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RTI2018-101346-B-I00

Financiado

IDENTIFICACION MEDIANTE SECUENCIACION GENOMICA DE VARIANTES GENETICAS ASOCIADAS...

IDENTIFICACION MEDIANTE SECUENCIACION GENOMICA DE VARIANTES GENETICAS ASOCIADAS CON LA CALIDAD DE LA CARNE Y EL METABOLISMO DE LA GRASA EN CERDOS ESTE PROYECTO PRETENDE EXTENDER (I) EL TRABAJO DE INVESTIGACION COLABORATIVA QUE EL GRUPO HA DESARROLLADO EN GENETICA DE LA CALIDAD DE LA CARNE Y EL METABOLISMO LIPIDICO Y LAS OPORTUNIDADES QUE PRESENTA PARA SELECCION EN CERDOS CO... ver más

01/01/2018

UDL

145K€

Presupuesto del proyecto: 145K€

Líder del proyecto

UNIVERSITAT DE LLEIDA CCT No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Sin perfil tecnológico

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2018-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

UNIVERSITAT DE LLEIDA CCT No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Sin perfil tecnológico

Presupuesto del proyecto 145K€

Descripción del proyecto ESTE PROYECTO PRETENDE EXTENDER (I) EL TRABAJO DE INVESTIGACION COLABORATIVA QUE EL GRUPO HA DESARROLLADO EN GENETICA DE LA CALIDAD DE LA CARNE Y EL METABOLISMO LIPIDICO Y LAS OPORTUNIDADES QUE PRESENTA PARA SELECCION EN CERDOS CON (II) EL GRAN POTENCIAL QUE LA SECUENCIACION DE NUEVA GENERACION OFRECE PARA ANALIZAR LOS MECANISMOS DE CONTROL GENETICO DE LOS PROCESOS BIOLOGICOS, EN PROYECTOS ANTERIORES HEMOS IDENTIFICADO VARIAS VARIANTES GENETICAS ASOCIADAS CON CALIDAD DE LA CARNE Y EL METABOLISMO LIPIDICO, ALGUNOS CON POTENCIAL PARA SU USO EN PROGRAMAS DE MEJORA, PERO AUN QUEDA MUCHA VARIANCIA GENETICA SIN EXPLICAR, AUNQUE LOS PANELES DE GENOTIPADO HAN RESULTADO UTILES EN LAS RAZAS MAS COMUNES EN SISTEMAS DE PRODUCCION INTENSIVOS, PRESENTEN ALGUNAS LIMITACIONES, CON LA LLEGADA DE LA TECNOLOGIA DE SECUENCIACION DE NUEVA GENERACION AHORA ES POSIBLE OBTENER SECUENCIAS COMPLETAS DEL GENOMA A COSTES CADA VEZ INFERIORES, ASI, LA SECUENCIACION SE HA CONVERTIDO EN UN METODO EFICIENTE PARA LA IDENTIFICACION DE NUEVAS VARIANTES, ESPECIALMENTE SI SE REDUCEN COSTES SECUENCIANDO A BAJA COBERTURA, ADEMAS, LA SECUENCIACION PROVEE INFORMACION SOBRE OTRAS FUENTES DE VARIABILIDAD GENETICA, COMO INSERCIONES Y DELECIONES CORTAS QUE PUEDEN MODIFICAR EL MARCO DE LECTURA O VARIANTES ESTRUCTURALES, Y NO SE LIMITA A POSICIONS PRE-DEFINIDAS EN UN PANEL, POR LO QUE POSIBILITA LA DETECCION DE VARIANTES RARAS O ESPECIFICAS DE UNA POBLACION, EN ESTE PROYECTO APLICAREMOS TECNOLOGIA PUNTERA CON UNA ESTRATEGIA DE BAJO COSTE A LA PRODUCCION DE CARNE DE CERDO, EN CONCRETO, SECUENCIAREMOS EL GENOMA COMPLETO DE APROXIMADAMENTE 230 CERDOS A UNA COBERTURA MODERADAMENTE BAJA PARA LA IDENTIFICACION DE VARIANTES (SNPS, INDELS CORTOS) QUE POTENCIALMENTE ESTEN ASOCIADAS CON LA CALIDAD DE LA CARNE Y EL METABOLISMO LIPIDICO Y POSTERIORMENTE VALIDAREMOS ESTAS ASOCIACIONES EN UN NUMERO MUCHO MAYOR DE CERDOS DE UN BANCO BIOLOGICO CON MAS DE 1800 MUESTRAS HISTORICAS REFERENCIADAS CON MAS DE 70 REGISTROS FENOTIPICOS DE CARACTERES DE CALIDAD DE LA CARNE Y RENDIMIENTO, TAMBIEN ANALIZAREMOS SI ES POSIBLE IDENTIFICAR DICHAS ASOCIACIONES MEDIANTE LA COMPARACION DE LOS GENOMAS DE LINEAS GENETICAMENTE DIFERENCIADAS PARA CALIDAD DE LA CARNE, EL PROYECTO RESULTARA EN NUEVAS HERRAMIENTAS PARA LA SELECCION DE CERDOS PARA LA PRODUCCION DE CARNE CON VALOR NUTRICIONAL AÑADIDO Y UNA MAYOR COMPRENSION DE LOS PROCESOS BIOLOGICOS DEL METABOLISMO LIPIDICO, MEJORA ANIMAL\SECUENCIACIÓN\CALIDAD DE LA CARNE\METABOLISMO DE LA GRASA\GENES\SELECCIÓN\PORCINO\GENÓMICA\MARCADORES GENÉTICOS\ÁCIDOS GRASOS

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