONTRIBUIRIA A LA SOSTENIBILIDAD ECONOMICA, AMBIENTAL Y SOCIAL DE LOS SISTEMAS DE PRODUCCION PORCINA, EL PROYECTO METAPIGEN PROPONE UNA INVESTIGACION HOLISTICA SOBRE LA INMUNIDAD Y EL METABOLISMO ENERGETICO EN PORCINO, CON EL OBJETIVO DE IDENTIFICAR REDES GENICAS REGULADORAS, GENES CANDIDATOS Y VARIANTES GENETICAS CAUSALES QUE MODULAN LA INMUNOCOMPETENCIA Y LOS CARACTERES PRODUCTIVOS, EL OBJETIVO DEL PROYECTO TAMBIEN INCLUYE LA VALIDACION FUNCIONAL DE LOS POLIMORFISMOS IDENTIFICADOS, CON LA PERSPECTIVA A LARGO PLAZO DE SELECCIONAR LAS VARIANTES GENETICAS MAS ADECUADAS PARA SER INCLUIDAS EN LOS PROGRAMAS DE SELECCION PORCINA, EL PROYECTO COORDINADO, EN EL QUE PARTICIPAN DOS EQUIPOS DE INVESTIGACION DEL IRTA Y EL CRAG, SUPONE LA CONFLUENCIA Y CONTINUACION DE DOS LINEAS DE INVESTIGACION ACTUALES DE ESTOS GRUPOS, EL EQUIPO CRAG TIENE UNA AMPLIA EXPERIENCIA EN LA APLICACION DE METODOS DE GENETICA MOLECULAR, GENOMICA Y BIOINFORMATICA EN LA MEJORA GENETICA ANIMAL, CON CONTRIBUCIONES CIENTIFICAS PIONERAS EN GENOMICA PORCINA, EL EQUIPO DE CRAG SE CENTRARA EN LA BASE GENETICA DEL METABOLISMO DE LOS LIPIDOS Y LOS CARACTERES DE CALIDAD DE LA CARNE EN LOS CERDOS, TENIENDO EN CUENTA SU IMPACTO SOBRE LA ROBUSTEZ Y LA PRODUCCION, LAS VARIANTES GENETICAS RELEVANTES IDENTIFICADAS EN PROYECTOS ANTERIORES SERAN GENOTIPADAS EN LA POBLACION DE DUROC IMMUPIGEN PARA ESTUDIAR SU SEGREGACION, EN EL MISMO MATERIAL ANIMAL, SE OBTENDRA EL PERFIL DE ACIDOS GRASOS EN LOS TEJIDOS METABOLICOS RELEVANTES: PLASMA, HIGADO, GRASA DORSAL Y GRASA INTRAMUSCULAR, LOS ESTUDIOS DE ASOCIACION ENTRE GENOTIPOS Y CARACTERES PRODUCTIVOS PERMITIRAN LA VALIDACION GENETICA DE ESTOS POLIMORFISMOS, ADEMAS, EL TRANSCRIPTOMA DE HIGADO SE ANALIZARA EN 250 ANIMALES IMMUPIGEN PORQUE ES UN ORGANO CENTRAL INVOLUCRADO EN LA HOMEOSTASIS ENERGETICA Y EL METABOLISMO DE LOS LIPIDOS, EL ANALISIS DE LOS DATOS DEL TRANSCRIPTOMA PROPORCIONARA INFORMACION SOBRE GENES EXPRESADOS DIFERENCIALMENTE, NUEVAS VARIANTES GENETICAS, REGIONES GENOMICAS QUE REGULAN LA EXPRESION GENICA EN HIGADO Y REDES DE EXPRESION GENICA, SE INTEGRARAN DIFERENTES CAPAS DE INFORMACION (FENOTIPOS, TRANSCRIPTOMAS, LIPIDOMAS Y GENOMAS) MEDIANTE ENFOQUES DE BIOLOGIA DE SISTEMAS PARA IDENTIFICAR VIAS METABOLICAS, REGULADORES, BIOMARCADORES, GENES Y POLIMORFISMOS IMPLICADOS EN LA HOMEOSTASIS ENERGETICA Y QUE AFECTAN TANTO A LA SALUD COMO A LOS CARACTERES PRODUCTIVOS, FINALMENTE, SE SELECCIONARA UN PANEL DE POSIBLES VARIANTES GENETICAS CAUSALES EN GENES REGULADORES CLAVE ASOCIADOS CON ESTOS CARACTERES PARA SU VALIDACION FUNCIONAL, LOS METODOS PARA LA VALIDACION FUNCIONAL INCLUIRAN ENSAYOS DE TRANSFECCION CON LUCIFERASA EN CULTIVOS CELULARES, ELISAS PARA MEDIR LA ACTIVIDAD PROTEICA, INMUNOPRECIPITACION DE LA CROMATINA Y EL ESTUDIO DEL EPITRANSCRIPTOMA, COMO RESULTADO, EL PROYECTO METAPIGEN MEJORARA EL ESTADO DE CONOCIMIENTO ACTUAL EN GENETICA PORCINA E INMUNOMETABOLISMO AL DESCIFRAR LA COMPLEJA INTERACCION ENTRE LOS PROCESOS INMUNOLOGICOS Y METABOLICOS, DESCRIBIENDO SUS VINCULOS CAUSALES CON LA SALUD Y LA EFICIENCIA PRODUCTIVA, ADEMAS, EL PROYECTO PROMOVERA LA EFICIENCIA, LA SALUD Y EL BIENESTAR DE LOS CERDOS, OBJETIVOS CON UNA PROBADA RENTABILIDAD ECONOMICA PARA LOS PRODUCTORES Y UNA OPTIMA ACEPTACION SOCIAL, PORCINO\REDES GENICAS\BIOLOGIA DE SISTEMAS\METABOLISMO DE LIPIDOS\HOMEOSTASIS ENERGETICA\CALIDAD DE LA CARNE\ACIDOS GRASOS\GENOMICA\RNA-SEQ\MEJORA GENETICA