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AGL2011-29821-C02-01

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APLICACION DE METODOS DE SECUENCIACION PARALELA MASIVA Y GENOMICA AL ESTUDIO DE...

APLICACION DE METODOS DE SECUENCIACION PARALELA MASIVA Y GENOMICA AL ESTUDIO DE VARIANTES GENICAS QUE REGULAN: CRECIMIENTO, CONFORMACION Y CALIDAD DE LA CARNE EN CERDO LA SELECCION ARTIFICIAL REALIZADA EN ALGUNAS RAZAS COMERCIALES HA INCREMENTADO LA EFICIENCIA EN LA PRODUCCION DE CARNE EN CERDOS. SIN EMBARGO, TAMBIEN HA TENIDO EFECTOS NEGATIVOS SOBRE LAS CARACTERISTICAS SENSORIALES Y TECNOLOGICA... ver más

01/01/2011

UAB

167K€

Presupuesto del proyecto: 167K€

Líder del proyecto

UNIVERSITAT AUTÒNOMA DE BARCELONA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 1265

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2011-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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UAB

Lider

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Líder del proyecto

UNIVERSITAT AUTÒNOMA DE BARCELONA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 1265

Presupuesto del proyecto 167K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto LA SELECCION ARTIFICIAL REALIZADA EN ALGUNAS RAZAS COMERCIALES HA INCREMENTADO LA EFICIENCIA EN LA PRODUCCION DE CARNE EN CERDOS. SIN EMBARGO, TAMBIEN HA TENIDO EFECTOS NEGATIVOS SOBRE LAS CARACTERISTICAS SENSORIALES Y TECNOLOGICAS DE LA CARNE. LA EXCELENTE COMPOSICION DE ACIDOS GRASOS Y CALIDAD DE LA CARNE DEL CERDO IBERICO ESTA, EN CIERTO GRADO, DETERMINADA GENETICAMENTE. EN PROYECTOS PREVIOS UTILIZANDO EL CRUCE EXPERIMENTAL IBERICO X LANDRACE (IBMAP) SE IDENTIFICARON QTLS PARA CRECIMIENTO, FORMA, DEPOSICION DE GRASA Y COMPOSICION DE ACIDOS GRASOS. LOS QTLS MAS RELEVANTES SE LOCALIZAN EN LOS CROMOSOMAS PORCINOS SSC1, SSC4, SSC6, SSC8, SSC10, SSC12, SSC14 AND SSCX. SIN EMBARGO, LA IDENTIFICACION DE GENES Y MUTACIONES CAUSALES DE ESTOS QTLS ES UNA TAREA COMPLEJA. A PESAR DE HABER ANALIZADO DIFERENTES GENES CANDIDATOS POSICIONALES Y POLIMORFISMOS PARA LOS PRINCIPALES QTLS NO SE HAN ENCONTRADO EVIDENCIAS CONCLUYENTES. POR TANTO, EL PRINCIPAL OBJETIVO DEL PRESENTE PROYECTO ES CONTINUAR CON LA IDENTIFICACION Y VALIDACION DE LAS MUTACIONES CAUSALES RESPONSABLES DE ESTOS QTLS DE CARACTERES COMPLEJOS Y ECONOMICAMENTE RELEVANTES. PARA ELLO, SE UTILIZARAN NUEVAS METODOLOGIAS DE GENOMICA Y DE SECUENCIACION PARALELA MASIVA. PARA ALCANZAR ESTE OBJETIVO SE PROPONE UN PROYECTO COORDINADO QUE UNE LOS ESFUERZOS Y CONOCIMIENTOS DE DOS GRUPOS DE INVESTIGACION: LA UNIVERSIDAD AUTONOMA DE BARCELONA (SUBPROYECTO 1) Y EL INSTITUTO NACIONAL DE INVESTIGACION Y TECNOLOGIA AGRARIA Y ALIMENTARIA (SUBPROYECTO 2).LOS PRINCIPALES OBJETIVOS DEL SUBPROYECTO 1 SON:1. DESCRIPCION DE LA VARIABILIDAD GENETICA (SNPS Y VARIANTES ESTRUCTURALES) QUE SEGREGA EN EL CRUCE IBMAP MEDIANTE LA SECUENCIACION PARALELA MASIVA DE LOS ANIMALES FUNDADORES DE ESTA POBLACION.2. CARACTERIZACION Y VALIDACION DE CNVRS PORCINOS Y ESTUDIO DE SU EFECTO SOBRE LA VARIACION DE CARACTERES ECONOMICAMENTE RELEVANTES.3. IDENTIFICACION MEDIANTE LA SECUENCIACION PARALELA MASIVA DE RNA DE GENES Y TRANSCRITOS DIFERENCIALMENTE EXPRESADOS EN EL HIGADO Y TEJIDO ADIPOSO DE ANIMALES CON FENOTIPOS EXTREMOS PARA CRECIMIENTO Y COMPOSICION DE ACIDOS GRASOS.4. MAPEO FINO DE LOS QTLS LOCALIZADOS EN LOS CROMOSOMAS SSC1, SSC4, SSC8 Y SSCX MEDIANTE EL GENOTIPADO DE LOS ANIMALES DEL CRUCE IBMAP CON UN CHIP DE SNPS ESPECIFICO Y DE ALTA INFORMATIVIDAD.5. IDENTIFICACION Y VALIDACION DE GENES CANDIDATOS Y VARIANTES GENETICAS PARA ESTOS QTLS.EL CONOCIMIENTO DE LOS GENES Y VARIANTES GENETICAS IMPLICADAS EN LA VARIACION DE ESTOS CARACTERES PUEDE SER DE GRAN AYUDA EN EL DISEÑO DE MEJORES ESTRATEGIAS DE SELECCION Y TENER UN IMPACTO ECONOMICO IMPORTANTE EN LA PRODUCCION PORCINA. ORCINO\QTL\ACIDOS GRASOS\RNA-SEQ\IBERICO\NGS\SNPS\TRANSCRIPTOMA\GENOMICA

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