Descripción del proyecto
ESTA PROPUESTA SE CENTRA EN LOS PROCESOS Y ESTRATEGIAS DE INTERACCION CON LA CELULA POR PARTE DEL VIRUS DE LA PESTE PORCINA AFRICANA (VPPA), QUE PUEDEN SER COMUNES A DIVERSOS VIRUS. EL ANALISIS SIMULTANEO DE VARIABLES DE LA CELULA HUESPED Y EL VIRUS PARA CONSEGUIR UNA MEJOR COMPRENSION DEL PROCESO DE INFECCION, LAS CUALES, PUEDEN ABRIR NUEVOS CAMINOS PARA DESARROLLAR ESTRATEGIAS DE PREVENCION Y TRATAMIENTO. EN EL PROYECTO ANTERIOR IDENTIFICAMOS UNA DIANA MOLECULAR EN EL ENDOSOMA, NECESARIA PARA LA ENTRADA Y FUSION DEL VPPA, DETERMINANDO LA INTERACCION DE DOS PROTEINAS LOCALIZADAS EN MEMBRANA INTERNA DEL VIRION CON UNA DIANA MOLECULAR LLAMADA NIEMANN-PICK C1 (NPC1). ESTA MOLECULA HABIA SIDO DESCRITA COMO NECESARIA PARA EL ESCAPE ENDOSOMAL DEL VIRUS EBOLA (EBOV), Y PROBABLEMENTE DE OTROS, COMO TAMBIEN HEMOS PODIDO IDENTIFICAR RECIENTEMENTE PARA EL SARS-COV-2. SE TRATA DE UN RECEPTOR DE LA MEMBRANA ENDOSOMAL ENCARGADO DEL FLUJO DE COLESTEROL HACIA EL CITOPLASMA, COMPROBANDO QUE ES NECESARIO PARA EL PROCESO DE SALIDA DEL ENDOSOMA DEL VPPA MEDIANTE FUSION. ADEMAS, OTRO FILOVIRUS, EL VIRUS DE LASSA, DEPENDE DE OTRA MOLECULA DEL ENDOSOMA, LAMP1, PARA SU ENTRADA. COMPUESTOS ANTIVIRALES DESARROLLADOS FRENTE A LA INTERACCION DE LA GLICOPROTEINA DE EBOV CON EL DOMINIO C DE NPC1 ERAN CAPACES DE INHIBIR LA INFECCION DE ESTOS TRES VIRUS, CONVIRTIENDOSE EN UNA DIANA PREVENTIVA Y TERAPEUTICA PROMETEDORA PARA COMBATIR ESTAS INFECCIONES. ADEMAS, DEMOSTRAMOS QUE OTROS COMPUESTOS INHIBIDORES DE MOLECULAS DE LA MEMBRANA ENDOSOMAL, COMO LOS CANALES DE CALCIO, TAMBIEN INHIBEN LA INFECCION DE LOS 3 PATOGENOS. EN EL PRESENTE PROYECTO VAMOS A AMPLIAR ESTA ESTRATEGIA A OTRAS PROTEINAS IMPLICADAS EN LA ENTRADA/FUSION DEL VPPA (UN TOTAL DE 11 PROTEINAS), OBTENIENDO UNA VISION GENERAL QUE NOS PERMITA ESTUDIAR EL CONJUNTO DE LAS VIAS MOLECULARES, MODULOS FUNCIONALES Y SISTEMAS CELULARES IMPLICADOS EN LOS ESTADIOS DE INFECCION TEMPRANA POR EL VPPA. PARA ELLO UTILIZAREMOS TECNICAS OMICAS QUE NOS PERMITAN, POR UN LADO, IDENTIFICAR LAS PROTEINAS CELULARES IMPLICADAS EN LA INFECCION, Y POR OTRO, UNA JERARQUIZACION Y ORGANIZACION DE ESOS DATOS EN CATEGORIAS Y SISTEMAS. SELECCIONAREMOS DIANAS PARA DESARROLLAR ANTIVIRALES Y COMPROBAR SU POTENCIAL INHIBIDOR SOBRE LA INFECTIVIDAD Y LA REPLICACION VIRALES, Y GENERAREMOS LINEAS CELULARES CARENTES DE ALGUNOS DE LOS GENES IDENTIFICADOS COMO CRUCIALES PARA LA INFECCION. COMO RESULTADO DEL PROYECTO SE OBTENDRAN CANDIDATOS VACUNALES, COMPUESTOS ANTIVIRALES Y LINEAS CELULARES POTENCIALMENTE RESISTENTES AL VIRUS. SE DEFINIRAN LOS MODULOS Y SISTEMAS CELULARES INTERFERIDOS POR EL VPPA DURANTE LA INFECCION, AQUELLOS REQUERIDOS PARA LA REPLICACION DEL VIRUS Y LOS PRINCIPALES MECANISMOS DE EVASION DEL SISTEMA INMUNE DESARROLLADOS POR EL MISMO. SE ORGANIZARAN LAS DIANAS CELULARES IDENTIFICADAS EN UN CONJUNTO DE DATOS ORGANIZADOS Y ACCESIBLES A TRAVES DEL REPOSITORIO INSTITUCIONAL DEL CSIC. SE IDENTIFICARAN DIANAS MOLECULARES COMUNES A VARIOS MODELOS VIRICOS ESPECIALMENTE AQUELLOS DE ALTA PATOGENICIDAD Y SE COMPROBARA EL EFECTO DE LOS ANTIVIRALES DE AMPLIO ESPECTRO. NTERACCION VIRUS-HUESPED\TRANSCRIPTOMICA\PROTEOMICA